More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2120 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2120  Amidase  100 
 
 
447 aa  871    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4261  Amidase  37.55 
 
 
475 aa  272  7e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.643604 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2304  hypothetical protein  36.03 
 
 
469 aa  232  9e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  36.67 
 
 
472 aa  231  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2277  hypothetical protein  36.03 
 
 
469 aa  227  3e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1350  amidase  36.57 
 
 
446 aa  223  4.9999999999999996e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.149618  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1685  amidase  37.12 
 
 
466 aa  217  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  36.81 
 
 
475 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  38.03 
 
 
473 aa  212  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20980  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  37.66 
 
 
479 aa  208  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.705121  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  33.9 
 
 
477 aa  206  6e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4838  Amidase  48.99 
 
 
469 aa  205  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  38.34 
 
 
463 aa  203  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  35.16 
 
 
463 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  34.75 
 
 
472 aa  197  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  36.14 
 
 
463 aa  195  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  36.04 
 
 
480 aa  194  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  35.39 
 
 
494 aa  193  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1649  amidase  35.46 
 
 
469 aa  193  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  33.97 
 
 
474 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  35.6 
 
 
494 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  33.4 
 
 
464 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  35.01 
 
 
495 aa  186  9e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  34.28 
 
 
494 aa  186  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4870  Amidase  34.02 
 
 
473 aa  186  9e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  34.28 
 
 
494 aa  186  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  34.28 
 
 
494 aa  186  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  33.74 
 
 
494 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  35.52 
 
 
466 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  33.06 
 
 
494 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2155  amidohydrolase, AtzE family  33.33 
 
 
457 aa  183  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.83401 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.65 
 
 
485 aa  182  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4203  amidase  32.48 
 
 
462 aa  181  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.742932  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  34.87 
 
 
490 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4139  amidase  36.32 
 
 
483 aa  180  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3503  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.07 
 
 
486 aa  180  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0709633 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0798  amidase  33.97 
 
 
485 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.623196  normal  0.286428 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0495  amidase  34.41 
 
 
505 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52997  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1251  amidase  31.79 
 
 
466 aa  177  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406774  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.96 
 
 
475 aa  176  8e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0058  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.62 
 
 
494 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0982  indoleacetamide hydrolase  35.22 
 
 
470 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.682972  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.67 
 
 
475 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2536  Amidase  33.48 
 
 
473 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3411  amidase  34.42 
 
 
499 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0697  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.61 
 
 
505 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4065  amidase  34.85 
 
 
468 aa  174  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.62 
 
 
485 aa  173  5e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.57 
 
 
480 aa  173  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2709  amidase  34.03 
 
 
490 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  35.15 
 
 
461 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0577  amidase  34.41 
 
 
484 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0990  amidase  34.41 
 
 
484 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1486  amidase  33.47 
 
 
497 aa  172  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.44531  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0302  amidase  34.41 
 
 
484 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.551995  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1320  amidase  34.41 
 
 
497 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.257142  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3768  amidase  34.32 
 
 
498 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.30926  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2509  amidase  34.41 
 
 
546 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124724  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1252  amidase  34.41 
 
 
484 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0428  putative amidase  34.19 
 
 
474 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154682  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1681  amidase  36.17 
 
 
480 aa  171  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1324  amidase  34.41 
 
 
484 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.668427  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1679  amidase  33.47 
 
 
500 aa  171  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2012  amidase  35.52 
 
 
471 aa  170  5e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0494879  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.68 
 
 
483 aa  169  7e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4797  putative amidase  34.17 
 
 
498 aa  169  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199104  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  33.33 
 
 
475 aa  169  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2170  Amidase  32.03 
 
 
487 aa  169  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3826  amidase  33.68 
 
 
509 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2569  amidase family protein  33.05 
 
 
507 aa  167  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111289  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4427  amidase  36.4 
 
 
470 aa  167  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1951  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.68 
 
 
490 aa  167  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735841  normal  0.759727 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3821  amidase  35.64 
 
 
467 aa  167  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7676  amidase  36.32 
 
 
471 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616001  normal  0.331249 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2947  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.06 
 
 
487 aa  166  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15821  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.17 
 
 
486 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2627  amidase  36.93 
 
 
466 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1157  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.59 
 
 
491 aa  166  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0758245  normal  0.786366 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1500  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  32.71 
 
 
476 aa  165  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0473179 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2260  amidase  32.41 
 
 
507 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172416  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0458  Amidase  30.93 
 
 
549 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  27.1 
 
 
486 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1693  amidase  35.59 
 
 
471 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.070698 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5240  putative amidase  43.67 
 
 
485 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.273599 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1458  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.23 
 
 
488 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2578  amidase  32.02 
 
 
483 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.06158 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1900  amidase  34.68 
 
 
490 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0653  putative amidase  34.02 
 
 
469 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1411  Amidase  32.03 
 
 
491 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.440545 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0230  amidase  34.92 
 
 
498 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.817663  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1220  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.06 
 
 
491 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.82883  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0761  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.19 
 
 
486 aa  163  6e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2009  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  32.51 
 
 
487 aa  163  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.2 
 
 
486 aa  163  7e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.41 
 
 
485 aa  162  9e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0497  Amidase  34.62 
 
 
481 aa  162  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112236  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3827  amidase  30.77 
 
 
495 aa  162  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0540  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.92 
 
 
488 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732053  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  28.27 
 
 
470 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4054  amidase  34.9 
 
 
467 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200253  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>