More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0658 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0658  putative glutamate/aspartate ABC transporter, permease protein/periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  100 
 
 
460 aa  946    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000641362  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0659  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  98.28 
 
 
302 aa  588  1e-167  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147361  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0691  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  98.28 
 
 
302 aa  588  1e-167  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000300559  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0657  glutamate/aspartate ABC transporter, permease protein GltJ  81.78 
 
 
250 aa  370  1e-101  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000679561  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0609  extracellular solute-binding protein  64.11 
 
 
299 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.157443  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0690  glutamate/aspartate ABC transporter, permease protein GltJ  81.78 
 
 
250 aa  370  1e-101  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000599534  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1219  extracellular solute-binding protein  62.54 
 
 
373 aa  365  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0588  extracellular solute-binding protein family 3  63.76 
 
 
299 aa  366  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1364  extracellular solute-binding protein  62.37 
 
 
299 aa  357  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2688  extracellular solute-binding protein  61.84 
 
 
300 aa  355  6.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.606467 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4024  extracellular solute-binding protein  57.45 
 
 
298 aa  355  1e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000078041 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0828  extracellular solute-binding protein family 3  61.68 
 
 
300 aa  348  9e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4073  extracellular solute-binding protein  60.71 
 
 
300 aa  345  8.999999999999999e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.618665  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3904  extracellular solute-binding protein  56.03 
 
 
298 aa  338  1.9999999999999998e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000111161  normal  0.107896 
 
 
 
NC_008781  Pnap_3458  extracellular solute-binding protein  57.25 
 
 
299 aa  335  1e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0990  extracellular solute-binding protein  55.52 
 
 
304 aa  333  3e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0443  amino-acid ABC transporter binding protein  55.28 
 
 
297 aa  330  3e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.398144  normal  0.303306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5673  extracellular solute-binding protein  44.88 
 
 
299 aa  287  2.9999999999999996e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5026  extracellular solute-binding protein family 3  50.36 
 
 
303 aa  284  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0311  extracellular solute-binding protein family 3  48 
 
 
301 aa  281  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1546  extracellular solute-binding protein family 3  45.56 
 
 
295 aa  262  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2000  extracellular solute-binding protein  44.44 
 
 
294 aa  257  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4737  extracellular solute-binding protein  44.81 
 
 
296 aa  256  6e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.765927  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2798  extracellular solute-binding protein  43.66 
 
 
305 aa  248  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.610128  normal  0.6873 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1937  extracellular solute-binding protein  44.36 
 
 
295 aa  247  4e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00990957 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0070  extracellular solute-binding protein  43.87 
 
 
293 aa  246  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0205  extracellular solute-binding protein  44.09 
 
 
305 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0564  extracellular solute-binding protein  42.91 
 
 
297 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0372  extracellular solute-binding protein family 3  42.81 
 
 
302 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.227488  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3755  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  42.55 
 
 
297 aa  239  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0788  extracellular solute-binding protein  44.58 
 
 
358 aa  240  5e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00176914  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0357  extracellular solute-binding protein family 3  42.45 
 
 
302 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.305977  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2714  extracellular solute-binding protein  42.55 
 
 
297 aa  239  8e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.784297 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0636  extracellular solute-binding protein  42.91 
 
 
297 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0590  extracellular solute-binding protein  42.2 
 
 
297 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.325477 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0186  extracellular solute-binding protein  42.55 
 
 
297 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.947811  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0669  extracellular solute-binding protein  42.55 
 
 
297 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6104  extracellular solute-binding protein  40.07 
 
 
289 aa  237  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236954  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0597  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic ligand binding protein  42.55 
 
 
297 aa  237  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.857613  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3601  extracellular solute-binding protein family 3  44.8 
 
 
304 aa  235  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0485295  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0457  extracellular solute-binding protein  43.28 
 
 
299 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3991  extracellular solute-binding protein  40.43 
 
 
298 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.100601  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3362  extracellular solute-binding protein family 3  42.18 
 
 
297 aa  234  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00667639  hitchhiker  0.00000266778 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1284  extracellular solute-binding protein  40.43 
 
 
298 aa  234  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4455  extracellular solute-binding protein  40.43 
 
 
298 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.104292  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2573  extracellular solute-binding protein  41.82 
 
 
297 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0113062 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0481  amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  41.07 
 
 
313 aa  233  5e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2261  putative amino-acid-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  42.6 
 
