195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_46720 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_46720  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  325  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177196  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  69.18 
 
 
149 aa  192  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30820  hypothetical protein  68.15 
 
 
133 aa  179  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  44.88 
 
 
149 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  41.67 
 
 
147 aa  96.7  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  45.13 
 
 
145 aa  93.6  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2963  hypothetical protein  53.15 
 
 
149 aa  91.3  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193953  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3181  hypothetical protein  36.97 
 
 
139 aa  90.5  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  46.3 
 
 
145 aa  87.4  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  44.35 
 
 
151 aa  85.5  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2276  hypothetical protein  43 
 
 
164 aa  85.1  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4623  protein of unknown function DUF336  44.59 
 
 
150 aa  85.1  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3547  protein of unknown function DUF336  44.59 
 
 
150 aa  85.1  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.220532  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  41.82 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0219  hypothetical protein  48.08 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5688  hypothetical protein  46.15 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  40.15 
 
 
133 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1173  hypothetical protein  38.98 
 
 
167 aa  72  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2788  hypothetical protein  43.24 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.31371 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  34.33 
 
 
143 aa  70.1  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1036  protein of unknown function DUF336  31.65 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0677  protein of unknown function DUF336  35.61 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2459  protein of unknown function DUF336  35.56 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  38.35 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  37.59 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  37.59 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0282  protein of unknown function DUF336  35.54 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4277  hypothetical protein  34.97 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391186  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3631  hypothetical protein  32.64 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  35.53 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4099  protein of unknown function DUF336  36.75 
 
 
170 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4739  protein of unknown function DUF336  30.94 
 
 
147 aa  63.2  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.285163  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1953  hypothetical protein  36.36 
 
 
135 aa  61.2  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.456694  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1295  protein of unknown function DUF336  39.81 
 
 
143 aa  61.2  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4352  hypothetical protein  38.41 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2996  protein of unknown function DUF336  34.38 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2812  hypothetical protein  32.2 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2769  hypothetical protein  30.83 
 
 
133 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.816644  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  38.39 
 
 
171 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0106  hypothetical protein  33.64 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.764125  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19040  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  33.33 
 
 
140 aa  58.9  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.631262  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  35.04 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3026  hypothetical protein  38.24 
 
 
132 aa  58.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1348  hypothetical protein  40.52 
 
 
145 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.334231 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  36.3 
 
 
174 aa  57.8  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3414  hypothetical protein  35.51 
 
 
142 aa  57.8  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00846619  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  33.86 
 
 
132 aa  57.4  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  33.58 
 
 
144 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4028  hypothetical protein  31.21 
 
 
165 aa  57  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586797  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1323  hypothetical protein  32.58 
 
 
143 aa  57  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.414702  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3055  hypothetical protein  33.93 
 
 
139 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5732  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  33.1 
 
 
137 aa  56.6  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0124  hypothetical protein  36.84 
 
 
143 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2518  protein of unknown function DUF336  31.2 
 
 
158 aa  55.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.752864  normal  0.0269404 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0738  hypothetical protein  30.91 
 
 
136 aa  55.5  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0771443  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3856  hypothetical protein  38.78 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.515837  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2095  hypothetical protein  32.09 
 
 
142 aa  55.1  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1228  protein of unknown function DUF336  31.25 
 
 
140 aa  55.1  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805694  normal  0.150443 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  33.09 
 
 
181 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4631  protein of unknown function DUF336  31.25 
 
 
138 aa  55.1  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000144954  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  33.33 
 
 
167 aa  55.1  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3227  cellulose binding, type IV  33.57 
 
 
144 aa  55.1  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.749428  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2442  protein of unknown function DUF336  34.23 
 
 
135 aa  55.1  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0309341 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1471  hypothetical protein  34.07 
 
 
133 aa  54.3  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.737997 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4941  hypothetical protein  34.86 
 
 
134 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0453333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  40 
 
 
121 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2228  hypothetical protein  36.89 
 
 
160 aa  53.9  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.663673 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1475  protein of unknown function DUF336  42.99 
 
 
145 aa  53.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  29.23 
 
 
170 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1827  hypothetical protein  33.11 
 
 
159 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3867  hypothetical protein  40.21 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0962828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4502  hypothetical protein  40.21 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3305  hypothetical protein  31.5 
 
 
140 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7427  hypothetical protein  30.28 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0942476  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  28.68 
 
 
157 aa  53.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1796  protein of unknown function DUF336  33.6 
 
 
137 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.240895  normal  0.714082 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5801  hypothetical protein  40.21 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4296  hypothetical protein  33.94 
 
 
146 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490359  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0885  glcG protein  32.69 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.916752  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1925  glcG protein  32.69 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2031  glcG protein  31.73 
 
 
136 aa  53.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2120  protein of unknown function DUF336  33.88 
 
 
137 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.309036  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5494  hypothetical protein  34.86 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561658  hitchhiker  0.000385324 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2572  hypothetical protein  33.04 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0331856  decreased coverage  0.000119045 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2410  hypothetical protein  33.64 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.834158  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1744  glcG protein  32.69 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25813  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0010  glcG protein  32.69 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.264513  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0610  glcG protein  32.69 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3861  hypothetical protein  33.94 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.636119 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0512  glcG protein  32.69 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0910  glcG protein  32.69 
 
 
136 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1438  protein of unknown function DUF336  33.64 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1573  hypothetical protein  33.94 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0241263  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6971  hypothetical protein  33.58 
 
 
143 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1943  ATP--cobalamin adenosyltransferase  33.33 
 
 
333 aa  52.4  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5191  hypothetical protein  35.19 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5668  hypothetical protein  35.19 
 
 
134 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0420818 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0551  hypothetical protein  34.27 
 
 
144 aa  52  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4786  protein of unknown function DUF336  33.83 
 
 
145 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.723891 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>