More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_26600 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  100 
 
 
687 aa  1420    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  55.88 
 
 
796 aa  609  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  53.44 
 
 
777 aa  579  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  47.26 
 
 
780 aa  570  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  49.26 
 
 
774 aa  521  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  48.45 
 
 
907 aa  519  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  45.86 
 
 
734 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  46.14 
 
 
731 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  45.86 
 
 
734 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  45.86 
 
 
734 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  45.86 
 
 
734 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  49.26 
 
 
748 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  45.86 
 
 
734 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  45.7 
 
 
734 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  48.08 
 
 
788 aa  515  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  46.14 
 
 
731 aa  514  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  47.53 
 
 
756 aa  513  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  47.9 
 
 
572 aa  510  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  47.36 
 
 
757 aa  511  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  47.53 
 
 
755 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  46.91 
 
 
794 aa  503  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  47.38 
 
 
778 aa  502  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  47.39 
 
 
734 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  47.2 
 
 
734 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  45.52 
 
 
792 aa  494  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  46.68 
 
 
730 aa  489  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  45.92 
 
 
645 aa  484  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  46.46 
 
 
841 aa  483  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  46.46 
 
 
841 aa  483  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  46.46 
 
 
838 aa  484  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  46.65 
 
 
841 aa  484  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  43.51 
 
 
712 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  44.91 
 
 
785 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  47.1 
 
 
886 aa  455  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  45.75 
 
 
901 aa  445  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  43.59 
 
 
735 aa  444  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  43.31 
 
 
769 aa  441  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  42.56 
 
 
741 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  45.37 
 
 
975 aa  438  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  43.16 
 
 
689 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  40.1 
 
 
646 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  42.75 
 
 
741 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  42.18 
 
 
741 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  38.78 
 
 
643 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  43 
 
 
689 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  40.93 
 
 
771 aa  419  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  37.17 
 
 
683 aa  412  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  37.93 
 
 
683 aa  410  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2014  type VI secretion system Vgr family protein  41.21 
 
 
753 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758033  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  41.17 
 
 
794 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  38.73 
 
 
729 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0342  Rhs element Vgr protein  38.17 
 
 
775 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795549  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  38.91 
 
 
729 aa  389  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  38.14 
 
 
730 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  38.38 
 
 
743 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  37.97 
 
 
714 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1703  Rhs element Vgr protein  38.17 
 
 
775 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0251  Rhs element Vgr protein  38.17 
 
 
775 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628249  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2174  Rhs element Vgr protein  37.98 
 
 
775 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1901  Rhs element Vgr protein  37.98 
 
 
775 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0912  Rhs element Vgr protein  37.98 
 
 
775 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1199  Rhs element Vgr protein  37.98 
 
 
775 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1281  Rhs element Vgr protein  38.22 
 
 
676 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  37.57 
 
 
725 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1934  hypothetical protein  36.87 
 
 
874 aa  363  6e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.652792  normal  0.85907 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1486  type VI secretion system Vgr family protein  36.87 
 
 
922 aa  363  6e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1374  Rhs element Vgr protein  36.87 
 
 
916 aa  363  6e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  35.84 
 
 
618 aa  356  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  40.88 
 
 
767 aa  355  1e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  36.05 
 
 
618 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  40.68 
 
 
767 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  33.99 
 
 
724 aa  353  8.999999999999999e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  35.14 
 
 
616 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  35.73 
 
 
613 aa  349  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  35.5 
 
 
1981 aa  347  5e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  34.15 
 
 
618 aa  345  1e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  33.79 
 
 
1048 aa  343  7e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  35.64 
 
 
661 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  35.47 
 
 
661 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  35.3 
 
 
661 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  35.3 
 
 
661 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  35.3 
 
 
661 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  35.3 
 
 
661 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  35.3 
 
 
661 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  34.8 
 
 
661 aa  340  5e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  32.5 
 
 
619 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  34.56 
 
 
1057 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  34.21 
 
 
872 aa  337  5e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  33.9 
 
 
858 aa  333  9e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  33.9 
 
 
930 aa  333  9e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  33.9 
 
 
896 aa  333  9e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  33.82 
 
 
614 aa  332  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00256  Rhs-family protein  33.94 
 
 
645 aa  330  5.0000000000000004e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  35.34 
 
 
669 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1827  Rhs element Vgr protein  37.47 
 
 
540 aa  326  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.336809 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0536  type VI secretion system Vgr family protein  35.29 
 
 
792 aa  323  5e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0531  type VI secretion system Vgr family protein  34.75 
 
 
1003 aa  318  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  37.87 
 
 
668 aa  317  6e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3558  type VI secretion system Vgr family protein  31.12 
 
 
782 aa  312  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.125148  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  37.99 
 
 
668 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>