More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A0311 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A0311  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 244 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3362  transcriptional regulatory protein  93.42 
 
 		 268 aa  408  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107485  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2395  transcriptional regulator, putative  100 
 
 		 178 aa  355  5e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2581  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3351  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1172  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3317  transcriptional regulatory protein  98.69 
 
 		 154 aa  298  4e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3734  HxlR family transcriptional regulator  61.44 
 
 		 156 aa  191  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.847135  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0356  transcriptional regulator, HxlR family  58.9 
 
 		 148 aa  191  9e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4908  HxlR family transcriptional regulator  61.04 
 
 		 156 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186551  hitchhiker  0.000216293 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0413  transcriptional regulator, HxlR family  58.22 
 
 		 148 aa  190  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111874  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5557  HxlR family transcriptional regulator  60.13 
 
 		 156 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4183  HxlR family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 149 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4183  HxlR family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 149 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.186665 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3334  HxlR family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 149 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1848  putative transcriptional regulator  61.11 
 
 		 149 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510456  normal  0.252044 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2265  HxlR family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 156 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  0.12289 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3584  HxlR family transcriptional regulator  59.72 
 
 		 149 aa  183  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.645738  normal  0.125361 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0555  HxlR family transcriptional regulator  61.59 
 
 		 147 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.938313  normal  0.153039 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0502  HxlR family transcriptional regulator  61.76 
 
 		 147 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0537  HxlR family transcriptional regulator  61.76 
 
 		 147 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3693  HxlR family transcriptional regulator  56.77 
 
 		 172 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.031643  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3831  HxlR family transcriptional regulator  56.77 
 
 		 172 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.312681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4532  HxlR family transcriptional regulator  57.52 
 
 		 156 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475295  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1705  HxlR family transcriptional regulator  54.73 
 
 		 151 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188741  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3736  HxlR family transcriptional regulator  64.66 
 
 		 135 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.406945  normal  0.0303641 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1125  HxlR family transcriptional regulator  56.85 
 
 		 152 aa  175  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3999  transcriptional regulator, HxlR family  59.03 
 
 		 163 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3886  transcriptional regulator, HxlR family  59.03 
 
 		 163 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.321119 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0545  putative transcriptional regulator  55.7 
 
 		 179 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0547  HxlR family transcriptional regulator  59.42 
 
 		 147 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.660753  normal  0.959277 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0718  transcriptional regulator, HxlR family  58.67 
 
 		 166 aa  170  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.543743 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0705  helix-turn-helix HxlR type  58 
 
 		 150 aa  169  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.708221 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1192  transcriptional regulator, HxlR family  55.78 
 
 		 149 aa  165  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3667  hypothetical protein  55.48 
 
 		 146 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43720  hypothetical protein  55.48 
 
 		 146 aa  161  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5216  transcriptional regulator, HxlR family  54.17 
 
 		 152 aa  159  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1513  HxlR family transcriptional regulator  49.39 
 
 		 179 aa  158  7e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.351588 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4153  transcriptional regulator, HxlR family  53.69 
 
 		 160 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5126  HxlR family transcriptional regulator  54.23 
 
 		 152 aa  156  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3264  transcriptional regulator  51.06 
 
 		 148 aa  153  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.811578  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2035  HxlR family transcriptional regulator  50.71 
 
 		 154 aa  152  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.358691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4731  putative transcriptional regulator  52.08 
 
 		 147 aa  152  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3356  transcriptional regulator, HxlR family  55.56 
 
 		 150 aa  141  9e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5646  transcriptional regulator, HxlR family  54.68 
 
 		 150 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0382  transcriptional regulator, HxlR family  47.26 
 
 		 150 aa  137  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.230955 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1643  HxlR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 155 aa  125  5e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0771001  normal  0.50601 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3823  HxlR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 156 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0191  hypothetical protein  40.85 
 
 		 157 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4546  transcriptional regulator HxlR family  45.59 
 
