More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4113 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_4113  excinuclease ABC C subunit domain protein  100 
 
 		 465 aa  943    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1156  excinuclease ABC subunit C  41.16 
 
 		 510 aa  290  3e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1011  excinuclease ABC, C subunit  40.19 
 
 		 479 aa  276  8e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1237  excinuclease ABC C subunit domain protein  37.59 
 
 		 498 aa  275  1.0000000000000001e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.173931  normal  0.435946 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0197  excinuclease ABC subunit C  40.6 
 
 		 437 aa  271  1e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1057  excinuclease ABC subunit C  37.22 
 
 		 615 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000568653  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1772  excinuclease ABC subunit C  44.49 
 
 		 628 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.736337 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0256  excinuclease ABC subunit C  43.65 
 
 		 613 aa  214  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_999  excinuclease ABC, C subunit  41.64 
 
 		 607 aa  213  5.999999999999999e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1216  excinuclease ABC subunit C  41.26 
 
 		 607 aa  210  5e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.423233  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0710  excinuclease ABC subunit C  42.74 
 
 		 631 aa  209  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.314555  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3952  excinuclease ABC subunit C  41.6 
 
 		 624 aa  208  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115728 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1026  excinuclease ABC subunit C  41.26 
 
 		 607 aa  208  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0295  excinuclease ABC, C subunit  42.11 
 
 		 614 aa  204  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1652  excinuclease ABC subunit C  42.74 
 
 		 616 aa  202  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2021  excinuclease ABC subunit C  41.63 
 
 		 656 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387091  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16210  excinuclease ABC, C subunit  42.04 
 
 		 607 aa  201  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0283958  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2737  excinuclease ABC subunit C  40.32 
 
 		 625 aa  200  5e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1341  excinuclease ABC subunit C  41.25 
 
 		 629 aa  199  7e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3014  excinuclease ABC, C subunit  42.04 
 
 		 675 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1795  excinuclease ABC subunit C  42.04 
 
 		 619 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.625929  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1485  excinuclease ABC subunit C  38.19 
 
 		 598 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3337  excinuclease ABC subunit C  40.89 
 
 		 660 aa  197  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0998705  hitchhiker  0.00117638 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0579  excinuclease ABC subunit C  38.51 
 
 		 604 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2133  excinuclease ABC subunit C  43.1 
 
 		 604 aa  196  6e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00985622  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15780  Excinuclease ABC subunit C  41.53 
 
 		 658 aa  196  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.160684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1334  excinuclease ABC subunit C  41.32 
 
 		 609 aa  196  1e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000285239  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2359  excinuclease ABC, C subunit  41.63 
 
 		 671 aa  195  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.660798  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1254  excinuclease ABC, C subunit  40.08 
 
 		 615 aa  195  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1362  excinuclease ABC subunit C  40.08 
 
 		 611 aa  194  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.884945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0254  excinuclease ABC, C subunit  41.08 
 
 		 601 aa  194  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1257  excinuclease ABC, C subunit  39.93 
 
 		 677 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1598  excinuclease ABC, C subunit  43.28 
 
 		 607 aa  194  4e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.735187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1276  excinuclease ABC subunit C  40.91 
 
 		 609 aa  194  4e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00138903  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2010  excinuclease ABC subunit C  42.55 
 
 		 611 aa  193  6e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2550  excinuclease ABC, C subunit  40.41 
 
 		 675 aa  193  7e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.295738  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0022  excinuclease ABC subunit C  41.63 
 
 		 613 aa  193  7e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2395  excinuclease ABC subunit C  40.16 
 
 		 676 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2442  excinuclease ABC subunit C  40.16 
 
 		 676 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2436  excinuclease ABC subunit C  40.16 
 
 		 676 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2697  excinuclease ABC subunit C  39.61 
 
 		 678 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3715  excinuclease ABC subunit C  38.82 
 
 		 678 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1823  excinuclease ABC, C subunit  41.96 
 
 		 622 aa  190  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3109  excinuclease ABC subunit C  39.41 
 
 		 665 aa  190  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.116982  normal  0.254629 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1391  excinuclease ABC, C subunit  41.56 
 
 		 605 aa  190  5e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2526  excinuclease ABC subunit C  41.42 
 
 		 666 aa  189  7e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.775537  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1804  excinuclease ABC subunit C  36.86 
 
 		 599 aa  189  8e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.919457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1777  excinuclease ABC, C subunit  42.06 
 
 		 636 aa  189  8e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0413401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2063  excinuclease ABC subunit C  38.37 
 
 		 627 aa  189  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.760061  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6042  excinuclease ABC, C subunit  39.18 
 
