More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2319 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2319  Excinuclease ABC C subunit domain protein  100 
 
 		 376 aa  768    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  34.72 
 
 		 625 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0363  excinuclease ABC subunit C  34.95 
 
 		 593 aa  191  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  32.29 
 
 		 615 aa  187  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  31.09 
 
 		 613 aa  184  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  36.5 
 
 		 613 aa  183  4.0000000000000006e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  32.05 
 
 		 641 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1467  excinuclease ABC subunit C  31.21 
 
 		 604 aa  179  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0341  excinuclease ABC subunit C  31.74 
 
 		 620 aa  177  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  31.55 
 
 		 607 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  35.14 
 
 		 628 aa  176  4e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  32.29 
 
 		 624 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0333  excinuclease ABC subunit C  31.44 
 
 		 620 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3041  excinuclease ABC subunit C  33.02 
 
 		 591 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2610  excinuclease ABC subunit C  35.35 
 
 		 591 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0835945  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  31.71 
 
 		 607 aa  172  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2610  excinuclease ABC, C subunit  31.73 
 
 		 653 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  29 
 
 		 677 aa  170  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  32.81 
 
 		 622 aa  169  7e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0841  excinuclease ABC subunit C  33.56 
 
 		 590 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0381  excinuclease ABC subunit C  32.11 
 
 		 624 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0520  excinuclease ABC subunit C  32.32 
 
 		 599 aa  167  4e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.545432  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  36.76 
 
 		 613 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02086  excinuclease ABC subunit C  33.64 
 
 		 544 aa  166  6.9999999999999995e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000899057  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3219  excinuclease ABC subunit C  34.34 
 
 		 596 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.831244  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1907  excinuclease ABC subunit C  31.53 
 
 		 609 aa  164  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4348  excinuclease ABC subunit C  32.74 
 
 		 594 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4648  excinuclease ABC subunit C  32.74 
 
 		 594 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4647  excinuclease ABC subunit C  32.74 
 
 		 594 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4255  excinuclease ABC subunit C  32.74 
 
 		 594 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4267  excinuclease ABC subunit C  32.74 
 
 		 594 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0544521  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4632  excinuclease ABC subunit C  32.74 
 
 		 594 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4416  excinuclease ABC subunit C  32.74 
 
 		 594 aa  162  7e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4757  excinuclease ABC subunit C  32.74 
 
 		 594 aa  162  7e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  33.43 
 
 		 685 aa  162  9e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  31.49 
 
 		 601 aa  161  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1044  excinuclease ABC, C subunit  34.77 
 
 		 616 aa  161  2e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00420676  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4628  excinuclease ABC subunit C  32.44 
 
 		 594 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  33.45 
 
 		 611 aa  160  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4113  excinuclease ABC C subunit domain protein  36.51 
 
 		 465 aa  159  9e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  29.28 
 
 		 607 aa  158  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  32.62 
 
 		 604 aa  159  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0607  excinuclease ABC subunit C  33.45 
 
 		 594 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1073  excinuclease ABC subunit C  29.64 
 
 		 607 aa  158  1e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5405  excinuclease ABC, C subunit  34.15 
 
 		 688 aa  158  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  32.4 
 
 		 612 aa  158  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  29.28 
 
 		 607 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0657  excinuclease ABC subunit C  30.41 
 
 		 603 aa  157  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000040695  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3221  excinuclease ABC, C subunit  30.95 
 
 		 602 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.0605848 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  35.77 
 
 		 619 aa  158  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4295  excinuclease ABC subunit C  30.62 
 
 		 627 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1280  excinuclease ABC subunit C  29.71 
 
 		 595 aa  157  3e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  27.87 
 
 		 626 aa  157  4e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  30.77 
 
 		 613 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  32.76 
 
 		 669 aa  156  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1864  excinuclease ABC, C subunit  30.54 
 
 		 610 aa  156  7e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2878  excinuclease ABC, C subunit  33.33 
 
 		 682 aa  156  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3001  excinuclease ABC, C subunit  33.64 
 
 		 700 aa  155  8e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3104  excinuclease ABC, C subunit  33.33 
 
 		 682 aa  155  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.299342  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1749  excinuclease ABC subunit C  33.06 
 
 		 527 aa  155  9e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0671774  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1222  excinuclease ABC subunit C  31.48 
 
 		 593 aa  155  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.11085  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3228  excinuclease ABC subunit C  32.52 
 
 		 614 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438177  normal  0.345048 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  33.85 
 
 		 627 aa  154  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1091  excinuclease ABC subunit C  30.29 
 
 		 617 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1120  excinuclease ABC subunit C  30.29 
 
 		 617 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1849  excinuclease ABC subunit C  33.57 
 
 		 610 aa  154  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0109871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2449  excinuclease ABC subunit C  30.52 
 
 		 608 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0823614  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  32.69 
 
 		 629 aa  153  4e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  29.77 
 
 		 607 aa  152  7e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  30.03 
 
 		 628 aa  152  7e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  30.33 
 
 		 610 aa  152  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  28.61 
 
 		 615 aa  152  8e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1093  excinuclease ABC subunit C  31.67 
 
 		 517 aa  152  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.295686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  32.62 
 
 		 656 aa  151  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0158  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 		 527 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1733  excinuclease ABC, C subunit  29.76 
 
 		 610 aa  151  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000110405  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3337  excinuclease ABC subunit C  30.5 
 
 		 660 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0998705  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1644  excinuclease ABC subunit C  33.58 
 
 		 599 aa  151  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1145  excinuclease ABC, C subunit  33.94 
 
 		 613 aa  151  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000360051  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  31.58 
 
 		 619 aa  151  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1040  excinuclease ABC subunit C  29.76 
 
 		 610 aa  151  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000190411  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3248  excinuclease ABC subunit C  32.57 
 
 		 617 aa  151  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2685  excinuclease ABC subunit C  29.76 
 
 		 610 aa  150  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000130785  normal  0.0663039 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1726  excinuclease ABC subunit C  29.76 
 
 		 610 aa  150  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000100265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2146  excinuclease ABC subunit C  29.76 
 
 		 610 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000023615  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2011  excinuclease ABC subunit C  29.76 
 
 		 610 aa  150  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000678771  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2374  excinuclease ABC subunit C  34.96 
 
 		 607 aa  150  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.483342  normal  0.0306932 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3014  excinuclease ABC, C subunit  32.97 
 
 		 675 aa  150  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1270  excinuclease ABC subunit C  29.76 
 
 		 610 aa  150  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000021646  hitchhiker  0.000709379 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  30.25 
 
 		 665 aa  150  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  32.72 
 
 		 614 aa  149  8e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1205  excinuclease ABC subunit C  34.27 
 
 		 593 aa  149  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  31.53 
 
 		 616 aa  149  9e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1227  excinuclease ABC subunit C  34.27 
 
 		 593 aa  149  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2252  excinuclease ABC subunit C  33.57 
 
 		 610 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034144  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1822  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 		 521 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.201866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  30.91 
 
 		 658 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1879  excinuclease ABC subunit C  30.67 
 
 		 617 aa  149  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000011349  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0729  excinuclease ABC subunit C  33.61 
 
 		 594 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0936  excinuclease ABC subunit C  29.38 
 
 		 520 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0694942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>