More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0173 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0173  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 601 aa  1243    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0365  excinuclease ABC subunit C  35.93 
 
 		 636 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.312712  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  35.58 
 
 		 617 aa  353  5e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5066  excinuclease ABC, C subunit  35.41 
 
 		 689 aa  352  1e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  35.99 
 
 		 677 aa  348  2e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2735  excinuclease ABC subunit C  36.12 
 
 		 623 aa  345  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.0935486 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1074  excinuclease ABC subunit C  36.12 
 
 		 623 aa  345  1e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.969621  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  35.54 
 
 		 612 aa  345  1e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3279  excinuclease ABC subunit C  35.59 
 
 		 613 aa  343  5e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  35.04 
 
 		 599 aa  342  1e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2859  excinuclease ABC subunit C  35.86 
 
 		 623 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2133  excinuclease ABC subunit C  34.79 
 
 		 604 aa  335  1e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00985622  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  33.83 
 
 		 626 aa  333  4e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  35.65 
 
 		 614 aa  332  1e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3961  excinuclease ABC subunit C  36.12 
 
 		 623 aa  331  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00581214  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4046  excinuclease ABC subunit C  35.68 
 
 		 649 aa  331  3e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2306  excinuclease ABC subunit C  33.67 
 
 		 605 aa  329  9e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.391453  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  33.45 
 
 		 617 aa  329  9e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  34.21 
 
 		 599 aa  326  7e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3919  excinuclease ABC subunit C  34.03 
 
 		 631 aa  325  1e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  33.38 
 
 		 665 aa  324  3e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  33.03 
 
 		 669 aa  323  4e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  32.35 
 
 		 611 aa  323  7e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0644  excinuclease ABC subunit C  35.06 
 
 		 631 aa  322  9.999999999999999e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  32.36 
 
 		 624 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  33.72 
 
 		 613 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  32.57 
 
 		 614 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2316  excinuclease ABC subunit C  35.24 
 
 		 645 aa  322  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.682688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2449  excinuclease ABC subunit C  36.07 
 
 		 608 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0823614  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  34.27 
 
 		 607 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  34.51 
 
 		 619 aa  319  9e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0516  excinuclease ABC subunit C  34.98 
 
 		 658 aa  318  1e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2520  excinuclease ABC subunit C  34.16 
 
 		 635 aa  319  1e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  33.06 
 
 		 611 aa  318  1e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  35.23 
 
 		 604 aa  318  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2582  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 		 707 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0298778  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30660  excinuclease ABC subunit C  32.67 
 
 		 608 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.385406  hitchhiker  0.0074174 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  34.14 
 
 		 615 aa  318  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  33.28 
 
 		 641 aa  318  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1954  excinuclease ABC subunit C  34.32 
 
 		 609 aa  317  3e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00983646  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2678  excinuclease ABC subunit C  33.18 
 
 		 707 aa  317  4e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2698  excinuclease ABC subunit C  34.43 
 
 		 618 aa  317  5e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1777  excinuclease ABC, C subunit  32.84 
 
 		 636 aa  317  5e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0413401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  33.44 
 
 		 607 aa  316  8e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2570  excinuclease ABC subunit C  34.26 
 
 		 618 aa  316  9e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2038  excinuclease ABC subunit C  34.88 
 
 		 603 aa  315  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.331579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  33.22 
 
 		 613 aa  315  9.999999999999999e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2053  excinuclease ABC subunit C  33.06 
 
 		 612 aa  315  9.999999999999999e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  32.89 
 
 		 626 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1279  excinuclease ABC subunit C  33.18 
 
 		 707 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0496012  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2614  excinuclease ABC subunit C  32.78 
 
 		 608 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  33.28 
 
 		 601 aa  315  1.9999999999999998e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2013  excinuclease ABC subunit C  34.74 
 
 		 614 aa  314  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.117598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1334  excinuclease ABC subunit C  34.62 
 
