More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2400 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2400  indoleacetamide hydrolase  100 
 
 		 467 aa  940    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7676  amidase  49.46 
 
 		 471 aa  385  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616001  normal  0.331249 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6669  amidase  50.64 
 
 		 478 aa  378  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.654652  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6072  amidase  51.17 
 
 		 471 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3556  amidase  50.66 
 
 		 473 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3666  amidase  46.77 
 
 		 466 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4006  amidase  45.27 
 
 		 466 aa  353  5e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.525066  normal  0.419879 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3512  amidase  45.27 
 
 		 466 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4149  amidase  45.57 
 
 		 465 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.706387  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3471  amidase  44.9 
 
 		 465 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0894  amidase  46.53 
 
 		 464 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0315634 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2627  amidase  43.74 
 
 		 466 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1896  amidase  44.61 
 
 		 465 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2081  amidase  45.73 
 
 		 524 aa  334  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1577  amidase  45.39 
 
 		 478 aa  331  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5269  amidase  43.36 
 
 		 467 aa  329  7e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357153  normal  0.248065 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3411  amidase  42.4 
 
 		 499 aa  322  9.999999999999999e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0413  amidase  46.42 
 
 		 466 aa  320  5e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3449  amidase  43.36 
 
 		 467 aa  319  7e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6296  amidase  43.72 
 
 		 464 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1407  amidase  45.42 
 
 		 473 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1619  amidase  44.27 
 
 		 485 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.445224  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0468  amidase  48.37 
 
 		 438 aa  291  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0410275  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0982  indoleacetamide hydrolase  43.84 
 
 		 470 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.682972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1649  amidase  42.18 
 
 		 469 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  40.79 
 
 		 473 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  35.36 
 
 		 475 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  37.04 
 
 		 475 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  35.07 
 
 		 477 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  35.91 
 
 		 474 aa  206  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  35.01 
 
 		 472 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  34.83 
 
 		 472 aa  204  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3821  amidase  36.59 
 
 		 467 aa  192  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5623  Amidase  34.59 
 
 		 492 aa  187  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4797  putative amidase  36.11 
 
 		 498 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  35.01 
 
 		 458 aa  185  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20980  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  35.13 
 
 		 479 aa  184  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.705121  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0111  Amidase  36.48 
 
 		 459 aa  183  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542197  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  34.11 
 
 		 496 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2535  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.9 
 
 		 482 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7198  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  34.32 
 
 		 461 aa  180  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  33.19 
 
 		 466 aa  179  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3206  amidase  30.54 
 
 		 468 aa  179  8e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.829044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1096  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.4 
 
 		 489 aa  178  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4261  Amidase  32.77 
 
 		 475 aa  178  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.643604 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.45 
 
 		 485 aa  177  3e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0983  amidase  33.81 
 
 		 485 aa  177  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  33.54 
 
 		 494 aa  177  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  33.54 
 
 		 494 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  33.61 
 
 		 494 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  35.34 
 
 		 495 aa  177  5e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  33.83 
 
 		 494 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0497  Amidase  35.31 
 
 		 481 aa  176  8e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112236  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2009  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  31.68 
 
 		 487 aa  176  9e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  33.4 
 
 		 494 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0230  amidase  35.98 
 
 		 498 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.817663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  33.4 
 
 		 494 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  33.4 
 
 		 494 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  32.49 
 
 		 480 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0428  putative amidase  35.83 
 
 		 474 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4787  amidase  33.94 
 
 		 505 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.383486 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  32.99 
 
 		 494 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2569  amidase family protein  32.98 
 
 		 507 aa  173  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111289  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4217  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.33 
 
 		 483 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4260  amidase  35.59 
 
 		 471 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.016839  hitchhiker  0.000222937 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  31.21 
 
 		 469 aa  172  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2260  amidase  32.77 
 
 		 507 aa  171  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172416  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4989  Amidase  36.36 
 
 		 472 aa  171  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0691  amidase  34.22 
 
 		 505 aa  171  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.771388  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3503  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.43 
 
 		 486 aa  169  7e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0709633 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1251  amidase  32.33 
 
 		 466 aa  169  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406774  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0721  glutamyl-tRNA, putative  30.59 
 
 		 534 aa  169  9e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2170  Amidase  33.2 
 
 		 487 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3827  amidase  29.49 
 
 		 495 aa  168  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  34.86 
 
 		 490 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2709  amidase  34.79 
 
 		 490 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4870  Amidase  34.75 
 
 		 473 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0041  Amidase  30.54 
 
 		 483 aa  167  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  35.28 
 
 		 463 aa  167  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  33.75 
 
 		 463 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2120  Amidase  34.46 
 
 		 447 aa  167  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2535  amidase  32.53 
 
 		 501 aa  167  5e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0740516  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4065  amidase  35.41 
 
 		 468 aa  167  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1170  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.3 
 
 		 479 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0245  amidase  31.99 
 
 		 495 aa  166  9e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1714  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.2 
 
 		 504 aa  166  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.281872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  34.35 
 
 		 463 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3768  amidase  31.34 
 
 		 498 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.30926  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.6 
 
 		 485 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0436  putative amidase  34.19 
 
 		 471 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258075  normal  0.851149 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3815  amidase  32.78 
 
 		 471 aa  164  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000420509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2394  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.88 
 
 		 516 aa  164  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.225489  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4434  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  29.55 
 
 		 486 aa  164  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.689377  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1493  amidase  35.76 
 
 		 468 aa  164  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.710832  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0697  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.91 
 
 		 505 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  30.54 
 
 		 470 aa  163  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0458  Amidase  30.74 
 
 		 549 aa  163  7e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2838  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.99 
 
 		 501 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0151  Amidase  34.32 
 
 		 475 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0264  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.23 
 
 		 486 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>