More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_29310 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_29310  nucleotide excision repair endonuclease  100 
 
 		 282 aa  558  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.525257  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01710  endonuclease of nucleotide excision repair  53.26 
 
 		 295 aa  281  7.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1901  Excinuclease ABC C subunit domain protein  53.26 
 
 		 295 aa  281  7.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.195835  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1891  nucleotide excision repair endonuclease  53.26 
 
 		 295 aa  281  7.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0501575 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01698  hypothetical protein  53.26 
 
 		 295 aa  281  7.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1963  nucleotide excision repair endonuclease  53.26 
 
 		 295 aa  281  7.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1823  nucleotide excision repair endonuclease  53.26 
 
 		 295 aa  281  7.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1986  nucleotide excision repair endonuclease  53.26 
 
 		 295 aa  281  8.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.282045  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2460  nucleotide excision repair endonuclease  52.9 
 
 		 295 aa  280  3e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.41654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1449  nucleotide excision repair endonuclease  52.54 
 
 		 295 aa  279  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.432222 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1703  nucleotide excision repair endonuclease  52.17 
 
 		 292 aa  278  5e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1422  nucleotide excision repair endonuclease  51.45 
 
 		 293 aa  275  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1863  nucleotide excision repair endonuclease  51.09 
 
 		 293 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2036  nucleotide excision repair endonuclease  50.72 
 
 		 293 aa  272  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.362279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1405  nucleotide excision repair endonuclease  51.09 
 
 		 293 aa  271  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.115833 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1437  nucleotide excision repair endonuclease  50.72 
 
 		 293 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4261  excinuclease ABC subunit C  49.62 
 
 		 275 aa  218  6e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2572  DNA polymerase III, epsilon subunit  45 
 
 		 476 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378709  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1907  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.08 
 
 		 453 aa  194  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3922  DNA polymerase III subunit epsilon  42.91 
 
 		 530 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000050364  normal  0.710356 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0827  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.62 
 
 		 470 aa  187  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.261841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3956  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.37 
 
 		 502 aa  181  8.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.323553  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3616  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.01 
 
 		 530 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00210343  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2002  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.68 
 
 		 463 aa  176  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.891146  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1647  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.59 
 
 		 466 aa  175  7e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1410  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.91 
 
 		 481 aa  171  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1553  DNA polymerase III, epsilon subunit  39.78 
 
 		 462 aa  169  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0294191  normal  0.0154238 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4015  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.86 
 
 		 482 aa  112  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  37.57 
 
 		 677 aa  85.9  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0659  excinuclease ABC subunit C  32.31 
 
 		 557 aa  79  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09513  probable DNA-directed DNA polymerase III (epsilon subunit)  27.6 
 
 		 457 aa  79  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0677  DNA polymerase III, epsilon subunit  48.35 
 
 		 392 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2078  excinuclease ABC, C subunit  30.21 
 
 		 604 aa  77.8  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2004  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.29 
 
 		 584 aa  77.8  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489491  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5031  excinuclease ABC, C subunit  30.41 
 
 		 603 aa  77.4  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2878  excinuclease ABC, C subunit  30.5 
 
 		 682 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3104  excinuclease ABC, C subunit  30.5 
 
 		 682 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.299342  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0683  excinuclease ABC subunit C  31.79 
 
 		 557 aa  76.6  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  28.04 
 
 		 593 aa  76.6  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3068  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.79 
 
 		 605 aa  77  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0177257  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3518  hypothetical protein  33.17 
 
 		 585 aa  76.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.663453  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2053  excinuclease ABC subunit C  32.26 
 
 		 612 aa  75.9  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2725  excinuclease ABC subunit C  31.25 
 
 		 592 aa  75.5  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2640  excinuclease ABC subunit C  31.67 
 
 		 579 aa  75.1  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.347112  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3286  hypothetical protein  32.54 
 
 		 607 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.94891 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3451  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.27 
 
 		 453 aa  75.1  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3001  excinuclease ABC, C subunit  30.5 
 
 		 700 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  27.87 
 
 		 598 aa  74.7  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5405  excinuclease ABC, C subunit  30.5 
 
