More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4006 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3449  amidase  90.09 
 
 		 467 aa  774    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4006  amidase  100 
 
 		 466 aa  910    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.525066  normal  0.419879 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2627  amidase  92.9 
 
 		 466 aa  821    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5269  amidase  89.66 
 
 		 467 aa  788    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357153  normal  0.248065 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3512  amidase  97.81 
 
 		 466 aa  843    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3666  amidase  61.29 
 
 		 466 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3471  amidase  63.01 
 
 		 465 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1896  amidase  63.52 
 
 		 465 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4149  amidase  62.45 
 
 		 465 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.706387  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0894  amidase  64.5 
 
 		 464 aa  530  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0315634 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6296  amidase  60.65 
 
 		 464 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1407  amidase  60.77 
 
 		 473 aa  518  1e-146  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0413  amidase  58.32 
 
 		 466 aa  514  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7676  amidase  51.07 
 
 		 471 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616001  normal  0.331249 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6669  amidase  49.36 
 
 		 478 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.654652  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3556  amidase  50.96 
 
 		 473 aa  365  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6072  amidase  49.57 
 
 		 471 aa  349  6e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2400  indoleacetamide hydrolase  45.54 
 
 		 467 aa  319  7e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3411  amidase  40.13 
 
 		 499 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1619  amidase  43.67 
 
 		 485 aa  286  7e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.445224  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1577  amidase  39.96 
 
 		 478 aa  259  7e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1649  amidase  36.12 
 
 		 469 aa  250  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0982  indoleacetamide hydrolase  41.72 
 
 		 470 aa  250  4e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.682972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2081  amidase  40.26 
 
 		 524 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0468  amidase  42.53 
 
 		 438 aa  228  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0410275  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  34.53 
 
 		 472 aa  211  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  36.06 
 
 		 472 aa  209  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  33.33 
 
 		 477 aa  204  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4870  Amidase  38.77 
 
 		 473 aa  197  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  35.24 
 
 		 473 aa  196  7e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  33.4 
 
 		 474 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  36.81 
 
 		 466 aa  188  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3827  amidase  32.08 
 
 		 495 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1252  amidase  44 
 
 		 477 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  33.55 
 
 		 475 aa  177  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2402  amidase  32.78 
 
 		 492 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.574141  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7198  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  33.98 
 
 		 461 aa  173  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20980  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  38.05 
 
 		 479 aa  173  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.705121  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  33.55 
 
 		 494 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  33.55 
 
 		 494 aa  172  9e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2120  Amidase  36.77 
 
 		 447 aa  172  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3821  amidase  34.16 
 
 		 467 aa  172  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  33.33 
 
 		 494 aa  171  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  32.99 
 
 		 480 aa  171  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  39.53 
 
 		 458 aa  169  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0983  amidase  33.41 
 
 		 485 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4261  Amidase  40.91 
 
 		 475 aa  167  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.643604 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  25.1 
 
 		 485 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.89 
 
 		 485 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  32.17 
 
 		 494 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1293  amidase  32.45 
 
 		 485 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0666673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  31.97 
 
 		 494 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  32.17 
 
 		 496 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  32.17 
 
 		 494 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  32.17 
 
 		 494 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1671  amidase  33.33 
 
 		 482 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.677063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2170  Amidase  32.75 
 
 		 487 aa  163  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4545  putative amidase  35.59 
 
 		 468 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0786756  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1838  amidase  33.19 
 
 		 477 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.942234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  34.45 
 
 		 463 aa  160  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4260  amidase  31.91 
 
 		 471 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.016839  hitchhiker  0.000222937 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1350  amidase  27.77 
 
 		 446 aa  159  8e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.149618  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.22 
 
 		 486 aa  159  9e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1411  Amidase  32.18 
 
 		 491 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440545 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1770  amidase  30.06 
 
 		 475 aa  159  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.665122 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1493  amidase  35.34 
 
 		 468 aa  159  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.710832  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5623  Amidase  32.71 
 
 		 492 aa  158  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  27.9 
 
 		 486 aa  157  3e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1170  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  27.16 
 
 		 479 aa  157  4e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30110  putative amidase  32.91 
 
 		 469 aa  157  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00374017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1453  Amidase  31.74 
 
 		 494 aa  156  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830679  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0111  Amidase  32.04 
 
 		 459 aa  156  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542197  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  33.97 
 
 		 490 aa  156  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4797  putative amidase  31.95 
 
 		 498 aa  156  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  34.16 
 
 		 463 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  30.27 
 
 		 494 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1754  putative amidase  31.98 
 
 		 471 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1096  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.25 
 
 		 489 aa  155  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5240  putative amidase  32.98 
 
 		 485 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.273599 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2709  amidase  33.97 
 
 		 490 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0428  putative amidase  31.54 
 
 		 474 aa  154  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154682  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.79 
 
 		 486 aa  152  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  34.66 
 
 		 495 aa  152  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0436  putative amidase  32.05 
 
 		 471 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258075  normal  0.851149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3208  amidase  34.38 
 
 		 462 aa  152  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0230  amidase  42 
 
 		 498 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.817663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1934  Amidase  32.97 
 
 		 477 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000185189  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.69 
 
 		 480 aa  150  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4838  Amidase  40.08 
 
 		 469 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.83 
 
 		 491 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0495  amidase  32.98 
 
 		 505 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2877  putative amidotransferase  31.87 
 
 		 473 aa  148  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133365  normal  0.0420813 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1681  amidase  45.99 
 
 		 480 aa  147  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0458  Amidase  29.41 
 
 		 549 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3206  amidase  28.05 
 
 		 468 aa  146  8.000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.829044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2009  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  30.61 
 
 		 487 aa  146  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3629  amidase  32.59 
 
 		 477 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2277  hypothetical protein  27.84 
 
 		 469 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2260  amidase  31.08 
 
 		 507 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172416  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0825  Amidase  32.1 
 
 		 480 aa  146  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>