More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_86089 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_86089  amidase activity  100 
 
 		 556 aa  1145    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00303647  normal  0.387343 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10833  amidase (Eurofung)  34.24 
 
 		 543 aa  296  8e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08777  Acetamidase (EC 3.5.1.4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08158]  34.68 
 
 		 548 aa  276  5e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.440236 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02662  conserved hypothetical protein  35.88 
 
 		 536 aa  271  2e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0475802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88820  Acetamidase  36.18 
 
 		 548 aa  271  2e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48268  amidase  34.52 
 
 		 572 aa  265  2e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01840  general amidase, putative  33.4 
 
 		 551 aa  248  1e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03957  General amidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8X144]  33.72 
 
 		 561 aa  243  7e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.696881  normal  0.0809075 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47832  Acetamidase  33.6 
 
 		 541 aa  234  4.0000000000000004e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10210  acetamidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G05220)  32.74 
 
 		 548 aa  231  3e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02060  amidase, putative  30.29 
 
 		 556 aa  229  1e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0133914  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04195  conserved hypothetical protein  30.26 
 
 		 598 aa  203  8e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.142073  normal  0.334259 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02180  conserved hypothetical protein  29.83 
 
 		 573 aa  200  5e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.799124  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02829  General amidase-C [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C1C7]  30.41 
 
 		 538 aa  191  4e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.308927  normal  0.124376 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09138  acetamidase (Eurofung)  28.33 
 
 		 585 aa  189  8e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.166655  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02879  General amidase-BPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C1C8]  30.85 
 
 		 543 aa  179  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.15418 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00783  general amidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14530)  31.49 
 
 		 533 aa  168  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08303  conserved hypothetical protein  27.15 
 
 		 543 aa  154  5.9999999999999996e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000993365 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1649  amidase  30.22 
 
 		 469 aa  131  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.045909 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3411  amidase  26.91 
 
 		 499 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.675825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12740  predicted protein  24 
 
 		 459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.60383  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  31.03 
 
 		 477 aa  110  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0982  indoleacetamide hydrolase  27.27 
 
 		 470 aa  102  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.682972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1577  amidase  34.02 
 
 		 478 aa  99.8  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  31.47 
 
 		 472 aa  96.7  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  27.35 
 
 		 466 aa  95.1  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2081  amidase  28.11 
 
 		 524 aa  94.4  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3666  amidase  31.67 
 
 		 466 aa  94  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4006  amidase  28.21 
 
 		 466 aa  94  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.525066  normal  0.419879 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5269  amidase  30.3 
 
 		 467 aa  93.6  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357153  normal  0.248065 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2627  amidase  28.11 
 
 		 466 aa  93.2  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0894  amidase  28.25 
 
 		 464 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0315634 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3512  amidase  27.86 
 
 		 466 aa  93.2  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1685  amidase  31.75 
 
 		 466 aa  92.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.992424  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0143  Amidase  29.87 
 
 		 474 aa  91.7  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.81 
 
 		 475 aa  91.7  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  29.87 
 
 		 475 aa  91.7  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2277  hypothetical protein  26.64 
 
 		 469 aa  90.9  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1407  amidase  33.83 
 
 		 473 aa  91.3  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4261  Amidase  27.27 
 
 		 475 aa  90.5  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.643604 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6296  amidase  30.8 
 
 		 464 aa  89.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0346  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.78 
 
 		 482 aa  90.1  1e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0113738  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4083  amidase  27.78 
 
 		 494 aa  89.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3449  amidase  31.02 
 
 		 467 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1166  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.34 
 
 		 483 aa  89.4  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0691  amidase  25.24 
 
 		 505 aa  89.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.771388  normal  0.653443 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4547  amidase  29.09 
 
 		 494 aa  89.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193224 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1411  Amidase  28 
 
 		 491 aa  87.4  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.440545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4470  Amidase  27.1 
 
 		 530 aa  87.4  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141503  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2304  hypothetical protein  26.17 
 
 		 469 aa  87  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2842  amidase  36.65 
 
 		 477 aa  87.4  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.779137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2877  putative amidotransferase  26.79 
 
 		 473 aa  87  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133365  normal  0.0420813 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1619  amidase  35.35 
 
 		 485 aa  86.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.445224  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6180  amidase  31.33 
 
 		 470 aa  86.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.718861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4003  amidase  25.06 
 
 		 494 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582745  normal  0.212631 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0458  Amidase  24.88 
 
 		 549 aa  86.7  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1453  Amidase  27.88 
 
 		 494 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830679  normal  0.199782 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1123  Amidase  33.93 
 
 		 472 aa  86.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0760  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.7 
 
 		 483 aa  86.3  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0363405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0068  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  33.04 
 
 		 474 aa  86.7  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000049622 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3827  amidase  33.02 
 
 		 495 aa  85.5  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.550794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  29.78 
 
 		 463 aa  85.9  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5415  Amidase  23.6 
 
 		 467 aa  85.5  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1754  putative amidase  30.85 
 
 		 471 aa  85.9  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.674752  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  34.01 
 
 		 475 aa  85.5  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3526  amidase  36.13 
 
 		 490 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3170  amidase  36.13 
 
 		 490 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.43381 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.34 
 
 		 485 aa  84.3  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3880  Amidase  38.17 
 
 		 508 aa  84.3  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.777875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0165  amidase  32.26 
 
 		 482 aa  84.3  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1934  Amidase  25.72 
 
 		 477 aa  84  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.000185189  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3471  amidase  32.37 
 
 		 465 aa  84  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  29.49 
 
 		 458 aa  84  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3821  amidase  30.57 
 
 		 467 aa  83.6  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3678  amidase  27.08 
 
 		 494 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5611  amidase  27.08 
 
 		 494 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.967064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4689  amidase  27.08 
 
 		 494 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292379  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1131  amidase  27.27 
 
 		 494 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28334 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1896  amidase  31.6 
 
 		 465 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  35.81 
 
 		 485 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1838  amidase  25.47 
 
 		 477 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.942234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2205  Amidase  29.55 
 
 		 473 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7198  putative glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A (Glu-ADT subunit A)  28.15 
 
 		 461 aa  82  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3400  Amidase  27.9 
 
 		 472 aa  82.8  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.602142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0428  putative amidase  29.58 
 
 		 474 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4805  amidase  24.73 
 
 		 464 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.345953  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0798  amidase  28.88 
 
 		 485 aa  82  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.623196  normal  0.286428 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4149  amidase  29.83 
 
 		 465 aa  82  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.706387  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.4 
 
 		 480 aa  82  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2163  amidase  27.58 
 
 		 531 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765875  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0413  amidase  31.88 
 
 		 466 aa  81.3  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5442  amidase  28.67 
 
 		 493 aa  81.3  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3556  amidase  33.98 
 
 		 473 aa  81.6  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1969  amidase  37.19 
 
 		 470 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4462  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  27.24 
 
 		 481 aa  80.9  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956052  normal  0.365252 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6695  hypothetical protein  29.91 
 
 		 456 aa  80.9  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.626739  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2988  Amidase  30.22 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0125089  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2400  indoleacetamide hydrolase  36.94 
 
 		 467 aa  80.5  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3345  Amidase  27.94 
 
 		 526 aa  80.5  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0644396 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4260  amidase  28.52 
 
 		 471 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.016839  hitchhiker  0.000222937 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>