237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0471 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4602  hydrogenase maturation protein HypF  52.48 
 
 		 786 aa  824    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.879827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4555  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  47.94 
 
 		 785 aa  636    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0535  hydrogenase maturation protein HypF  49.49 
 
 		 812 aa  712    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0860  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  50.26 
 
 		 803 aa  729    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.729638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3207  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  57.53 
 
 		 793 aa  869    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0792  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  52.42 
 
 		 785 aa  821    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0712  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  50.26 
 
 		 803 aa  729    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0469  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  51.94 
 
 		 818 aa  790    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.77158  normal  0.0779955 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3753  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  67.29 
 
 		 809 aa  1103    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3875  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  51.72 
 
 		 781 aa  828    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3377  nickel-dependent hydrogenase, large subunit  47.6 
 
 		 758 aa  637    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.457459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0471  carbamoyl phosphate phosphatase, (NiFe) hydrogenase maturation protein  100 
 
 		 824 aa  1675    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0655217 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0341  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  47.12 
 
 		 763 aa  593  1e-168  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.744113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2780  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.32 
 
 		 780 aa  586  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3096  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  47.33 
 
 		 749 aa  587  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07990  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.81 
 
 		 762 aa  581  1e-164  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.442936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2145  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  46.16 
 
 		 758 aa  582  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.252172  normal  0.367666 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1148  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.88 
 
 		 779 aa  578  1.0000000000000001e-163  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0494  hydrogenase maturation factor F  46.29 
 
 		 758 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3070  hydrogenase maturation protein HypF  39.15 
 
 		 776 aa  569  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3313  hydrogenase maturation protein HypF  39.15 
 
 		 776 aa  569  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3291  hydrogenase maturation protein HypF  39.39 
 
 		 776 aa  569  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1950  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.77 
 
 		 756 aa  572  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1645  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.69 
 
 		 773 aa  569  1e-161  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2523  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.08 
 
 		 769 aa  566  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0264789  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3809  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.18 
 
 		 775 aa  566  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0483302  normal  0.0563214 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1214  hydrogenase maturation protein HypF  40.97 
 
 		 763 aa  566  1e-160  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0119  hydrogenase maturation protein HypF  42.75 
 
 		 760 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0111799  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1432  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  40.85 
 
 		 763 aa  560  1e-158  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0306  hydrogenase maturation protein HypF  42.56 
 
 		 763 aa  560  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2423  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.02 
 
 		 765 aa  555  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.344696 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1847  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.13 
 
 		 779 aa  553  1e-156  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.962683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1422  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.63 
 
 		 766 aa  553  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1240  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.9 
 
 		 763 aa  554  1e-156  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03890  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.44 
 
 		 751 aa  554  1e-156  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3185  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.78 
 
 		 751 aa  551  1e-155  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3132  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.09 
 
 		 758 aa  544  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2179  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.66 
 
 		 767 aa  545  1e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.474067 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0462  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.15 
 
 		 790 aa  545  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.336397  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3682  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.75 
 
 		 780 aa  545  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3588  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.41 
 
 		 776 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0080  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.52 
 
 		 741 aa  540  9.999999999999999e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.442925  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4584  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  44.28 
 
 		 774 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1130  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.93 
 
 		 758 aa  536  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2556  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.88 
 
 		 776 aa  539  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.34978  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1643  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.3 
 
 		 778 aa  531  1e-149  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1785  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.61 
 
 		 764 aa  528  1e-148  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00144703  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4013  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.83 
 
 		 770 aa  528  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.31364 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0722  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.15 
 
 		 773 aa  527  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.180457  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1764  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.43 
 
 		 767 aa  527  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2526  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.21 
 
 		 780 aa  526  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.908669  normal  0.241645 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1787  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.25 
 
 		 766 aa  522  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2009  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.95 
 
 		 773 aa  524  1e-147  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0533  hydrogenase maturation protein HypF  39.14 
 
 		 749 aa  519  1e-146  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.515959  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0518  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.77 
 
 		 781 aa  521  1e-146  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.843265 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2123  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.38 
 
 		 752 aa  521  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0252603 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2182  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.64 
 
 		 752 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.64195  normal  0.285243 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0466  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.73 
 
 		 778 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.252806  normal  0.0404368 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3065  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.92 
 
 		 740 aa  514  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.735347  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2136  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.47 
 
 		 745 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3636  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.31 
 
 		 758 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3151  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  41.86 
 
 		 746 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.114477 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2996  carbamoyltransferase HypF  41.09 
 
 		 750 aa  503  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3044  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  41.86 
 
 		 746 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0442522 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3962  carbamoyltransferase HypF  41.21 
 
 		 766 aa  505  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0504  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.24 
 
 		 773 aa  504  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1000  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.09 
 
 		 750 aa  502  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948603 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0977  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.01 
 
 		 750 aa  499  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.229585  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2593  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.91 
 
 		 773 aa  501  1e-140  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00540  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.28 
 
 		 785 aa  501  1e-140  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.48639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0476  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.6 
 
 		 773 aa  502  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3165  carbamoyltransferase HypF  40.98 
 
 		 750 aa  500  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3446  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.01 
 
 		 764 aa  502  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.629954 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2550  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  43.13 
 
 		 818 aa  499  1e-140  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51841  normal  0.259672 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2962  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  41.86 
 
 		 746 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2993  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  41.6 
 
 		 746 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.017038 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02562  carbamoyl phosphate phosphatase and maturation protein for [NiFe] hydrogenases  41.09 
 
 		 750 aa  498  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2394  hydrogenase maturation protein HypF  37.95 
 
 		 741 aa  498  1e-139  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3028  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  41.6 
 
 		 746 aa  498  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000447787 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3230  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.85 
 
 		 783 aa  499  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02527  hypothetical protein  41.09 
 
 		 750 aa  498  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2835  [NiFe] hydrogenase maturation protein HypF  41.27 
 
 		 762 aa  497  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0257983 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2848  carbamoyltransferase HypF  41.09 
 
 		 750 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2539  hydrogenase maturation protein HypF  37.38 
 
 		 741 aa  491  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2051  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.02 
 
 		 849 aa  491  1e-137  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0555  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.19 
 
 		 777 aa  487  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4097  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.28 
 
 		 789 aa  489  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0310  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.72 
 
 		 792 aa  488  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0509  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  42.99 
 
 		 773 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1399  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.96 
 
 		 775 aa  483  1e-135  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.159442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1674  hydrogenase maturation protein HypF  36.64 
 
 		 771 aa  486  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1218  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  37.45 
 
 		 762 aa  484  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0610478 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3016  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  38.57 
 
 		 753 aa  484  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4514  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  41.91 
 
 		 788 aa  484  1e-135  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.47049 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1303  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.29 
 
 		 781 aa  482  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.083014  normal  0.0845078 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7272  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.25 
 
 		 791 aa  480  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.270214 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1537  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  40.53 
 
 		 785 aa  479  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0523392  normal  0.0813171 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2017  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  39.8 
 
 		 773 aa  482  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3977  hydrogenase maturation protein HypF  39.42 
 
 		 763 aa  478  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1760  (NiFe) hydrogenase maturation protein HypF  36.59 
 
 		 781 aa  478  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>