More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNN02060 on replicon NC_006683
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006683  CNN02060  amidase, putative  100 
 
 
556 aa  1144    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0133914  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02662  conserved hypothetical protein  36.94 
 
 
536 aa  365  1e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0475802  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88820  Acetamidase  37.28 
 
 
548 aa  351  2e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10833  amidase (Eurofung)  36.94 
 
 
543 aa  338  9.999999999999999e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01840  general amidase, putative  38.31 
 
 
551 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08777  Acetamidase (EC 3.5.1.4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08158]  38.82 
 
 
548 aa  336  5.999999999999999e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.440236 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03957  General amidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X144]  35.03 
 
 
561 aa  315  9.999999999999999e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.696881  normal  0.0809075 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04195  conserved hypothetical protein  33.22 
 
 
598 aa  302  1e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.142073  normal  0.334259 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47832  Acetamidase  33.99 
 
 
541 aa  285  2.0000000000000002e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10210  acetamidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05220)  33.81 
 
 
548 aa  263  4e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02879  General amidase-BPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C1C8]  33.68 
 
 
543 aa  258  1e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.15418 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48268  amidase  32.24 
 
 
572 aa  251  2e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02829  General amidase-C [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C1C7]  30.3 
 
 
538 aa  245  1.9999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.308927  normal  0.124376 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86089  amidase activity  30.29 
 
 
556 aa  213  7.999999999999999e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00303647  normal  0.387343 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08303  conserved hypothetical protein  28.23 
 
 
543 aa  201  3e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000993365 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00783  general amidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14530)  33.17 
 
 
533 aa  195  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02180  conserved hypothetical protein  28.04 
 
 
573 aa  192  9e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.799124  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09138  acetamidase (Eurofung)  29.23 
 
 
585 aa  179  9e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.166655  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3411  amidase  34.06 
 
 
499 aa  156  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12740  predicted protein  26.49 
 
 
459 aa  140  4.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.60383  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0111  Amidase  47.65 
 
 
459 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542197  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4870  Amidase  30.44 
 
 
473 aa  137  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1649  amidase  33.66 
 
 
469 aa  137  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  35.81 
 
 
494 aa  133  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  35.12 
 
 
496 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  34.94 
 
 
477 aa  128  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  35.66 
 
 
494 aa  127  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5269  amidase  31.18 
 
 
467 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357153  normal  0.248065 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  36.71 
 
 
494 aa  126  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  35.14 
 
 
494 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  33.22 
 
 
494 aa  124  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1252  amidase  36.97 
 
 
477 aa  124  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  34.26 
 
 
472 aa  124  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1411  Amidase  32.56 
 
 
491 aa  123  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.440545 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1453  Amidase  32.33 
 
 
494 aa  123  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830679  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2277  hypothetical protein  28.12 
 
 
469 aa  122  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3512  amidase  29.14 
 
 
466 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.09 
 
 
483 aa  122  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4006  amidase  30.5 
 
 
466 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.525066  normal  0.419879 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2627  amidase  30.12 
 
 
466 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0983  amidase  36.47 
 
 
485 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  33.11 
 
 
494 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  33.11 
 
 
494 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  33.11 
 
 
494 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1350  amidase  27.27 
 
 
446 aa  120  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.149618  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2304  hypothetical protein  27.89 
 
 
469 aa  120  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3449  amidase  31.18 
 
 
467 aa  120  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2120  Amidase  29.47 
 
 
447 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4149  amidase  33.44 
 
 
465 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.706387  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1685  amidase  33.94 
 
 
466 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3471  amidase  30.91 
 
 
465 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3666  amidase  31.42 
 
 
466 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.71 
 
 
485 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  35.5 
 
 
475 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1293  amidase  33.33 
 
 
485 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0666673  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.04 
 
 
475 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  36.72 
 
 
466 aa  113  9e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5322  amidase  34.69 
 
 
481 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.348723  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4261  Amidase  35.14 
 
 
475 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.643604 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  33.33 
 
 
472 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0691  amidase  37.1 
 
 
505 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.771388  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7676  amidase  33.23 
 
 
471 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.616001  normal  0.331249 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0894  amidase  31.76 
 
 
464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0315634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  37.61 
 
 
463 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  35.9 
 
 
461 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6072  amidase  33.96 
 
 
471 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4470  Amidase  30.74 
 
 
530 aa  110  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141503  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2551  amidase  36.12 
 
 
485 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2400  indoleacetamide hydrolase  28.08 
 
 
467 aa  110  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2609  amidase  36.4 
 
 
485 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.369685 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.8 
 
 
475 aa  109  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6669  amidase  32.23 
 
 
478 aa  109  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.654652  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1228  amidase  39.39 
 
 
466 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1302  amidase  33.2 
 
 
477 aa  108  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  37.7 
 
 
461 aa  108  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1681  amidase  38.03 
 
 
480 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3474  indole acetimide hydrolase  39 
 
 
484 aa  108  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.027239 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4838  Amidase  36.65 
 
 
469 aa  108  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  34.25 
 
 
491 aa  108  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1896  amidase  30.06 
 
 
465 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3826  amidase  39.56 
 
 
509 aa  107  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2751  amidase  36.84 
 
 
485 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2260  amidase  34.87 
 
 
507 aa  106  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.172416  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  34.3 
 
 
473 aa  106  9e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5709  indole acetimide hydrolase  37.93 
 
 
484 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  27.07 
 
 
495 aa  106  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.86 
 
 
480 aa  106  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0576  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.53 
 
 
485 aa  105  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.558849  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2569  amidase family protein  35.11 
 
 
507 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111289  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0670  Amidase  33.04 
 
 
509 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0474634  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.25 
 
 
483 aa  105  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3345  Amidase  34.15 
 
 
526 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0644396 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5240  putative amidase  32.34 
 
 
485 aa  105  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.273599 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3559  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  26.32 
 
 
498 aa  104  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0572213  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  30.94 
 
 
474 aa  104  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1220  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.46 
 
 
491 aa  104  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.82883  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0322  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.55 
 
 
497 aa  104  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2709  amidase  36.61 
 
 
490 aa  104  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20980  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  27.79 
 
 
479 aa  103  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.705121  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2583  amidase  36.61 
 
 
490 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>