More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0060 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0060  transcriptional regulator  100 
 
 		 255 aa  517  1e-146  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0820  ROK family protein  82.75 
 
 		 257 aa  432  1e-120  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1845  ROK family protein  56.49 
 
 		 255 aa  274  8e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2123  ROK family protein  54.62 
 
 		 260 aa  270  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.314652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0116  polyphosphate glucokinase  54.55 
 
 		 252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.112656  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2049  ROK family protein  54.39 
 
 		 258 aa  267  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1484  ROK family protein  52.92 
 
 		 254 aa  261  6e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240263  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16630  Polyphosphate glucokinase  51.81 
 
 		 282 aa  261  1e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0318617  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15220  Polyphosphate glucokinase  53.14 
 
 		 260 aa  260  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.981168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3319  ROK family protein  59.24 
 
 		 268 aa  258  4e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1811  polyphosphate glucokinase  55.02 
 
 		 262 aa  250  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0575  ROK domain-containing protein  51.6 
 
 		 270 aa  249  4e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.691285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6893  ROK family protein  51.22 
 
 		 244 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1252  polyphosphate--glucose phosphotransferase  49.21 
 
 		 281 aa  244  6.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000375629  normal  0.0353997 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1492  ROK family protein  50.43 
 
 		 271 aa  244  9.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.966105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12150  Polyphosphate glucokinase  50 
 
 		 255 aa  238  1e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00443256  normal  0.0995224 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3258  ROK family protein  49.59 
 
 		 248 aa  235  6e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0251232 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1879  ROK family protein  47.52 
 
 		 246 aa  229  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.585103  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2246  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  49.6 
 
 		 275 aa  228  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24320  Polyphosphate glucokinase  49.38 
 
 		 253 aa  227  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.168829 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3492  polyphosphate glucokinase  48.45 
 
 		 278 aa  227  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  0.544014 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12717  polyphosphate glucokinase ppgK  46.09 
 
 		 265 aa  219  3e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  44.35 
 
 		 267 aa  218  8.999999999999998e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.676103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2462  polyphosphate--glucose phosphotransferase  44.67 
 
 		 272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68042 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1510  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  46.53 
 
 		 253 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1865  Polyphosphate--glucose phosphotransferase  44.94 
 
 		 247 aa  211  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.246107  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13470  Polyphosphate glucokinase  45.63 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372457  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3604  ROK family protein  44.44 
 
 		 258 aa  206  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3938  polyphosphate--glucose phosphotransferase  46.35 
 
 		 255 aa  205  6e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.935107  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0069  ROK family protein  43.09 
 
 		 245 aa  201  6e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.590227  normal  0.282068 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3247  ROK family protein  41.46 
 
 		 247 aa  199  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.111578  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2186  polyphosphate glucokinase  43.9 
 
 		 269 aa  197  9e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2232  polyphosphate glucokinase  43.9 
 
 		 269 aa  197  9e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.257565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3763  ROK family protein  46.77 
 
 		 270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.876305  normal  0.616539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2175  polyphosphate glucokinase  43.9 
 
 		 269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.169057  decreased coverage  0.000830378 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1587  ROK family protein  45.89 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202681 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1588  polyphosphate glucokinase  43.97 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.846443  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1172  polyphosphate glucokinase  42.74 
 
 		 266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.198413  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3899  ROK family protein  33.6 
 
 		 235 aa  123  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.29454  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4014  polyphosphate glucokinase  32.92 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1677  ROK family protein  33.64 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0216  putative polyphosphate glucokinase  30.5 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7098  ROK family protein  31.3 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4521  ROK family protein  30.45 
 
 		 245 aa  98.6  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0974943  normal  0.196458 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2399  ROK family protein  31.02 
 
 		 270 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0758  ROK family protein  32.7 
 
 		 292 aa  96.7  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.022623  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  29.63 
 
 		 303 aa  96.7  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2621  ROK family protein  30 
 
 		 257 aa  89.4  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  29.53 
 
 		 300 aa  87.8  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  31.25 
 
 		 297 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  31.25 
 
 		 297 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4035  ROK family protein  29.02 
 
 		 274 aa  85.5  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  28.77 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  27.85 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  26.94 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  28.71 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5336  glucokinase  23.69 
 
 		 478 aa  77  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  26.62 
 
 		 297 aa  75.5  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  27.72 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3110  ROK family protein  27.91 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  27.48 
 
 		 316 aa  72  0.000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  27.76 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0657  ROK family protein  27.97 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.684537  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  26.73 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29410  transcriptional regulator/sugar kinase  26.56 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.180915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  33.33 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4004  putative transcriptional regulator  26 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.542016 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3880  putative transcriptional regulator  26 
 
 		 293 aa  68.9  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3959  putative transcriptional regulator  26 
 
 		 293 aa  68.9  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229726  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3895  putative transcriptional regulator  26 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4066  putative transcriptional regulator  25.33 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.407658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0150  ROK family protein  24.25 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.403108 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  28.21 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  30.72 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  26.03 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  31.44 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  27.09 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  31.28 
 
 		 335 aa  62  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  26.3 
 
 		 302 aa  62  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  29.06 
 
 		 321 aa  62  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  26.97 
 
 		 311 aa  62  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  27.68 
 
 		 417 aa  62  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3833  fructokinase  21.89 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  33.33 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  26.6 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  25.54 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2630  N-acetylglucosamine kinase  37.84 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2098  polyphosphate glucokinase  31.11 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1585  transcriptional regulator/sugar kinase  27.08 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0497  ROK family protein  24.91 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0229973  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  25 
 
 		 314 aa  58.9  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0091  ROK family protein  24.2 
 
 		 307 aa  58.5  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.097356  normal  0.137586 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1575  polyphosphate glucokinase  32.11 
 
 		 236 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  31.74 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2334  ROK family protein  29.03 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2047  ROK family protein  29.03 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  31.14 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0329  ROK family glucokinase  24.76 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3041  ROK family protein  33.54 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  33.13 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>