 		 609 aa  314  2.9999999999999996e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000285239  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  33.44 
 
 		 607 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2151  excinuclease ABC subunit C  34.74 
 
 		 609 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.054241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1276  excinuclease ABC subunit C  34.28 
 
 		 609 aa  313  4.999999999999999e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00138903  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2276  excinuclease ABC, C subunit  33.61 
 
 		 644 aa  313  6.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  32.34 
 
 		 610 aa  312  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25040  excinuclease ABC subunit C  32.89 
 
 		 607 aa  311  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  34.58 
 
 		 622 aa  311  2e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3374  excinuclease ABC subunit C  32.72 
 
 		 607 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1825  excinuclease ABC subunit C  34.76 
 
 		 609 aa  311  2e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.088783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3057  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 		 588 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4098  excinuclease ABC subunit C  32.11 
 
 		 607 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125966  normal  0.0386444 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  32.56 
 
 		 607 aa  310  4e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  32.29 
 
 		 653 aa  310  5.9999999999999995e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3023  excinuclease ABC, C subunit  32.11 
 
 		 607 aa  309  9e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.623507  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  32.56 
 
 		 607 aa  309  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0205  excinuclease ABC subunit C  34 
 
 		 614 aa  309  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0351181  normal  0.308964 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1403  excinuclease ABC subunit C  35.56 
 
 		 614 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.252536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1316  excinuclease ABC subunit C  33.67 
 
 		 627 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.235211  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1766  excinuclease ABC subunit C  32.11 
 
 		 607 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0738607  decreased coverage  0.000573829 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1362  excinuclease ABC subunit C  34.51 
 
 		 704 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1410  excinuclease ABC subunit C  33.67 
 
 		 621 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  31.94 
 
 		 613 aa  308  2.0000000000000002e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2896  excinuclease ABC subunit C  32.17 
 
 		 607 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189646  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3066  excinuclease ABC subunit C  33.39 
 
 		 607 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1177  excinuclease ABC subunit C  35.28 
 
 		 695 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.8668  normal  0.100977 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1281  excinuclease ABC subunit C  35.11 
 
 		 695 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.280524  normal  0.136737 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1082  excinuclease ABC subunit C  33.72 
 
 		 644 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1975  excinuclease ABC subunit C  33.66 
 
 		 653 aa  308  3e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1193  excinuclease ABC, C subunit  35.86 
 
 		 609 aa  307  5.0000000000000004e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  33.89 
 
 		 609 aa  306  6e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  34.65 
 
 		 615 aa  306  6e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  33.06 
 
 		 607 aa  306  7e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  33.49 
 
 		 620 aa  306  8.000000000000001e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  33.08 
 
 		 685 aa  305  1.0000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4491  excinuclease ABC subunit C  33.28 
 
 		 642 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.191027 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1548  excinuclease ABC subunit C  33.87 
 
 		 609 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000704584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2589  excinuclease ABC subunit C  32.96 
 
 		 691 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0718587  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  33.49 
 
 		 620 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1615  excinuclease ABC subunit C  33.87 
 
 		 609 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000543557  normal  0.3636 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2312  excinuclease ABC subunit C  34.04 
 
 		 623 aa  305  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.136814 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4277  excinuclease ABC subunit C  32.84 
 
 		 634 aa  304  3.0000000000000004e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.471865 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00582  excinuclease ABC subunit C  34.56 
 
 		 618 aa  304  4.0000000000000003e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0979  excinuclease ABC, C subunit  33.17 
 
 		 623 aa  304  4.0000000000000003e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0363417 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2220  excinuclease ABC subunit C  33.01 
 
 		 639 aa  304  4.0000000000000003e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.0021269  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0853  excinuclease ABC, C subunit  32.89 
 
 		 608 aa  304  4.0000000000000003e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1609  excinuclease ABC subunit C  33.87 
 
 		 609 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000167064  normal  0.0818954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>