More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5240 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5240  putative amidase  100 
 
 		 485 aa  975    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.273599 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7092  amidase  46.67 
 
 		 485 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1679  amidase  42.36 
 
 		 500 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0798  amidase  42.94 
 
 		 485 aa  316  7e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.623196  normal  0.286428 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1900  amidase  43.7 
 
 		 490 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7130  amidase  41.92 
 
 		 489 aa  303  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13196  amidase  40.33 
 
 		 495 aa  288  1e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.471153 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0691  amidase  41 
 
 		 505 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.771388  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4139  amidase  40.51 
 
 		 483 aa  281  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1302  amidase  40.16 
 
 		 477 aa  271  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2578  amidase  41.67 
 
 		 483 aa  267  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.06158 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0495  amidase  39.62 
 
 		 505 aa  266  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3620  amidase  38.52 
 
 		 473 aa  240  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3768  amidase  36.42 
 
 		 498 aa  236  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.30926  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5248  Amidase  40.36 
 
 		 457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000283595  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  31.05 
 
 		 477 aa  209  9e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1350  amidase  29.31 
 
 		 446 aa  199  9e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.149618  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  33.68 
 
 		 472 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4261  Amidase  29.18 
 
 		 475 aa  193  6e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.643604 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  31.93 
 
 		 472 aa  193  8e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  32.85 
 
 		 494 aa  192  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1649  amidase  32.2 
 
 		 469 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.98 
 
 		 486 aa  190  5.999999999999999e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  28.57 
 
 		 486 aa  189  7e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  35.67 
 
 		 463 aa  189  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.77 
 
 		 486 aa  188  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.83 
 
 		 485 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1685  amidase  34.02 
 
 		 466 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4870  Amidase  34.37 
 
 		 473 aa  182  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  32.57 
 
 		 475 aa  182  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.34 
 
 		 484 aa  179  7e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.14 
 
 		 485 aa  178  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  31.67 
 
 		 494 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  31.67 
 
 		 494 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  31.6 
 
 		 494 aa  177  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2653  Amidase  26.67 
 
 		 450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4838  Amidase  30.5 
 
 		 469 aa  172  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2120  Amidase  34.56 
 
 		 447 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1103  amidase  34.05 
 
 		 472 aa  171  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2304  hypothetical protein  28.97 
 
 		 469 aa  171  3e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  24.6 
 
 		 483 aa  171  4e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1838  amidase  32.79 
 
 		 477 aa  170  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.942234  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2277  hypothetical protein  29.17 
 
 		 469 aa  170  6e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3411  amidase  30 
 
 		 499 aa  170  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  31.55 
 
 		 490 aa  169  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  30.98 
 
 		 494 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0761  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.95 
 
 		 486 aa  169  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2436  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  26.43 
 
 		 486 aa  169  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  30.98 
 
 		 494 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  30.98 
 
 		 494 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1658  amidase  33.12 
 
 		 507 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2709  amidase  31.34 
 
 		 490 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  30.16 
 
 		 470 aa  167  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2535  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.64 
 
 		 482 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.98 
 
 		 475 aa  167  5e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1096  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.08 
 
 		 489 aa  167  5.9999999999999996e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2402  amidase  33.33 
 
 		 492 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.574141  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0322  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.63 
 
 		 497 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2260  amidase  32.24 
 
 		 507 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172416  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2751  amidase  32.44 
 
 		 485 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0697  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.53 
 
 		 505 aa  161  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2569  amidase family protein  31.99 
 
 		 507 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111289  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2636  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.89 
 
 		 483 aa  161  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1293  amidase  29.64 
 
 		 485 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0666673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1671  amidase  31.78 
 
 		 482 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.24 
 
 		 483 aa  161  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  30.56 
 
 		 463 aa  160  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  31.11 
 
 		 466 aa  160  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3827  amidase  29.42 
 
 		 495 aa  160  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  27.09 
 
 		 491 aa  160  6e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4797  putative amidase  32.92 
 
 		 498 aa  160  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02330  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.32 
 
 		 477 aa  159  7e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.313614  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2609  amidase  31.59 
 
 		 485 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.369685 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3826  amidase  32.02 
 
 		 509 aa  159  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1933  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.72 
 
 		 474 aa  158  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.129092  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4462  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.91 
 
 		 481 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956052  normal  0.365252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  30.58 
 
 		 496 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3644  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.9 
 
 		 508 aa  158  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  29.2 
 
 		 494 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1493  amidase  35.73 
 
 		 468 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.710832  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6043  Amidase  32.3 
 
 		 471 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.420135  normal  0.212505 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2551  amidase  31.16 
 
 		 485 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4217  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.59 
 
 		 483 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4006  amidase  33.48 
 
 		 466 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.525066  normal  0.419879 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0540  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.25 
 
 		 488 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732053  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0287  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.12 
 
 		 486 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000251975  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2464  amidase  32.06 
 
 		 494 aa  156  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1411  Amidase  29.42 
 
 		 491 aa  156  7e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440545 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2877  putative amidotransferase  30.74 
 
 		 473 aa  156  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133365  normal  0.0420813 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0098  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.2 
 
 		 485 aa  156  9e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7676  amidase  32.22 
 
 		 471 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616001  normal  0.331249 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4434  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A  28.48 
 
 		 486 aa  155  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.689377  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0058  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  27.31 
 
 		 494 aa  155  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3512  amidase  32.97 
 
 		 466 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0576  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.24 
 
 		 485 aa  154  2.9999999999999998e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.558849  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1541  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  26.76 
 
 		 486 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.859243  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.4 
 
 		 485 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1213  amidase  31.39 
 
 		 471 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2341  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.47 
 
 		 485 aa  154  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.46 
 
 		 480 aa  154  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>