More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3364 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3364  conjugal transfer protein trbB  100 
 
 		 326 aa  634    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.538744 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0749  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  80.95 
 
 		 327 aa  511  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.641602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7741  conjugal transfer protein trbB  81.65 
 
 		 327 aa  509  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.685768 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2878  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  81.27 
 
 		 327 aa  509  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0715794 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0699  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  78.77 
 
 		 326 aa  504  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3901  type II secretion system protein E  79.45 
 
 		 322 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3851  type II secretion system protein E  79.19 
 
 		 327 aa  502  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296178  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3827  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  83.33 
 
 		 321 aa  502  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1194  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  78.83 
 
 		 327 aa  500  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.442732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3541  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  78.83 
 
 		 327 aa  500  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0509  type II secretion system protein E  79.75 
 
 		 329 aa  499  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.77324  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3004  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  78.48 
 
 		 342 aa  496  1e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.803505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1484  type II secretion system protein E  81.33 
 
 		 332 aa  495  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.307277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1500  conjugal transfer protein trbB  79.05 
 
 		 327 aa  493  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3541  type II secretion system protein E  79.43 
 
 		 322 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0478777  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2324  type II secretion system protein E  79.43 
 
 		 327 aa  491  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0156  type II secretion system protein E  80 
 
 		 334 aa  492  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0808  type II secretion system protein E  76.76 
 
 		 326 aa  490  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4000  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  79.05 
 
 		 328 aa  489  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3212  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  82.24 
 
 		 332 aa  490  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0166332  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3086  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  78.16 
 
 		 343 aa  485  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0595  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  77.85 
 
 		 328 aa  484  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3194  type II secretion system protein E  78.76 
 
 		 334 aa  482  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.653362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3691  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  76.25 
 
 		 328 aa  475  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1013  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  76.34 
 
 		 322 aa  475  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7440  conjugal transfer protein trbB  78.67 
 
 		 305 aa  474  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0318  type II secretion system protein E  78.29 
 
 		 327 aa  474  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0504933  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0966  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  75.08 
 
 		 334 aa  467  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2614  type II secretion system protein E  78.37 
 
 		 327 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2824  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  78.23 
 
 		 329 aa  460  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2485  type II secretion system protein E  73.01 
 
 		 327 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0161  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  69.23 
 
 		 323 aa  404  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.654674 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2268  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  68.85 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1835  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  63.43 
 
 		 325 aa  378  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2027  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  61.76 
 
 		 333 aa  368  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4195  type II secretion system protein E  63.7 
 
 		 343 aa  353  2e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35720  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  62.42 
 
 		 350 aa  350  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.469898  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2004  type II secretion system protein E  61.86 
 
 		 348 aa  347  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2645  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  61.22 
 
 		 345 aa  346  3e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2584  conjugal transfer protein TrbB  62.62 
 
 		 355 aa  345  4e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2911  type II secretion system protein E  60.95 
 
 		 344 aa  345  5e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3506  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  62.3 
 
 		 344 aa  345  8e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.19636  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1341  type II secretion system protein E  61.02 
 
 		 354 aa  345  8.999999999999999e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2699  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  62.3 
 
 		 344 aa  344  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2350  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  60.51 
 
 		 351 aa  343  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.526616 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3706  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  60.7 
 
 		 350 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.557258  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0438  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  60.44 
 
 		 353 aa  344  2e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1282  type II secretion system protein E  62.3 
 
 		 356 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0726  type II secretion system protein E  61.56 
 
 		 349 aa  342  5e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1550  type II secretion system protein E  60.9 
 
 		 358 aa  342  7e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00260971  normal  0.700306 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1895  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  59.81 
 
 		 356 aa  340  1e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30940  putative conjugal transfer protein  61.51 
 
 		 356 aa  340  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128533  unclonable  3.72388e-22 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2351  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  56.61 
 
 		 325 aa  317  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5330  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  53.14 
 
 		 320 aa  301  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.548363 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5159  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  52.63 
 
 		 318 aa  281  8.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5376  conjugal transfer protein TrbB  46.98 
 
 		 325 aa  263  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.873553  normal  0.169831 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9269  conjugal transfer protein TrbB  48.03 
 
 		 323 aa  260  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4569  conjugal transfer protein TrbB  49.84 
 
 		 329 aa  259  3e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5482  conjugal transfer protein TrbB  48.34 
 
 		 321 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8334  conjugal transfer protein TrbB  47.7 
 
 		 323 aa  252  7e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222514  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4690  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  45.25 
 
 		 310 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2497  type II secretion system protein E  46.15 
 
 		 321 aa  245  6e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2265  conjugal transfer ATPase TrbB  45.28 
 
 		 320 aa  244  9.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000182151  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0688  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  47.04 
 
 		 309 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6502  conjugal transfer ATPase TrbB  45.78 
 
 		 320 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000848029  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6635  conjugal transfer ATPase TrbB  45.78 
 
 		 320 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000001277  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0047  conjugal transfer ATPase TrbB  44.37 
 
 		 366 aa  239  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.435739  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1334  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  44.48 
 
 		 322 aa  236  3e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0908976 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0244  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  45.49 
 
 		 322 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1720  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  46.6 
 
 		 329 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00147948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1634  P-type conjugative transfer protein TrbB  44.15 
 
 		 322 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0899884  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1183  type II secretion system protein E  40 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0892  type II secretion system protein E  39.16 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9661  conjugal transfer protein TrbB  46.69 
 
 		 320 aa  227  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2346  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  44.08 
 
 		 325 aa  225  9e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4274  conjugal transfer ATPase TrbB  43.18 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  1.39641e-17  normal  0.780952 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1622  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  43.12 
 
 		 346 aa  195  7e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  38.33 
 
 		 464 aa  169  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  38.77 
 
 		 438 aa  165  9e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  38.19 
 
 		 445 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  37.79 
 
 		 441 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5226  type II secretion system protein E  35.57 
 
 		 332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.445343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  36.54 
 
 		 468 aa  163  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  36.79 
 
 		 455 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  36.36 
 
 		 491 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  38 
 
 		 455 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4437  type II secretion system protein E  37.46 
 
 		 349 aa  159  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  36.03 
 
 		 491 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  38.21 
 
 		 445 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  37.91 
 
 		 440 aa  159  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  37.67 
 
 		 455 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  38.8 
 
 		 491 aa  158  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  36.79 
 
 		 478 aa  158  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  39.23 
 
 		 482 aa  158  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  36.45 
 
 		 454 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  36.45 
 
 		 454 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  35.31 
 
 		 572 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  36.45 
 
 		 454 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  35.76 
 
 		 433 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  39.34 
 
 		 440 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>