More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1184 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_5032  acriflavin resistance protein  50.78 
 
 
1064 aa  905    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3400  CzcA family heavy metal efflux protein  38.48 
 
 
1023 aa  642    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0183  acriflavin resistance protein  58.13 
 
 
1032 aa  1132    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0079  AcrB/AcrD/AcrF family protein  50.78 
 
 
1028 aa  937    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.60921  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1542  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.25 
 
 
1054 aa  651    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3709  acriflavin resistance protein  52.43 
 
 
1054 aa  973    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294251  decreased coverage  0.000260897 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4094  CzcA family heavy metal efflux protein  40.04 
 
 
1045 aa  669    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.966069  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3340  acriflavin resistance protein  49.86 
 
 
1055 aa  841    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0618093  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2073  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  36.9 
 
 
1066 aa  658    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2351  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  37.13 
 
 
1071 aa  681    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2063  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  37.18 
 
 
1066 aa  660    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4520  acriflavin resistance protein  50.97 
 
 
1064 aa  911    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0949  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.05 
 
 
1053 aa  636    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0902  heavy metal efflux pump CzcA  37.87 
 
 
1036 aa  647    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2877  acriflavin resistance protein  53.13 
 
 
1061 aa  931    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.342054  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0294  heavy metal efflux pump  38.01 
 
 
1041 aa  640    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.393519  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2183  acriflavin resistance protein  39.52 
 
 
1054 aa  679    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1184  heavy metal efflux pump CzcA, putative  100 
 
 
1039 aa  2040    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1991  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.55 
 
 
1061 aa  660    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623146  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1632  acriflavin resistance protein  50.87 
 
 
1046 aa  995    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951985  normal  0.0573923 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4980  acriflavin resistance protein  50.97 
 
 
1064 aa  910    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.418063  normal  0.190212 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0669  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.83 
 
 
1092 aa  637    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725798  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1297  multidrug ABC transporter  51.35 
 
 
1052 aa  987    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777713  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1746  heavy metal efflux pump CzcA  38.16 
 
 
1034 aa  631  1e-179  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3406  CzcA family heavy metal efflux protein  40.28 
 
 
1043 aa  623  1e-177  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3468  acriflavin resistance protein  37.77 
 
 
1050 aa  622  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3471  CzcA family heavy metal efflux protein  38.85 
 
 
1043 aa  622  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00106273  normal  0.764993 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5616  acriflavin resistance protein  39.03 
 
 
1031 aa  617  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3110  acriflavin resistance protein  42.47 
 
 
1033 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.535167  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0064  CzcA family heavy metal efflux protein  36.28 
 
 
1039 aa  608  9.999999999999999e-173  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0995  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.49 
 
 
1048 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998262  normal  0.0908924 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1783  acriflavin resistance protein  38.35 
 
 
1040 aa  607  9.999999999999999e-173  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146507  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1103  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.93 
 
 
1049 aa  597  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.442224  normal  0.0460054 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0144  CzcA family heavy metal efflux protein  37.45 
 
 
1047 aa  596  1e-169  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1584  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.73 
 
 
1034 aa  597  1e-169  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4126  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.47 
 
 
1049 aa  592  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18570  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.89 
 
 
1039 aa  589  1e-167  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219423  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2095  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.95 
 
 
1039 aa  586  1e-166  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1742  CzcA family heavy metal efflux protein  37.56 
 
 
1043 aa  587  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.415877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0110  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.58 
 
 
1049 aa  588  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2382  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.95 
 
 
1039 aa  586  1e-166  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0207882  hitchhiker  0.000762741 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4569  CzcA family heavy metal efflux protein  35.63 
 
 
1039 aa  587  1e-166  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2098  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.2 
 
 
1026 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2534  CzcA family heavy metal efflux protein  38.17 
 
 
1049 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409022  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1142  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.1 
 
 
1048 aa  581  1e-164  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0325102  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2674  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  36.02 
 
 
1039 aa  580  1e-164  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2831  acriflavin resistance protein  37.7 
 
 
1058 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.310418 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1887  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.2 
 
 
1037 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0646993  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4089  acriflavin resistance protein  37.09 
 
 
1075 aa  572  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320158  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1329  CzcA family heavy metal efflux protein  35.09 
 
 
1039 aa  571  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.039425  normal  0.381421 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4731  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.49 
 
 
1037 aa  570  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.971345 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1649  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.87 
 
 
1039 aa  568  1e-160  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.880571  normal  0.706094 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2617  heavy metal efflux pump CzcA  34.98 
 
 
1039 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.427313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0181  CzcA family heavy metal efflux protein  38.15 
 
 
1047 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.543317  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3058  acriflavin resistance protein  36.96 
 
 
1066 aa  562  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37635  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3466  acriflavin resistance protein  35.68 
 
 
1057 aa  560  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2949  acriflavin resistance protein  37.55 
 
 
1058 aa  560  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2180  acriflavin resistance protein  35.49 
 
 
1044 aa  554  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.954115  normal  0.583549 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2735  acriflavin resistance protein  42.26 
 
 
1034 aa  538  1e-151  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.603856  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1059  acriflavin resistance protein  32.86 
 
 
1052 aa  514  1e-144  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.35 
 
 
1034 aa  512  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  33.07 
 
 
1029 aa  506  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  32.05 
 
 
1032 aa  503  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  32.25 
 
 
1034 aa  502  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  33.82 
 
 
1064 aa  502  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  32.18 
 
 
1049 aa  501  1e-140  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  32.6 
 
 
1034 aa  500  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  32.33 
 
 
1069 aa  501  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  33.17 
 
 
1070 aa  498  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4387  acriflavin resistance protein  37.39 
 
 
1030 aa  494  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.285885  normal  0.792526 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  32.4 
 
 
1033 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2626  heavy metal efflux pump CzcA  33.2 
 
 
1032 aa  495  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.516302 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  33.27 
 
 
1070 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1850  heavy metal efflux pump CzcA  32.71 
 
 
1072 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252043  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0771  heavy metal efflux pump, CzcA family  30.58 
 
 
1020 aa  494  9.999999999999999e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.166724  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  33.08 
 
 
1070 aa  496  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  33.08 
 
 
1070 aa  496  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  33.08 
 
 
1070 aa  496  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  31.98 
 
 
1052 aa  491  1e-137  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2274  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.98 
 
 
1034 aa  492  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.256296 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  32.83 
 
 
1043 aa  489  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  32.6 
 
 
1053 aa  487  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2252  heavy metal efflux pump CzcA  33.43 
 
 
1032 aa  488  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  32.95 
 
 
1077 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  33.02 
 
 
1050 aa  488  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  32.95 
 
 
1077 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  32.95 
 
 
1077 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1762  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.37 
 
 
1063 aa  488  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900927  normal  0.462536 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  32.07 
 
 
1053 aa  485  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  32.77 
 
 
1077 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  32.86 
 
 
1077 aa  485  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  32.07 
 
 
1053 aa  485  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  32.77 
 
 
1077 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  33.27 
 
 
1077 aa  486  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1941  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.88 
 
 
1034 aa  486  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2146  heavy metal efflux pump CzcA  32.84 
 
 
1083 aa  484  1e-135  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.580962  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  32.07 
 
 
1053 aa  485  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890967 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  32.77 
 
 
1077 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  31.81 
 
 
1054 aa  482  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3369  CzcA family heavy metal efflux protein  32.9 
 
 
1060 aa  481  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.957207  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>