More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5586 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5586  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 441 aa  862    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14863  normal  0.124854 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7255  major facilitator superfamily MFS_1  37.67 
 
 		 448 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4313  major facilitator transporter  37.73 
 
 		 431 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1722  major facilitator transporter  36.14 
 
 		 433 aa  253  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0389181  normal  0.259403 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3156  major facilitator transporter  35.59 
 
 		 438 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2715  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.66 
 
 		 429 aa  237  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.618209 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5295  major facilitator superfamily MFS_1  34.05 
 
 		 428 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2482  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 432 aa  233  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0541  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 444 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24945  hitchhiker  0.0000121127 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5940  major facilitator transporter  37.08 
 
 		 433 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.054012 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3887  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 432 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.218515 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4395  major facilitator transporter  33.74 
 
 		 434 aa  226  9e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.301682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3702  major facilitator transporter  33.88 
 
 		 431 aa  223  7e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0165127  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2040  major facilitator family transporter  33.88 
 
 		 431 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0687  major facilitator superfamily permease  34.4 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4685  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 428 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1970  major facilitator transporter  34.98 
 
 		 440 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.782134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1720  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 474 aa  182  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4524  major facilitator transporter  31.53 
 
 		 441 aa  170  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281062  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0221  major facilitator transporter  30.8 
 
 		 431 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 429 aa  110  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 436 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 432 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4209  major facilitator superfamily MFS_1  30.86 
 
 		 435 aa  105  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2448  major facilitator transporter  28.47 
 
 		 409 aa  104  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.581947  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 443 aa  104  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 428 aa  104  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 436 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 429 aa  103  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 436 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 436 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 436 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  25.56 
 
 		 447 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 447 aa  103  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2158  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 447 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2945  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 436 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 438 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2837  major facilitator family transporter  26.43 
 
 		 436 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00238614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 429 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 452 aa  97.4  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5920  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 435 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0977977  normal  0.252353 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 430 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  23.37 
 
 		 442 aa  95.5  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  25.79 
 
 		 430 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 438 aa  94.7  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 430 aa  94.4  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 420 aa  94  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 429 aa  93.2  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 430 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0243  major facilitator transporter  24.37 
 
 		 410 aa  92.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 430 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 434 aa  92  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  24.75 
 
 		 427 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 450 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 428 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2612  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 433 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.209857  normal  0.81136 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 430 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  25.24 
 
 		 428 aa  89.7  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  26.69 
 
 		 440 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  24.92 
 
 		 433 aa  88.6  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  27.19 
 
 		 439 aa  88.2  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1666  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 411 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  24.61 
 
 		 419 aa  86.3  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 440 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 439 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 440 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2219  major facilitator superfamily MFS_1  25.61 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.200056 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 425 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.28 
 
 		 460 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 439 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2215  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  25 
 
 		 436 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 439 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3045  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 435 aa  84  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2277  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 431 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 425 aa  83.6  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  26.64 
 
 		 448 aa  83.2  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 431 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 439 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 428 aa  82  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 436 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 		 449 aa  82.4  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 439 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  24.25 
 
 		 449 aa  82  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 455 aa  82  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  25 
 
 		 436 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 426 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1252  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.117112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  24.54 
 
 		 460 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 426 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  23.79 
 
 		 460 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  23.83 
 
 		 424 aa  80.9  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 427 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1981  major facilitator superfamily 2- ketogluconate transporter  26.97 
 
 		 429 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5151  d-galactonate transporter  25.33 
 
 		 451 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 426 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 479 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1745  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734469 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>