More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0894 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0894  amidase  100 
 
 		 464 aa  894    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0315634 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3666  amidase  67.68 
 
 		 466 aa  591  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1896  amidase  66.88 
 
 		 465 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3471  amidase  66.45 
 
 		 465 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4149  amidase  66.52 
 
 		 465 aa  571  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.706387  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2627  amidase  63.85 
 
 		 466 aa  550  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3512  amidase  64.76 
 
 		 466 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6296  amidase  63.99 
 
 		 464 aa  541  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4006  amidase  64.32 
 
 		 466 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.525066  normal  0.419879 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5269  amidase  63.28 
 
 		 467 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357153  normal  0.248065 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1407  amidase  64.24 
 
 		 473 aa  534  1e-150  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3449  amidase  63.28 
 
 		 467 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0413  amidase  61.74 
 
 		 466 aa  514  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7676  amidase  49.25 
 
 		 471 aa  361  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616001  normal  0.331249 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6669  amidase  49.25 
 
 		 478 aa  360  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.654652  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6072  amidase  48.41 
 
 		 471 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3556  amidase  49.25 
 
 		 473 aa  332  8e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2400  indoleacetamide hydrolase  46.53 
 
 		 467 aa  317  4e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3411  amidase  40.5 
 
 		 499 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1577  amidase  41.27 
 
 		 478 aa  276  5e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2081  amidase  45.2 
 
 		 524 aa  276  8e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1619  amidase  43.49 
 
 		 485 aa  270  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.445224  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1649  amidase  39.29 
 
 		 469 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0982  indoleacetamide hydrolase  41.56 
 
 		 470 aa  238  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.682972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0468  amidase  41.37 
 
 		 438 aa  218  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0410275  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  37.37 
 
 		 473 aa  205  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  36.18 
 
 		 472 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7198  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  35.7 
 
 		 461 aa  182  8.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  33.04 
 
 		 477 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  44.17 
 
 		 494 aa  177  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  43.75 
 
 		 494 aa  177  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  44.17 
 
 		 494 aa  176  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  34.77 
 
 		 472 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  33.26 
 
 		 474 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  33.19 
 
 		 466 aa  170  6e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3827  amidase  30.21 
 
 		 495 aa  169  8e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  42.5 
 
 		 494 aa  168  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.98 
 
 		 485 aa  167  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  34.72 
 
 		 469 aa  166  9e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  41.67 
 
 		 494 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  41.67 
 
 		 494 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  41.67 
 
 		 494 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  33.48 
 
 		 475 aa  161  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1252  amidase  41.91 
 
 		 477 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4870  Amidase  34.48 
 
 		 473 aa  160  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0983  amidase  33.84 
 
 		 485 aa  158  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  31.28 
 
 		 480 aa  157  6e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1671  amidase  32.51 
 
 		 482 aa  156  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  41.42 
 
 		 496 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20980  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  34.15 
 
 		 479 aa  154  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.705121  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  35.9 
 
 		 458 aa  153  8e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3206  amidase  29.22 
 
 		 468 aa  151  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.829044  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2304  hypothetical protein  29.82 
 
 		 469 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1096  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.55 
 
 		 489 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0691  amidase  33.11 
 
 		 505 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.771388  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2277  hypothetical protein  30.33 
 
 		 469 aa  148  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2120  Amidase  36.5 
 
 		 447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1493  amidase  35.28 
 
 		 468 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.710832  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0152  amidase  30.84 
 
 		 471 aa  146  9e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  34.53 
 
 		 463 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1324  amidase  43.1 
 
 		 484 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.668427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  40.59 
 
 		 494 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0111  Amidase  33.76 
 
 		 459 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542197  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  25.05 
 
 		 485 aa  145  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4989  Amidase  37.47 
 
 		 472 aa  145  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0458  Amidase  29.89 
 
 		 549 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.64 
 
 		 491 aa  144  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1157  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.83 
 
 		 491 aa  143  5e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0758245  normal  0.786366 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1679  amidase  32.15 
 
 		 500 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.85 
 
 		 480 aa  143  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3821  amidase  32.92 
 
 		 467 aa  143  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2009  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  32.86 
 
 		 487 aa  143  8e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4260  amidase  32.75 
 
 		 471 aa  143  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.016839  hitchhiker  0.000222937 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1754  putative amidase  31.8 
 
 		 471 aa  142  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0653  putative amidase  31.74 
 
 		 469 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0659  putative amidase  31.15 
 
 		 469 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1486  amidase  43.51 
 
 		 497 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.44531  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1838  amidase  31.63 
 
 		 477 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.942234  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0613  putative amidase  31.74 
 
 		 469 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1320  amidase  42.68 
 
 		 497 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.257142  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2509  amidase  42.68 
 
 		 546 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124724  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0990  amidase  42.68 
 
 		 484 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  32.63 
 
 		 495 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0577  amidase  42.68 
 
 		 484 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1252  amidase  42.68 
 
 		 484 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0302  amidase  42.68 
 
 		 484 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.551995  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3216  amidase  35.73 
 
 		 478 aa  141  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3058  amidase  30.59 
 
 		 467 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.732853 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1519  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.39 
 
 		 491 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000900882  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  28.57 
 
 		 470 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2402  amidase  32.7 
 
 		 492 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.574141  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0230  amidase  33.53 
 
 		 498 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.817663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  28.94 
 
 		 470 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.57 
 
 		 486 aa  140  6e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1900  amidase  32.54 
 
 		 490 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3629  amidase  32.24 
 
 		 477 aa  140  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1681  amidase  46.41 
 
 		 480 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4261  Amidase  37.45 
 
 		 475 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.643604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4797  putative amidase  32.15 
 
 		 498 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2877  putative amidotransferase  32.83 
 
 		 473 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133365  normal  0.0420813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>