More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12740 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_12740  predicted protein  100 
 
 
459 aa  949    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.60383  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02180  conserved hypothetical protein  28.75 
 
 
573 aa  169  8e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.799124  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08777  Acetamidase (EC 3.5.1.4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08158]  31.82 
 
 
548 aa  154  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.440236 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10833  amidase (Eurofung)  28.26 
 
 
543 aa  149  8e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88820  Acetamidase  28.54 
 
 
548 aa  144  4e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02060  amidase, putative  26.49 
 
 
556 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0133914  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00783  general amidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14530)  26.6 
 
 
533 aa  136  9e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02662  conserved hypothetical protein  28.13 
 
 
536 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0475802  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02879  General amidase-BPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C1C8]  27.73 
 
 
543 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.15418 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2120  Amidase  34.75 
 
 
447 aa  133  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09138  acetamidase (Eurofung)  26.5 
 
 
585 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.166655  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01840  general amidase, putative  35.98 
 
 
551 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.34 
 
 
485 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3411  amidase  33.91 
 
 
499 aa  120  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48268  amidase  32.69 
 
 
572 aa  119  9e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02829  General amidase-C [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C1C7]  27.29 
 
 
538 aa  119  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.308927  normal  0.124376 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1649  amidase  33.33 
 
 
469 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47832  Acetamidase  27.65 
 
 
541 aa  119  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.08 
 
 
483 aa  116  8.999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  38.51 
 
 
477 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3369  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.04 
 
 
495 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  38.51 
 
 
472 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2915  Amidase  37.35 
 
 
495 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10210  acetamidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05220)  33.05 
 
 
548 aa  114  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  42.05 
 
 
461 aa  114  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1685  amidase  33.33 
 
 
466 aa  114  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  30.77 
 
 
461 aa  113  7.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.94 
 
 
475 aa  110  5e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  37.95 
 
 
494 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  37.95 
 
 
494 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  37.95 
 
 
494 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.54 
 
 
483 aa  110  7.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  37.93 
 
 
475 aa  109  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  37.35 
 
 
494 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1252  amidase  40.23 
 
 
477 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  36.57 
 
 
472 aa  108  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.29 
 
 
480 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  37.65 
 
 
475 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  36.75 
 
 
494 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0982  indoleacetamide hydrolase  35.67 
 
 
470 aa  106  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.682972  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  26.46 
 
 
485 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2168  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.14 
 
 
485 aa  104  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  36.75 
 
 
494 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  36.75 
 
 
494 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.64 
 
 
491 aa  103  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0111  Amidase  39.76 
 
 
459 aa  103  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00542197  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2277  hypothetical protein  25.66 
 
 
469 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0058  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.89 
 
 
494 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0292  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.97 
 
 
499 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0287  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.96 
 
 
486 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000251975  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4912  amidase  36.75 
 
 
496 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2304  hypothetical protein  24.72 
 
 
469 aa  100  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2208  amidase  25.6 
 
 
511 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4802  Amidase  27.06 
 
 
468 aa  100  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271791  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0781  putative amidase  33.23 
 
 
468 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  26.26 
 
 
479 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  28.91 
 
 
484 aa  100  6e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6420  Amidase  37.13 
 
 
466 aa  100  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1969  amidase  30.23 
 
 
470 aa  100  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3474  indole acetimide hydrolase  31.02 
 
 
484 aa  100  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.027239 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1900  amidase  25.57 
 
 
490 aa  100  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4261  Amidase  31.02 
 
 
475 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.643604 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86089  amidase activity  24 
 
 
556 aa  99  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00303647  normal  0.387343 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0458  Amidase  26.72 
 
 
549 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  32.11 
 
 
464 aa  99.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20980  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  38.51 
 
 
479 aa  99  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.705121  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3925  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.57 
 
 
493 aa  99  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4338  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.81 
 
 
490 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0589  amidase  33.2 
 
 
448 aa  99  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1103  amidase  41.6 
 
 
472 aa  98.6  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2421  amidase  24.89 
 
 
511 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1234  indole acetimide hydrolase  25.05 
 
 
467 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00177954  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3827  amidase  37.36 
 
 
495 aa  98.6  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7145  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  32.72 
 
 
470 aa  98.6  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4870  Amidase  36.78 
 
 
473 aa  98.6  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0231  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.12 
 
 
500 aa  99  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.747986  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2204  indole acetimide hydrolase  25.71 
 
 
467 aa  99  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99043  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0409  indole acetimide hydrolase  25.05 
 
 
454 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203824  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  36.1 
 
 
466 aa  98.6  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3503  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  26.57 
 
 
486 aa  98.6  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0709633 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0369  indole acetimide hydrolase  25.05 
 
 
467 aa  98.2  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0153606  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1746  indole acetimide hydrolase  25.05 
 
 
467 aa  98.2  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.203091  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0229  amidase  26.77 
 
 
455 aa  97.8  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0237  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.12 
 
 
500 aa  98.2  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.780008 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1559  indole acetimide hydrolase  25.05 
 
 
467 aa  98.2  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.664098  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4139  amidase  25.85 
 
 
483 aa  97.4  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.459959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4805  amidase  35.64 
 
 
464 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345953  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6900  amidase  29.75 
 
 
484 aa  97.1  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56450  amidase  34.34 
 
 
494 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.677311  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2009  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  35.19 
 
 
487 aa  97.1  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1679  amidase  24.47 
 
 
500 aa  96.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  34.6 
 
 
473 aa  96.7  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  43.86 
 
 
463 aa  96.7  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1350  amidase  32.03 
 
 
446 aa  96.7  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.149618  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2995  indole acetimide hydrolase  24.84 
 
 
467 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0342626  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  34.67 
 
 
474 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7768  amidase  32.91 
 
 
446 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2896  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.08 
 
 
488 aa  95.9  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1838  amidase  33.17 
 
 
477 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.942234  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2578  amidase  36.31 
 
 
483 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.06158 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>