More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4139 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4139  amidase  100 
 
 		 483 aa  969    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2578  amidase  87.14 
 
 		 483 aa  776    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.06158 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1900  amidase  59.38 
 
 		 490 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1679  amidase  59.88 
 
 		 500 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7130  amidase  58.21 
 
 		 489 aa  503  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0691  amidase  43.75 
 
 		 505 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.771388  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0495  amidase  42.03 
 
 		 505 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0798  amidase  44.06 
 
 		 485 aa  311  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.623196  normal  0.286428 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3768  amidase  42.83 
 
 		 498 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.30926  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5248  Amidase  46.29 
 
 		 457 aa  306  5.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000283595  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1302  amidase  42.48 
 
 		 477 aa  286  5.999999999999999e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5240  putative amidase  40.51 
 
 		 485 aa  280  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.273599 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13196  amidase  40.71 
 
 		 495 aa  270  5e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.471153 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7092  amidase  37.87 
 
 		 485 aa  255  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3620  amidase  39.58 
 
 		 473 aa  217  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  33.54 
 
 		 472 aa  196  7e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  35.14 
 
 		 475 aa  196  8.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  32.39 
 
 		 477 aa  196  9e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3411  amidase  35.43 
 
 		 499 aa  192  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4261  Amidase  34.02 
 
 		 475 aa  188  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.643604 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1350  amidase  30.31 
 
 		 446 aa  188  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.149618  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.86 
 
 		 485 aa  186  6e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.76 
 
 		 475 aa  184  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1685  amidase  33.77 
 
 		 466 aa  184  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.23 
 
 		 486 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1649  amidase  33.7 
 
 		 469 aa  182  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2120  Amidase  35.42 
 
 		 447 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.72 
 
 		 483 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.86 
 
 		 480 aa  178  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  31.57 
 
 		 472 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1838  amidase  32.2 
 
 		 477 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.942234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2636  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.85 
 
 		 483 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  33.54 
 
 		 466 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.49 
 
 		 483 aa  176  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.3 
 
 		 484 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2947  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.2 
 
 		 487 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3629  amidase  34.28 
 
 		 477 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1671  amidase  32.44 
 
 		 482 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  34.7 
 
 		 461 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  29.44 
 
 		 486 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  30.77 
 
 		 480 aa  172  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.02 
 
 		 486 aa  171  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4217  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.36 
 
 		 483 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0576  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.28 
 
 		 485 aa  171  3e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.558849  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2436  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  27.98 
 
 		 486 aa  171  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.44 
 
 		 485 aa  171  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.71 
 
 		 485 aa  170  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.01 
 
 		 475 aa  170  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1934  Amidase  32.99 
 
 		 477 aa  170  7e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000185189  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2877  putative amidotransferase  31.17 
 
 		 473 aa  169  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133365  normal  0.0420813 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1951  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.12 
 
 		 490 aa  169  9e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735841  normal  0.759727 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0058  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.97 
 
 		 494 aa  169  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2168  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.1 
 
 		 485 aa  168  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  31.2 
 
 		 474 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4797  putative amidase  33.81 
 
 		 498 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  29.18 
 
 		 479 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  33.74 
 
 		 464 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2615  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.3 
 
 		 482 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1096  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  32.29 
 
 		 489 aa  167  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  34.32 
 
 		 463 aa  167  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3369  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.68 
 
 		 495 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1700  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.94 
 
 		 483 aa  166  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0322  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.04 
 
 		 497 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0418  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.94 
 
 		 499 aa  166  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118613 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1453  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  27.93 
 
 		 477 aa  165  1.0000000000000001e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.67645  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0540  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.36 
 
 		 488 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732053  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2186  Amidase  30.74 
 
 		 470 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.35 
 
 		 482 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1701  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.52 
 
 		 483 aa  164  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2730  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  30.65 
 
 		 485 aa  164  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0351101  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2535  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.77 
 
 		 482 aa  163  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  31.94 
 
 		 496 aa  163  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0697  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.74 
 
 		 505 aa  163  6e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0287  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.41 
 
 		 486 aa  163  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000251975  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0464  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  29.03 
 
 		 491 aa  162  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  33.61 
 
 		 463 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0761  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.02 
 
 		 486 aa  162  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2065  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.12 
 
 		 485 aa  162  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.700676 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0516  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.33 
 
 		 484 aa  162  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2117  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.26 
 
 		 479 aa  161  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.893835  normal  0.399688 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0292  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.74 
 
 		 499 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4989  Amidase  34.15 
 
 		 472 aa  161  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58180  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.56 
 
 		 484 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0481  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.28 
 
 		 498 aa  160  4e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.103288 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4838  Amidase  33.2 
 
 		 469 aa  160  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1500  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  31.21 
 
 		 476 aa  159  8e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0473179 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1103  amidase  31.75 
 
 		 472 aa  159  9e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0264  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.18 
 
 		 486 aa  159  9e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2569  amidase family protein  32.99 
 
 		 507 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111289  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2111  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.87 
 
 		 490 aa  159  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.14975  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0300  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.03 
 
 		 489 aa  159  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4870  Amidase  33.33 
 
 		 473 aa  159  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1032  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.28 
 
 		 486 aa  159  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.929354  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10590  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  33.13 
 
 		 503 aa  159  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.701412  normal  0.20971 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1770  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.87 
 
 		 490 aa  159  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0827327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09331  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.18 
 
 		 486 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.963624  normal  0.0575081 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  32.44 
 
 		 494 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1157  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.58 
 
 		 491 aa  158  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0758245  normal  0.786366 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1912  putative amidase  31.65 
 
 		 486 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15821  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.31 
 
 		 486 aa  158  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>