 		 649 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2035  excinuclease ABC, C subunit  42.51 
 
 		 685 aa  188  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0230334  hitchhiker  0.00678437 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2796  excinuclease ABC, C subunit  38.15 
 
 		 679 aa  187  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172579  decreased coverage  0.00000392618 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0775  excinuclease ABC, C subunit  41 
 
 		 613 aa  187  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0485  excinuclease ABC subunit C  38.15 
 
 		 628 aa  187  4e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1001  excinuclease ABC subunit C  38.38 
 
 		 657 aa  187  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.73532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0428  excinuclease ABC subunit C  32.86 
 
 		 746 aa  187  4e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20070  Excinuclease ABC subunit C  40.41 
 
 		 703 aa  186  6e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0431256  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1071  excinuclease ABC subunit C  40.66 
 
 		 654 aa  186  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000538512  normal  0.216036 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2978  excinuclease ABC, C subunit  37.45 
 
 		 665 aa  186  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000426335 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5613  excinuclease ABC, C subunit  43.1 
 
 		 663 aa  186  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143768  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5206  excinuclease ABC, C subunit  40 
 
 		 649 aa  186  7e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0851  excinuclease ABC subunit C  40.17 
 
 		 740 aa  186  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00444649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2161  excinuclease ABC subunit C  41 
 
 		 674 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.263968 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2175  excinuclease ABC, C subunit  40 
 
 		 693 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3117  excinuclease ABC subunit C  35.62 
 
 		 610 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11300  excinuclease ABC subunit C  39.45 
 
 		 643 aa  186  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.222126  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0807  excinuclease ABC subunit C  37.5 
 
 		 613 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2889  excinuclease ABC subunit C  41 
 
 		 731 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0288597  normal  0.314719 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2375  excinuclease ABC subunit C  39.22 
 
 		 626 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2410  excinuclease ABC subunit C  38.18 
 
 		 673 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.308713  hitchhiker  0.000953685 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1681  excinuclease ABC, C subunit  40.48 
 
 		 626 aa  184  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1095  excinuclease ABC subunit C  40.59 
 
 		 753 aa  184  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3154  excinuclease ABC, C subunit  37.09 
 
 		 669 aa  184  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2975  excinuclease ABC, C subunit  40.17 
 
 		 708 aa  184  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.720202  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0663  excinuclease ABC subunit C  40.59 
 
 		 681 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.912465  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1143  excinuclease ABC subunit C  40.59 
 
 		 681 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232911  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2244  excinuclease ABC subunit C  40.5 
 
 		 663 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0815  excinuclease ABC, C subunit  31.85 
 
 		 780 aa  183  5.0000000000000004e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2698  excinuclease ABC subunit C  41.67 
 
 		 618 aa  183  6e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1633  excinuclease ABC subunit C  39.33 
 
 		 705 aa  183  6e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.860828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1954  excinuclease ABC subunit C  39.51 
 
 		 609 aa  183  7e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00983646  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11449  excinuclease ABC subunit C  38.43 
 
 		 646 aa  183  7e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.185294 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1101  excinuclease ABC subunit C  40.59 
 
 		 682 aa  183  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1192  excinuclease ABC, C subunit  41.84 
 
 		 619 aa  183  7e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0751579  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1932  excinuclease ABC subunit C  40.77 
 
 		 692 aa  182  8.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0596454 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4255  excinuclease ABC subunit C  40.59 
 
 		 677 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.27889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1823  excinuclease ABC subunit C  39.42 
 
 		 674 aa  182  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000135046 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1252  excinuclease ABC, C subunit  39.33 
 
 		 647 aa  182  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0553  excinuclease ABC subunit C  40 
 
 		 612 aa  182  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000014331  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0063  excinuclease ABC, C subunit  34.53 
 
 		 641 aa  182  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0936  excinuclease ABC subunit C  37.55 
 
 		 657 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.581594  normal  0.110547 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2935  excinuclease ABC subunit C  36.82 
 
 		 704 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0327  excinuclease ABC subunit C  35.83 
 
 		 628 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000467295  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2053  excinuclease ABC subunit C  41.53 
 
 		 612 aa  181  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.747011 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1019  excinuclease ABC subunit C  40.17 
 
 		 684 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114773  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1544  excinuclease ABC, C subunit  36.86 
 
 		 659 aa  181  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.519608  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1023  excinuclease ABC subunit C  40.17 
 
 		 684 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2570  excinuclease ABC subunit C  41.25 
 
 		 618 aa  181  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15160  Excinuclease ABC subunit C  36.89 
 
 		 650 aa  181  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1082  excinuclease ABC subunit C  35.67 
 
 		 644 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>