280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_36080 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_36080  ATP binding/ATPase (HATPase_c) domain-containing protein  100 
 
 		 723 aa  1468    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.785122  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2565  histidine kinase  29.5 
 
 		 796 aa  277  5e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3949  histidine kinase  37.12 
 
 		 679 aa  236  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0749  histidine kinase  29.29 
 
 		 722 aa  217  5e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0570  ATPase domain-containing protein  24.11 
 
 		 720 aa  157  7e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.208854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0268  histidine kinase  22.9 
 
 		 738 aa  150  7e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2441  histidine kinase  28.64 
 
 		 674 aa  144  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.459087  unclonable  0.00000000106284 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1181  histidine kinase  23.16 
 
 		 719 aa  143  9e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.798724  normal  0.0930045 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1575  histidine kinase  26.31 
 
 		 684 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000414678  decreased coverage  0.0000074807 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5323  histidine kinase  26.11 
 
 		 783 aa  126  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.15205 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4587  histidine kinase  24.96 
 
 		 784 aa  124  7e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4625  histidine kinase  25.7 
 
 		 756 aa  124  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.402141 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3783  histidine kinase  25.46 
 
 		 946 aa  122  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377863  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1489  histidine kinase  25.18 
 
 		 774 aa  95.5  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2655  histidine kinase  24.37 
 
 		 771 aa  88.2  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0835586 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2516  putative prophage encoded two-component system histidine kinase  24.18 
 
 		 774 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222494  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0961  hypothetical protein  33.91 
 
 		 587 aa  75.1  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.598783  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0504  signal transduction protein, histidine kinase  34.97 
 
 		 997 aa  74.3  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.284164  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0684  hypothetical protein  32.53 
 
 		 673 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.093919  hitchhiker  0.000000000000985329 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0079  histidine kinase  31.25 
 
 		 987 aa  71.2  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217254  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0371  histidine kinase  31.76 
 
 		 989 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0301  histidine kinase  33.96 
 
 		 994 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4937  sensor histidine kinase  37.01 
 
 		 604 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1455  hypothetical protein  33.33 
 
 		 860 aa  66.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.316955 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5398  sensor histidine kinase  37.82 
 
 		 602 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1084  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 495 aa  63.9  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4048  histidine kinase  30.3 
 
 		 773 aa  61.2  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1158  hypothetical protein  34.25 
 
 		 971 aa  60.8  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0746072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4128  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 		 752 aa  60.8  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.43986 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 		 378 aa  59.7  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 515 aa  57.4  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.441834  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1443  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 753 aa  56.6  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.616255  hitchhiker  0.000358642 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 500 aa  56.6  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.814589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0213  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 		 635 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1455  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 753 aa  56.2  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.205006  normal  0.134875 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0631  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.73 
 
 		 501 aa  56.6  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22133  normal  0.283314 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2136  two component sensor kinase  27.81 
 
 		 759 aa  55.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132627  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2839  nitrogen regulation protein, NtrY, Signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 769 aa  55.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1643  hypothetical protein  34.51 
 
 		 361 aa  54.7  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1589  hypothetical protein  36.36 
 
 		 698 aa  54.7  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242692  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1489  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 753 aa  54.7  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.726921  normal  0.706753 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 540 aa  54.3  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.948735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1517  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 632 aa  54.3  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3840  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 		 759 aa  54.3  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385478  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  33.06 
 
 		 1837 aa  54.3  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2567  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 768 aa  53.9  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0479714  hitchhiker  0.00000000485501 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1700  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 553 aa  53.9  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.012241  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0317  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 407 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.294431  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1243  hypothetical protein  29.68 
 
 		 240 aa  52.8  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000596031  hitchhiker  0.000000000136742 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2035  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 		 740 aa  52.4  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0375  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 450 aa  52  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1091  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 		 757 aa  52  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 408 aa  51.6  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000118464  decreased coverage  0.00150782 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0530  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 755 aa  51.6  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3128  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 779 aa  51.6  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.865325  normal  0.321459 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1863  sensory box histidine kinase  25.23 
 
 		 846 aa  51.6  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855198  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4946  histidine kinase  34.85 
 
 		 604 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000919995 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1620  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 		 842 aa  51.2  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.252508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1779  ATP-binding region ATPase domain protein  24.31 
 
 		 613 aa  51.2  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3436  hypothetical protein  30.65 
 
 		 667 aa  51.2  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8198  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  25.58 
 
 		 538 aa  51.2  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1948  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 		 858 aa  51.2  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.355681  normal  0.0222076 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.8 
 
 		 851 aa  50.8  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0705  histidine kinase  34.38 
 
 		 177 aa  50.8  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.637975  normal  0.661258 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0288  histidine kinase  35.04 
 
 		 604 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2677  histidine kinase  35.92 
 
 		 239 aa  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000481143  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3598  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.4 
 
 		 479 aa  50.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2669  sensory box histidine kinase  25 
 
 		 835 aa  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1485  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 676 aa  50.4  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.10947  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1504  sensory box histidine kinase  25 
 
 		 835 aa  50.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5904  two-component sensor  26.92 
 
 		 599 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0733  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 		 845 aa  50.4  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0810932  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2613  sensory box histidine kinase  25 
 
 		 835 aa  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.336024  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2194  histidine kinase  25.48 
 
 		 609 aa  50.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0613  sensor histidine kinase  34.15 
 
 		 467 aa  49.7  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.639539  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1722  sensory box histidine kinase  25 
 
 		 879 aa  50.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206152  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2607  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 		 747 aa  50.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.515354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5089  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.95 
 
 		 632 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.997163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2747  sensory box histidine kinase  25 
 
 		 879 aa  50.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0828  sensory histidine kinase AtoS  26.64 
 
 		 613 aa  49.7  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.167481 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4196  histidine kinase  28.62 
 
 		 666 aa  49.7  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531315 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0612  sensor histidine kinase  34.15 
 
 		 467 aa  49.7  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3507  PAS sensor protein  36.26 
 
 		 512 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00320  hypothetical protein  38.67 
 
 		 584 aa  50.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3180  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.95 
 
 		 632 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0860119  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3814  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 		 515 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1833  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 687 aa  49.3  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68230  two-component sensor  26.92 
 
 		 612 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0604681 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5187  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.95 
 
 		 632 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0102074 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3853  hypothetical protein  26.47 
 
 		 662 aa  49.3  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000936749  normal  0.0170599 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0016  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.75 
 
 		 679 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.225702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1491  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 814 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0430544 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2231  sensory box histidine kinase  25 
 
 		 885 aa  49.7  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3088  sensory box histidine kinase  25 
 
 		 885 aa  49.7  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90887  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1598  two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  36.56 
 
 		 857 aa  48.9  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.701828  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1075  histidine kinase  35.4 
 
 		 469 aa  48.9  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.55 
 
 		 630 aa  49.3  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0888009 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2304  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  50 
 
 		 679 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0636  ATPase domain-containing protein  20.38 
 
 		 662 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000455288 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2975  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 		 442 aa  49.3  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>