 		 193 aa  118  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.013645  normal  0.292561 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3217  putative transcriptional regulator  42.18 
 
 		 170 aa  115  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01410  hypothetical protein  40.14 
 
 		 157 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1002  HxlR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 167 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.263517  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4116  HxlR family transcriptional regulator  50 
 
 		 163 aa  113  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.740581  normal  0.89012 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0274  helix-turn-helix HxlR type  50.46 
 
 		 157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.117164  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1750  HxlR family transcriptional regulator  46.02 
 
 		 175 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000237098  decreased coverage  0.000000333009 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1942  transcriptional regulator, HxlR family  41.67 
 
 		 168 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3325  putative transcriptional regulator  43.94 
 
 		 171 aa  108  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7474  transcriptional regulator, HxlR family  46.43 
 
 		 161 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5152  hypothetical protein  42.57 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727486 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4945  HxlR family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 164 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2675  HxlR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 172 aa  106  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46480  putative transcriptional regulator  41.96 
 
 		 168 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000073333  hitchhiker  0.000141221 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1756  transcriptional regulator, HxlR family  41.83 
 
 		 168 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0278537  normal  0.0530387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0318  transcriptional regulator, HxlR family  48.36 
 
 		 165 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5358  HxlR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 149 aa  105  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3652  HxlR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 164 aa  105  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229501  hitchhiker  9.17925e-19 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2459  transcriptional regulator, HxlR family  40.69 
 
 		 209 aa  105  8e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4650  putative transcriptional regulator  41.84 
 
 		 177 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.807438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2559  HxlR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 150 aa  104  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3459  HxlR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 171 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3059  hypothetical protein  40.29 
 
 		 170 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0185981  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5284  HxlR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 145 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0155969 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5397  transcriptional regulator, HxlR family  48.54 
 
 		 290 aa  102  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236016  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0237  hypothetical protein  42.22 
 
 		 177 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0235  hypothetical protein  40.15 
 
 		 172 aa  101  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13112  transcriptional regulator  52.17 
 
 		 158 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2587  transcriptional regulator, HxlR family  45.54 
 
 		 176 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29060  putative transcriptional regulator  45.63 
 
 		 159 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000757508 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2388  transcriptional regulator, HxlR family  51.09 
 
 		 148 aa  99.8  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501837  hitchhiker  0.00153924 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0945  transcriptional regulator, HxlR family  39.16 
 
 		 160 aa  99  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0206  transcriptional regulator, HxlR family  37.32 
 
 		 153 aa  98.6  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0541  hypothetical protein  34.81 
 
 		 165 aa  98.2  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000782637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0093  HxlR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 170 aa  98.2  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2492  transcriptional regulator family protein  34.64 
 
 		 212 aa  95.9  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2274  transcriptional regulator, HxlR family  48.7 
 
 		 161 aa  95.9  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05541  hypothetical protein  37.74 
 
 		 183 aa  95.5  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.12073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1651  HxlR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 160 aa  95.1  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1663  transcriptional regulator, HxlR family  44.95 
 
 		 280 aa  95.1  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.10638 
 
 
-
 
NC_003296  RS05500  hypothetical protein  42.27 
 
 		 162 aa  94.7  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.927375  normal  0.775818 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4724  HxlR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 162 aa  93.2  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3620  hypothetical protein  47.87 
 
 		 151 aa  92.4  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1563  HxlR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 162 aa  92.8  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1834  transcriptional regulator family  36.5 
 
 		 158 aa  92  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1224  transcriptional regulator, putative  36.5 
 
 		 158 aa  92  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2001  transcriptional regulatory protein  36.5 
 
 		 158 aa  92  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0795  putative transcriptional regulator  36.5 
 
 		 158 aa  92  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.1795  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3799  transcriptional regulator, HxlR family  47.92 
 
 		 143 aa  92  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.466699  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1709  putative transcriptional regulator  36.5 
 
 		 158 aa  92  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.285108  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0366  putative transcriptional regulator  36.5 
 
 		 158 aa  92  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>