 
308 aa  233  6e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.326987 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3396  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  41.42 
 
 
328 aa  232  9e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3431  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  41.42 
 
 
328 aa  232  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2073  extracellular solute-binding protein family 3  42.39 
 
 
307 aa  232  9e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00884653  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3434  glutamate/aspartate periplasmic binding protein precursor  41.42 
 
 
297 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.110135  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0399  extracellular solute-binding protein  42.54 
 
 
299 aa  232  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2466  extracellular solute-binding protein family 3  41.37 
 
 
307 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3932  extracellular solute-binding protein family 3  41.88 
 
 
297 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5742  extracellular solute-binding protein  40.37 
 
 
298 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130247  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1225  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  41.04 
 
 
298 aa  231  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.905296  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3806  extracellular solute-binding protein  40.37 
 
 
298 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0303858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4562  extracellular solute-binding protein  40.37 
 
 
298 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2953  extracellular solute-binding protein family 3  40.86 
 
 
297 aa  228  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2212  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  43.66 
 
 
359 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1214  glutamate and aspartate transporter subunit  40.65 
 
 
298 aa  229  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.839124  normal  0.912461 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1237  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  43.66 
 
 
299 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.688343  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1934  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  43.66 
 
 
298 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0304  solute-binding family 1 protein  43.66 
 
 
299 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1669  glutamate/aspartate periplasmic binding protein precursor  43.66 
 
 
299 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0949  putative glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  43.66 
 
 
298 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1182  glutamate and aspartate transporter subunit  40.21 
 
 
301 aa  228  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0650836 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0214  solute-binding family 1 protein  43.66 
 
 
299 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4081  extracellular solute-binding protein  40.3 
 
 
298 aa  227  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1192  glutamate and aspartate transporter subunit  40.29 
 
 
298 aa  227  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1475  extracellular solute-binding protein family 3  38.77 
 
 
297 aa  227  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.027912  hitchhiker  0.000000000119497 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1103  extracellular solute-binding protein family 3  40 
 
 
298 aa  226  6e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2089  extracellular solute-binding protein  39.35 
 
 
306 aa  226  7e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.881502  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3139  glutamate and aspartate transporter subunit  39.44 
 
 
298 aa  226  7e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2212  extracellular solute-binding protein  39.35 
 
 
330 aa  226  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00623  glutamate and aspartate transporter subunit  40.3 
 
 
302 aa  223  7e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00613  hypothetical protein  40.3 
 
 
302 aa  223  7e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2990  glutamate and aspartate transporter subunit  40.3 
 
 
302 aa  222  9e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0748  glutamate and aspartate transporter subunit  40.3 
 
 
302 aa  222  9e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0700  glutamate and aspartate transporter subunit  40.3 
 
 
302 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3010  glutamate and aspartate transporter subunit  38.81 
 
 
305 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.197195  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0222  glutamate/aspartate ABC transporter, periplasmic glutamate/aspartate-binding protein  42.16 
 
 
299 aa  221  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2920  glutamate and aspartate transporter subunit  38.81 
 
 
305 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.847133  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0819  glutamate and aspartate transporter subunit  39.15 
 
 
302 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0783  glutamate and aspartate transporter subunit  39.15 
 
 
302 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.131708  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1835  glutamate and aspartate transporter subunit  38.81 
 
 
305 aa  220  3e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0709  glutamate and aspartate transporter subunit  39.15 
 
 
302 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1560  extracellular solute-binding protein family 3  40.3 
 
 
302 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000128549  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0723  glutamate and aspartate transporter subunit  39.15 
 
 
302 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0770  glutamate and aspartate transporter subunit  39.15 
 
 
302 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1127  extracellular solute-binding protein  38.73 
 
 
297 aa  220  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.164793  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0334  extracellular solute-binding protein  39.64 
 
 
330 aa  220  5e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0676  glutamate and aspartate transporter subunit  39.93 
 
 
302 aa  220  5e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5483  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  38.49 
 
 
306 aa  219  6e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.266855  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5962  extracellular solute-binding protein family 3  38.27 
 
 
291 aa  219  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0683  glutamate and aspartate transporter subunit  39.93 
 
 
302 aa  219  6e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0303  ABC glutamate/aspartate transporter, periplasmic binding protein GltI  39.27 
 
 
319 aa  219  7e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4171  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  38.99 
 
 
308 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2971  extracellular solute-binding protein family 3  39.55 
 
 
302 aa  218  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.871919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>