87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1206 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1206  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  297  4e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0195  cupin domain-containing protein  89.17 
 
 
318 aa  221  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.579249  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1684  cupin domain-containing protein  88.33 
 
 
155 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1602  cupin domain-containing protein  87.85 
 
 
150 aa  190  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4326  cupin 2 domain-containing protein  50.37 
 
 
140 aa  125  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.785226  normal  0.151311 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4102  cupin 2, barrel  57.69 
 
 
139 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470129  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4264  cupin 2 domain-containing protein  57.69 
 
 
139 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209517  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3253  cupin 2 domain-containing protein  57.14 
 
 
139 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641495  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  48.82 
 
 
146 aa  120  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1742  hypothetical protein  54.05 
 
 
141 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0525377  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3788  cupin 2 domain-containing protein  47.97 
 
 
133 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140912  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1503  cupin 2 domain-containing protein  48.72 
 
 
133 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3204  cupin region  43.88 
 
 
150 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0134576 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0348  hypothetical protein  38.4 
 
 
135 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03510  hypothetical protein  40.19 
 
 
135 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866507  hitchhiker  0.00000000000000348857 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5629  cupin 2 domain-containing protein  47.12 
 
 
145 aa  92  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5737  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.35 
 
 
139 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6134  cupin region  45.79 
 
 
138 aa  90.1  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3950  cupin 2 domain-containing protein  45.05 
 
 
138 aa  89  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.319807 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.67 
 
 
139 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0092  hypothetical protein  43.01 
 
 
134 aa  87.4  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1999  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.39 
 
 
134 aa  85.5  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4626  cupin 2 domain-containing protein  37.8 
 
 
134 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000448523 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3553  cupin 2 domain-containing protein  44.34 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6988  cupin 2 domain-containing protein  42.99 
 
 
138 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833985  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5257  cupin 2, barrel  41.94 
 
 
131 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4282  cupin 2 domain-containing protein  41.04 
 
 
137 aa  84.3  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5602  cupin 2 domain-containing protein  41.94 
 
 
131 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.418121 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2973  hypothetical protein  43.62 
 
 
133 aa  84.3  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.909683  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3157  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.35 
 
 
129 aa  84  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.737145  normal  0.282512 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6385  cupin 2 domain-containing protein  41.79 
 
 
138 aa  83.6  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.128861 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3724  hypothetical protein  41.84 
 
 
157 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2343  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.94 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5168  cupin 2, barrel  37.69 
 
 
143 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  41.94 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6088  cupin 2 domain-containing protein  42.15 
 
 
138 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2920  cupin 2, barrel  40.86 
 
 
134 aa  80.5  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288591  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1346  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.86 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  hitchhiker  0.0000000363501 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1318  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.86 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.63 
 
 
135 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.796075 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2017  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.02 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0367587 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5795  cupin 2 domain-containing protein  36.19 
 
 
135 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732811  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5430  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.23 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5578  cupin 2 domain-containing protein  31.82 
 
 
134 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1578  cupin region  32.54 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3402  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.31 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0995  cupin region  36.64 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4739  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.42 
 
 
137 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234364  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5346  cupin 2 domain-containing protein  33.64 
 
 
171 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0870556 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2274  cupin region  37.69 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.921638  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1425  hypothetical protein  33.56 
 
 
143 aa  67  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18183  normal  0.0452464 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2789  cupin 2 domain-containing protein  37.27 
 
 
141 aa  67  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.68 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3213  normal  0.701172 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.89 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0261511  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2774  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.283614  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2518  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08614  cupin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13620)  38.64 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5822  cupin 2 domain-containing protein  34.21 
 
 
141 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.186045 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.96 
 
 
179 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.46 
 
 
172 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5062  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.26 
 
 
136 aa  57.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.5 
 
 
137 aa  55.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1706  cupin 2 protein  31.09 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3906  cupin 2 domain-containing protein  35.9 
 
 
133 aa  53.9  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000227782  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5435  hypothetical protein  34.07 
 
 
145 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.534413  normal  0.706923 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.09 
 
 
128 aa  51.2  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2285  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.42 
 
 
173 aa  50.8  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  31.9 
 
 
133 aa  50.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.99 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3091  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.84 
 
 
178 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4486  cupin 2 domain-containing protein  35.8 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.801691  normal  0.97198 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2102  cupin 2 domain-containing protein  38.67 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2986  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.53 
 
 
178 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0365078  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.62 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0766179  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.17 
 
 
231 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7206  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.23 
 
 
260 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.76271  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4505  cupin 2 domain-containing protein  36.99 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.59 
 
 
140 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.32 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2490  hypothetical protein  29.41 
 
 
132 aa  45.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440666  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  32.5 
 
 
141 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1059  hypothetical protein  34.48 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  28.42 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2205  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.76 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  29.01 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0735  cupin 2 domain-containing protein  26.32 
 
 
178 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0842  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 
188 aa  40.4  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>