More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1685 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1685  amidase  100 
 
 
466 aa  951    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2304  hypothetical protein  34.67 
 
 
469 aa  243  7e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2120  Amidase  36.97 
 
 
447 aa  241  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2277  hypothetical protein  34.88 
 
 
469 aa  241  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4261  Amidase  34.77 
 
 
475 aa  229  6e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.643604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4838  Amidase  36.66 
 
 
469 aa  223  7e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1350  amidase  32.76 
 
 
446 aa  221  3e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.149618  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3411  amidase  32.44 
 
 
499 aa  218  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  30.85 
 
 
477 aa  216  7e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  33.05 
 
 
475 aa  210  5e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  32.07 
 
 
472 aa  207  4e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1900  amidase  35.77 
 
 
490 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1679  amidase  35.64 
 
 
500 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  34.84 
 
 
463 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1649  amidase  33.61 
 
 
469 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  30.84 
 
 
472 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1340  Amidase  30.98 
 
 
470 aa  195  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000104269  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  31.2 
 
 
474 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  32.49 
 
 
473 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5240  putative amidase  32.73 
 
 
485 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.273599 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  32.27 
 
 
490 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  32.42 
 
 
480 aa  190  5.999999999999999e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  31.62 
 
 
470 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  32.98 
 
 
466 aa  189  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0982  indoleacetamide hydrolase  31.79 
 
 
470 aa  188  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.682972  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4139  amidase  33.77 
 
 
483 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0458  Amidase  31.3 
 
 
549 aa  186  8e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1252  amidase  34.35 
 
 
477 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2578  amidase  34.05 
 
 
483 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.06158 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2709  amidase  31.85 
 
 
490 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.23 
 
 
485 aa  184  3e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0798  amidase  30.99 
 
 
485 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.623196  normal  0.286428 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2170  Amidase  32.48 
 
 
487 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1838  amidase  31.78 
 
 
477 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.942234  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2081  amidase  33.91 
 
 
524 aa  181  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7130  amidase  33 
 
 
489 aa  180  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  30.96 
 
 
494 aa  179  9e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  31.24 
 
 
495 aa  177  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1302  amidase  31.76 
 
 
477 aa  177  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1251  amidase  30.24 
 
 
466 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406774  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  31.48 
 
 
494 aa  177  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2877  putative amidotransferase  30.85 
 
 
473 aa  176  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133365  normal  0.0420813 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.35 
 
 
485 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20980  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  31.94 
 
 
479 aa  175  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.705121  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3826  amidase  31.37 
 
 
509 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  31.33 
 
 
494 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  31.33 
 
 
494 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  31.33 
 
 
494 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  30.67 
 
 
494 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  30.72 
 
 
494 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1934  Amidase  31.06 
 
 
477 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000185189  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0428  putative amidase  31.83 
 
 
474 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154682  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3629  amidase  30.97 
 
 
477 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.38 
 
 
479 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1453  Amidase  29.88 
 
 
494 aa  170  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830679  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6669  amidase  32.47 
 
 
478 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.654652  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2569  amidase family protein  31.77 
 
 
507 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111289  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3503  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.28 
 
 
486 aa  168  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0709633 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.06 
 
 
483 aa  168  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0721  glutamyl-tRNA, putative  30.69 
 
 
534 aa  168  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4870  Amidase  32.42 
 
 
473 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.44 
 
 
483 aa  167  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.42 
 
 
491 aa  167  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0691  amidase  32.39 
 
 
505 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.771388  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2260  amidase  32.12 
 
 
507 aa  167  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172416  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1411  Amidase  30.58 
 
 
491 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.440545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4462  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.85 
 
 
481 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956052  normal  0.365252 
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.06 
 
 
486 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  26.67 
 
 
486 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0729  putative amidase  32.61 
 
 
471 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.498562  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0111  Amidase  29.32 
 
 
459 aa  163  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542197  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  29.91 
 
 
461 aa  163  6e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  31.15 
 
 
463 aa  163  8.000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  28.6 
 
 
475 aa  163  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1493  amidase  33.26 
 
 
468 aa  162  9e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.710832  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2168  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.84 
 
 
485 aa  162  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4989  Amidase  34.17 
 
 
472 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0653  putative amidase  33.4 
 
 
469 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  32.2 
 
 
469 aa  161  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.63 
 
 
475 aa  162  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0983  amidase  29.57 
 
 
485 aa  161  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  31.69 
 
 
458 aa  162  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0613  putative amidase  33.4 
 
 
469 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.52 
 
 
486 aa  160  4e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6043  Amidase  31.57 
 
 
471 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.420135  normal  0.212505 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1360  amidase  30.65 
 
 
466 aa  159  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000267228  hitchhiker  0.0000102639 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3620  amidase  31.04 
 
 
473 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2636  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.24 
 
 
483 aa  159  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1453  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.96 
 
 
477 aa  159  1e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.67645  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1671  amidase  29.79 
 
 
482 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677063  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2653  Amidase  29.31 
 
 
450 aa  158  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1658  amidase  32.15 
 
 
507 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  30.19 
 
 
461 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0659  putative amidase  33.05 
 
 
469 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2400  indoleacetamide hydrolase  34.07 
 
 
467 aa  157  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3644  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.54 
 
 
485 aa  157  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4427  amidase  30.41 
 
 
470 aa  157  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0761  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.54 
 
 
486 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3192  amidase family protein  31.03 
 
 
475 aa  156  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1465  amidase  33.19 
 
 
535 aa  156  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.741427 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>