222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_09020 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_09020  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  477  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3784  hypothetical protein  71.94 
 
 
256 aa  361  8e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.570332 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4955  hypothetical protein  64.03 
 
 
259 aa  310  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4809  hypothetical protein  64.03 
 
 
256 aa  305  6e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4792  hypothetical protein  62.85 
 
 
253 aa  304  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.261557 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4350  hypothetical protein  64.82 
 
 
256 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.571973  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4667  hypothetical protein  62.85 
 
 
253 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0629  hypothetical protein  64.82 
 
 
253 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0550137  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  65.61 
 
 
253 aa  298  5e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4845  hypothetical protein  61.66 
 
 
253 aa  298  6e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  62.85 
 
 
253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  43.67 
 
 
251 aa  159  5e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  40.41 
 
 
251 aa  150  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0817  protein of unknown function DUF218  44.64 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.562858  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  45.5 
 
 
262 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1132  hypothetical protein  46.7 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4693  protein of unknown function DUF218  37.45 
 
 
247 aa  133  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203354  normal  0.120378 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  49.4 
 
 
215 aa  132  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0343  hypothetical protein  42.69 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132846  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2924  hypothetical protein  38.58 
 
 
271 aa  123  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.825508 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  44.24 
 
 
252 aa  122  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  45.56 
 
 
247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1670  hypothetical protein  42.36 
 
 
255 aa  119  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0451  hypothetical protein  36.96 
 
 
230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0851165  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2935  hypothetical protein  39.47 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1968  hypothetical protein  42.62 
 
 
265 aa  106  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  36.86 
 
 
266 aa  103  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  36.29 
 
 
264 aa  98.6  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  26.88 
 
 
242 aa  94  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  30.3 
 
 
261 aa  92  7e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  27.84 
 
 
251 aa  92  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  34.9 
 
 
260 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  30.74 
 
 
263 aa  81.3  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  34.72 
 
 
263 aa  76.3  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  31.44 
 
 
265 aa  75.1  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  30.87 
 
 
256 aa  75.1  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  28.79 
 
 
237 aa  75.1  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  30.93 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  28.79 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  32.34 
 
 
272 aa  72  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  28 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  36.42 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003938  membrane protein functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  30.73 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0113551  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  26.24 
 
 
214 aa  68.2  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3776  hypothetical protein  39.1 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.892211  normal  0.779131 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  35.75 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  33.93 
 
 
281 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0549  protein of unknown function DUF218  36.69 
 
 
262 aa  65.5  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0964  protein of unknown function DUF218  27.49 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017074  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  47.22 
 
 
249 aa  65.5  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  30.8 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2372  hypothetical protein  32.69 
 
 
259 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  35.47 
 
 
252 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  30.88 
 
 
280 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01585  hypothetical protein  30.28 
 
 
268 aa  63.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  32.47 
 
 
262 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  28.22 
 
 
236 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  38.75 
 
 
278 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0625  protein of unknown function DUF218  32.72 
 
 
248 aa  63.5  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050402  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  33.9 
 
 
259 aa  63.2  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  36.71 
 
 
278 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  30.52 
 
 
254 aa  62.8  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  36.71 
 
 
265 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2048  hypothetical protein  31.41 
 
 
264 aa  62  0.000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000229439  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  31.46 
 
 
251 aa  62  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  34.67 
 
 
284 aa  62  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1466  hypothetical protein  29.15 
 
 
260 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2459  protein of unknown function DUF218  28.68 
 
 
256 aa  60.1  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1258  hypothetical protein  37.25 
 
 
268 aa  60.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4631  hypothetical protein  30.81 
 
 
224 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.189106  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2380  hypothetical protein  38.46 
 
 
253 aa  59.7  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1009  hypothetical protein  30.3 
 
 
224 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1490  hypothetical protein  30.3 
 
 
224 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  32.3 
 
 
250 aa  58.5  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  34.02 
 
 
256 aa  58.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2730  protein of unknown function DUF218  30.23 
 
 
279 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.111496 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  31.54 
 
 
264 aa  58.5  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  28.02 
 
 
287 aa  58.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1021  hypothetical protein  29.7 
 
 
267 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47504  normal  0.0154431 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  32.35 
 
 
301 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4675  hypothetical protein  32.57 
 
 
270 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139137  normal  0.101849 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1908  hypothetical protein  34.71 
 
 
240 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1256  hypothetical protein  33.83 
 
 
195 aa  57  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202454  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  32.43 
 
 
266 aa  57  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  25.29 
 
 
192 aa  57  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1731  hypothetical protein  34.71 
 
 
240 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1073  hypothetical protein  34.71 
 
 
240 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  36.02 
 
 
275 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1516  hypothetical protein  34.71 
 
 
240 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.746081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0183  hypothetical protein  34.71 
 
 
240 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00678491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1753  hypothetical protein  34.71 
 
 
240 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  36.81 
 
 
235 aa  55.5  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  33.77 
 
 
268 aa  54.7  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  30.94 
 
 
246 aa  55.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  30.2 
 
 
262 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  32.11 
 
 
282 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  28.19 
 
 
262 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  33.83 
 
 
336 aa  53.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1732  protein of unknown function DUF218  31.53 
 
 
250 aa  52.4  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000709574  normal  0.252079 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  33.11 
 
 
268 aa  52.4  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>