 		 688 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2276  excinuclease ABC, C subunit  32.49 
 
 		 644 aa  74.7  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3221  excinuclease ABC, C subunit  29.17 
 
 		 602 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.0605848 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1321  excinuclease ABC subunit C  33.52 
 
 		 516 aa  73.6  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0107777  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  28.95 
 
 		 628 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3919  excinuclease ABC subunit C  28.91 
 
 		 631 aa  73.9  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2319  Excinuclease ABC C subunit domain protein  28.43 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1072  excinuclease ABC subunit C  32.77 
 
 		 575 aa  73.6  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.353425  normal  0.0879577 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2709  excinuclease ABC subunit C  29.47 
 
 		 519 aa  73.2  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.890107  normal  0.0209335 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0591  excinuclease ABC, C subunit  27.09 
 
 		 599 aa  73.2  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04670  excinuclease ABC, C subunit  27.37 
 
 		 598 aa  73.2  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0859  hypothetical protein  26.4 
 
 		 598 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00473 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  31.18 
 
 		 626 aa  72.4  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1161  excinuclease ABC subunit C  28.57 
 
 		 520 aa  72.4  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.342266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2344  excinuclease ABC, C subunit  34.25 
 
 		 779 aa  72.4  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.77277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3077  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.82 
 
 		 383 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1822  excinuclease ABC subunit C  31.55 
 
 		 521 aa  71.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.201866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0914  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.82 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0087  excinuclease ABC subunit C  30.81 
 
 		 576 aa  71.6  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.139428  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0173  excinuclease ABC subunit C  29.59 
 
 		 601 aa  70.9  0.00000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1803  excinuclease ABC, C subunit  33.7 
 
 		 657 aa  71.2  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0340936  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1283  excinuclease ABC subunit C  29.59 
 
 		 596 aa  71.2  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  28.37 
 
 		 641 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2161  excinuclease ABC subunit C  31.07 
 
 		 674 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.263968 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  28 
 
 		 601 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0968  hypothetical protein  33.87 
 
 		 566 aa  71.2  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.277294 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3639  excinuclease ABC, C subunit  29.13 
 
 		 597 aa  70.5  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  34.68 
 
 		 590 aa  70.9  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1246  excinuclease ABC subunit C  30.16 
 
 		 565 aa  70.5  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1558  excinuclease ABC subunit C  30.85 
 
 		 690 aa  70.1  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367704  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  31.58 
 
 		 603 aa  70.1  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4255  excinuclease ABC subunit C  30.93 
 
 		 677 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0663  excinuclease ABC subunit C  31.38 
 
 		 681 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.912465  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1143  excinuclease ABC subunit C  31.38 
 
 		 681 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232911  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4113  excinuclease ABC C subunit domain protein  30 
 
 		 465 aa  69.7  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2013  excinuclease ABC subunit C  32.12 
 
 		 614 aa  69.3  0.00000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.117598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2520  excinuclease ABC subunit C  31.32 
 
 		 635 aa  69.3  0.00000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1749  excinuclease ABC subunit C  27.23 
 
 		 527 aa  68.9  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0671774  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  27.36 
 
 		 616 aa  68.9  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  29.35 
 
 		 610 aa  68.9  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1101  excinuclease ABC subunit C  31.38 
 
 		 682 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  32.95 
 
 		 614 aa  68.9  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0936  excinuclease ABC subunit C  29.57 
 
 		 520 aa  68.9  0.00000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0694942 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15750  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  30 
 
 		 616 aa  68.9  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.270349  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2940  exonuclease DNA polymerase III subunit epsilon  45.35 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000147558  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1363  excinuclease ABC subunit C  31.82 
 
 		 661 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.205269  normal  0.348926 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1595  DNA polymerase/helicase  46.43 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700691  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  30.73 
 
 		 636 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2769  excinuclease ABC subunit C  32.07 
 
 		 747 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0179229  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1019  excinuclease ABC subunit C  30.41 
 
 		 684 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114773  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1266  excinuclease ABC subunit C  27.45 
 
 		 602 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1103  excinuclease ABC subunit C  26.56 
 
 		 528 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>