More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A2101 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A2101  putative DNA-binding protein  100 
 
 
286 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.326102  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  42.08 
 
 
300 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1137  transcriptional regulator, AraC family  27.78 
 
 
287 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000101216  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4704  putative DNA-binding protein  29.03 
 
 
274 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000153171  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1312  AraC family transcriptional regulator  30.47 
 
 
309 aa  100  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  25.87 
 
 
300 aa  100  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  27.57 
 
 
302 aa  100  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3508  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
196 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0210792  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2786  AraC family transcriptional regulator  40.14 
 
 
411 aa  90.1  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173826  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3497  AraC family transcriptional regulator  43.88 
 
 
198 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.27794  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  26.72 
 
 
282 aa  86.3  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  43.88 
 
 
291 aa  86.3  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3751  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  41.84 
 
 
198 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000128468 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1459  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  38.78 
 
 
198 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000164097 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  30.06 
 
 
331 aa  85.5  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0474  AraC family transcriptional regulator  26.61 
 
 
284 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1165  AraC family transcriptional regulator  25.2 
 
 
278 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3840  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  38.78 
 
 
198 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001016  transcriptional regulator AraC/XylS family  24.36 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0540486  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1428  transcriptional regulator, AraC family  23.72 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  26.19 
 
 
316 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3788  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  40.82 
 
 
198 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3772  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  41.84 
 
 
198 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3585  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  40.82 
 
 
198 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3485  AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 
198 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.781082  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07095  hypothetical protein  24.8 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3869  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  40.82 
 
 
198 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3070  helix-turn-helix domain-containing protein  32.31 
 
 
131 aa  82.8  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362329  normal  0.0397869 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01665  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.34 
 
 
303 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5582  transcriptional regulator, AraC family  24.2 
 
 
272 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2788  transcriptional regulator, AraC family  41.07 
 
 
408 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435011  hitchhiker  0.0000000035636 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0841  transcriptional regulator, AraC family  29.12 
 
 
300 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2431  AraC protein arabinose-binding/dimerisation  26.25 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.690566  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01654  hypothetical protein  27.34 
 
 
303 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4578  AraC family transcriptional regulator  38.18 
 
 
409 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0591899  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 
361 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2535  transcriptional regulator, AraC family  41.07 
 
 
408 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1935  AraC family transcriptional regulator  27.34 
 
 
303 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0147604 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3855  AraC family transcriptional regulator  23.79 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3104  AraC family transcriptional regulator  24.68 
 
 
282 aa  80.5  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1451  transcriptional regulator, AraC family protein  26.24 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0743909  normal  0.362871 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  28.08 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1817  transcriptional regulator, AraC family protein  26.24 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.246217  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1467  AraC family transcriptional regulator  26.24 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.145729 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2497  AraC family transcriptional regulator  20 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190674  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0219  helix-turn-helix domain-containing protein  37.37 
 
 
293 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.882333  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1946  transcriptional regulator, AraC family  27.34 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.192766  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1899  transcriptional regulator, AraC family  27.34 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1001  transcriptional regulator, AraC family  23.53 
 
 
307 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1500  AraC family transcriptional regulator  27.34 
 
 
303 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.831009  normal  0.0187399 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  25.74 
 
 
279 aa  80.1  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2412  transcriptional regulator, AraC family  27.34 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1912  AraC family transcriptional regulator  27.34 
 
 
303 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4562  AraC family transcriptional regulator  37.27 
 
 
409 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00627934  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4098  AraC family transcriptional regulator  24.4 
 
 
280 aa  79.3  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424275 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4969  transcriptional regulator, AraC family  37.27 
 
 
409 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5603  AraC family transcriptional regulator  35.04 
 
 
409 aa  79  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2237  putative transcriptional regulator  24.64 
 
 
278 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  24.64 
 
 
278 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3439  AraC family transcriptional regulator  20.73 
 
 
282 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  30 
 
 
291 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  24.82 
 
 
278 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3115  helix-turn-helix domain-containing protein  34.04 
 
 
412 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  35.87 
 
 
1201 aa  77  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  24.76 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1393  transcriptional regulator, AraC family  23.95 
 
 
303 aa  76.6  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0236  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  22.62 
 
 
299 aa  75.9  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  27 
 
 
292 aa  75.9  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  40.38 
 
 
519 aa  75.9  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3428  transcriptional regulator, AraC family  22.83 
 
 
265 aa  75.9  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  32.67 
 
 
293 aa  75.9  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  23.03 
 
 
287 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3583  transcriptional regulator AraC family  26.71 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1984  transcriptional regulator, AraC family  32.99 
 
 
275 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.626531  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  25.57 
 
 
278 aa  75.1  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0353  MSM (multiple sugar metabolism) operon regulatory protein  25.33 
 
 
301 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2638  transcriptional regulator, AraC family  26.27 
 
 
282 aa  75.1  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1486  AraC family transcriptional regulator  25.48 
 
 
296 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.012343 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  25.2 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1573  transcriptional regulator MmsR  20.24 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2976  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00165868  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 
316 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18110  transcriptional regulator MmsR  19.43 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54610  putative transcriptional regulator  20.97 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.53981  normal  0.0153543 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  24.82 
 
 
330 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  23.32 
 
 
286 aa  74.7  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  25.87 
 
 
332 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6183  AraC family transcriptional regulator  24.43 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.531587 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1254  AraC family transcriptional regulator  23.89 
 
 
308 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 
157 aa  73.9  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  21.79 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0709  AraC family transcriptional regulator  24.45 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6578  AraC family transcriptional regulator  23.89 
 
 
308 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 
513 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  25.55 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 
338 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  30.56 
 
 
515 aa  72.8  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>