102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_3786 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_3786  transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  472  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0919672  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2212  cyclic nucleotide-binding protein  29.65 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2964  catabolite gene activator  30.88 
 
 		 231 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117686  normal  0.0504815 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2368  catabolite gene activator  28.95 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0336  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.03 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0158598  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3470  cyclic nucleotide-binding domain protein  28.89 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3165  transcriptional regulator  29.52 
 
 		 230 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603206  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3162  cyclic nucleotide-binding protein  29.52 
 
 		 230 aa  92  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.360418  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3228  transcriptional regulator  29.05 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000617944  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2419  catabolite gene activator  27.23 
 
 		 231 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3255  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.05 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00717521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3510  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.05 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3454  cyclic nucleotide-binding domain protein  29.05 
 
 		 230 aa  89  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.636337  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3481  cyclic nucleotide-binding domain protein  28.57 
 
 		 243 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0295032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1794  cyclic nucleotide-binding domain protein  28.1 
 
 		 230 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3461  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.1 
 
 		 230 aa  85.1  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308589  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5589  DNA-binding transcriptional activator YeiL  28.57 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5261  DNA-binding transcriptional activator YeiL  27.68 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00514717  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5106  DNA-binding transcriptional activator YeiL  27.68 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.888495  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5659  DNA-binding transcriptional activator YeiL  27.68 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5504  DNA-binding transcriptional activator YeiL  27.68 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5533  DNA-binding transcriptional activator YeiL  27.32 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5419  DNA-binding transcriptional activator YeiL  27.32 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5089  DNA-binding transcriptional activator YeiL  26.8 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5538  DNA-binding transcriptional activator YeiL  26.79 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5203  DNA-binding transcriptional activator YeiL  26.29 
 
 		 223 aa  62  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1300  cyclic nucleotide-binding protein  29.38 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02092  DNA-binding transcriptional activator of stationary phase nitrogen survival  21.76 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2460  DNA-binding transcriptional activator YeiL  21.76 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.572747  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1485  DNA-binding transcriptional activator YeiL  21.76 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0399687  hitchhiker  0.0009131 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2310  DNA-binding transcriptional activator YeiL  21.76 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.143581  decreased coverage  0.000186485 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02051  hypothetical protein  21.76 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1495  cyclic nucleotide-binding protein  21.76 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0722482  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3299  DNA-binding transcriptional activator YeiL  21.76 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0288775  normal  0.0803895 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2299  DNA-binding transcriptional activator YeiL  21.76 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.266371  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.73 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0349  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.48 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181532  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  18.46 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1894  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000758315  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3735  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.76 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  23.35 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2386  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.49 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0267635  normal  0.395563 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.52 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196856  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0388  cyclic nucleotide-binding protein  24.19 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  18.56 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3406  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.2 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.757412  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0206  transcriptional regulator  24.48 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000707778  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.58 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.91 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0981  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.14 
 
 		 246 aa  49.3  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0154476 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0857  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.04 
 
 		 229 aa  49.7  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3468  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.2 
 
 		 227 aa  49.3  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.1 
 
 		 228 aa  49.3  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 222 aa  49.3  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 214 aa  48.9  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.6 
 
 		 227 aa  48.5  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2066  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0111986  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.2 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0624  cAMP-regulatory protein  24.34 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0618  cAMP-regulatory protein  24.34 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000475791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3412  cAMP-regulatory protein  24.34 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000398691  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3292  cAMP-regulatory protein  24.34 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0112541  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0617  cAMP-regulatory protein  24.34 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000135204  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0585  cAMP-regulatory protein  24.34 
 
 		 211 aa  47.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000009188  normal  0.481967 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0652  cAMP-regulatory protein  24.34 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000433673  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3071  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.28 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00222127  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3004  cAMP-regulatory protein  24.34 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000032723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0578  cAMP-regulatory protein  24.34 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.001638  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3747  cAMP-regulatory protein  24.34 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0179283  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3873  cAMP-regulatory protein  24.34 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000159716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3690  cAMP-regulatory protein  24.34 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0119951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.05 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.51 
 
 		 224 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.65 
 
 		 241 aa  46.2  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0003  putative cyclic nucleotide binding protein  20.87 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000897853  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  16.58 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  19.09 
 
 		 225 aa  45.8  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  23.81 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000339306  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1784  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.28 
 
 		 240 aa  45.4  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3509  cAMP-regulatory protein  23.81 
 
 		 211 aa  45.4  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000247338  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  16.95 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3212  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.47 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0543887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  20.45 
 
 		 243 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  18.86 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3443  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.24 
 
 		 229 aa  45.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.57 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3873  cAMP-regulatory protein  23.28 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000105148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  17.89 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0436  transcription regulator  20.51 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0316636  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  18.78 
 
 		 220 aa  43.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  17.27 
 
 		 242 aa  42.4  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4219  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 219 aa  42.4  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.408304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.15 
 
 		 236 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  22.34 
 
 		 225 aa  42  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4550  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  21.63 
 
 		 238 aa  42  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0756  CRP/FNR family transcriptional regulator  20.11 
 
 		 220 aa  42  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  21.31 
 
 		 224 aa  42  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1499  cyclic nucleotide-binding protein  22.61 
 
 		 165 aa  42  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.191417  normal  0.714483 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  21.05 
 
 		 230 aa  41.6  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2580  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.86 
 
 		 231 aa  41.6  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.117752 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>