More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2677 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2677  histidine kinase  100 
 
 		 239 aa  491  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000481143  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 602 aa  115  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.525886  normal  0.309242 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0828  sensory histidine kinase AtoS  35.94 
 
 		 613 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.167481 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  35.05 
 
 		 608 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.05 
 
 		 608 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  35.05 
 
 		 608 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  35.05 
 
 		 608 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  35.05 
 
 		 608 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 1519 aa  111  9e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  35.05 
 
 		 608 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1384  sensory histidine kinase AtoS  34.4 
 
 		 617 aa  109  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0448  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.59 
 
 		 519 aa  108  8.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 515 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2492  sensory box histidine kinase  28.84 
 
 		 830 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0916  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.9 
 
 		 599 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000947728  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3414  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 406 aa  106  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30 
 
 		 1215 aa  106  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1138  histidine kinase  33.48 
 
 		 234 aa  106  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  32.11 
 
 		 458 aa  104  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1745  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.51 
 
 		 424 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  32.11 
 
 		 458 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  32.11 
 
 		 458 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0065  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 377 aa  103  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0841  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.81 
 
 		 744 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0016  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.82 
 
 		 679 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.225702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0173  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 		 495 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.875361  hitchhiker  0.00423579 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  29.95 
 
 		 581 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1736  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 738 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 378 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  31.65 
 
 		 458 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  31.65 
 
 		 465 aa  102  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0104  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.48 
 
 		 367 aa  102  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1972  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.47 
 
 		 747 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466348  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2057  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.47 
 
 		 747 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376311  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 466 aa  102  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1907  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.9 
 
 		 747 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0037  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 387 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 492 aa  102  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.917004  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1707  histidine kinase  28.77 
 
 		 462 aa  101  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 		 958 aa  101  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1445  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 390 aa  101  9e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3168  histidine kinase  29.44 
 
 		 369 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0768  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 673 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670648  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1016  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 		 441 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0352523 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4580  sensor protein ZraS  32.72 
 
 		 465 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 885 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1634  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 462 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0264776  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  29.33 
 
 		 617 aa  100  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0471  sensor histidine kinase  31.9 
 
 		 419 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.328588  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3081  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 546 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00093231 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  30.32 
 
 		 367 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1494  sensory box histidine kinase  29.18 
 
 		 550 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102326  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 620 aa  100  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  31.65 
 
 		 458 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2419  sensor histidine kinase  29.22 
 
 		 595 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.131968  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2380  sensor histidine kinase  28.83 
 
 		 595 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.343005  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2703  hypothetical protein  29.22 
 
 		 595 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.894836  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2146  two component signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 559 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 640 aa  100  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2653  sensor histidine kinase  28.83 
 
 		 595 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000377576 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1365  histidine kinase  29.91 
 
 		 496 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  32.06 
 
 		 611 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3749  sporulation kinase A  29.36 
 
 		 510 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2675  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 339 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.441961 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3652  sporulation kinase A  29.36 
 
 		 510 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2662  hypothetical protein  28.83 
 
 		 595 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17167  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3432  sporulation kinase A  29.36 
 
 		 510 aa  99.8  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0123298  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1567  sporulation kinase A  29.36 
 
 		 510 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.800828 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3702  sporulation kinase A  29.36 
 
 		 510 aa  99.8  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2240  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 		 461 aa  99.8  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0290  histidine kinase  31.51 
 
 		 333 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1578  histidine kinase  33.03 
 
 		 829 aa  99.8  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3670  sporulation kinase A  28.9 
 
 		 510 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.825905  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3674  sporulation kinase A  28.9 
 
 		 510 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.123371  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2456  sensor histidine kinase  29.22 
 
 		 509 aa  99.4  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.237642  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2329  histidine kinase  26.64 
 
 		 489 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3344  sporulation kinase A  28.9 
 
 		 510 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2636  sensor histidine kinase  29.22 
 
 		 499 aa  99.4  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 372 aa  99.4  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4417  sensor protein ZraS  32.26 
 
 		 465 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00746463  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4504  sensor protein ZraS  32.26 
 
 		 465 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79058  normal  0.150047 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2943  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 586 aa  99  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  31.19 
 
 		 458 aa  99  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4506  sensor protein ZraS  32.26 
 
 		 465 aa  99  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0449014 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1016  sensor protein ZraS  27.68 
 
 		 450 aa  99  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0625472  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2665  sensor histidine kinase  29.68 
 
 		 590 aa  98.6  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650271 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1880  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 612 aa  98.6  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.139426  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2028  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.84 
 
 		 1247 aa  98.6  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138072 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3327  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 		 510 aa  98.2  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.26559  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  30.73 
 
 		 458 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2976  histidine kinase  26.67 
 
 		 233 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0241356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3865  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 420 aa  97.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1700  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 		 591 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2659  hypothetical protein  27.93 
 
 		 595 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0321  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.62 
 
 		 345 aa  97.8  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 815 aa  97.8  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0739  histidine kinase  29.07 
 
 		 420 aa  97.8  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1027  histidine kinase  27.78 
 
 		 322 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.155612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2505  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 595 aa  98.2  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0288015  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 829 aa  97.8  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>