More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3435 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3435  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  569  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3168  transglutaminase domain protein  66.3 
 
 		 274 aa  384  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.837048 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2903  transglutaminase domain protein  65.2 
 
 		 274 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0573508  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4480  transglutaminase domain-containing protein  61.4 
 
 		 272 aa  358  6e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3526  transglutaminase domain-containing protein  52.83 
 
 		 265 aa  295  7e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3244  putative transglutaminase-like superfamily protein  51.45 
 
 		 278 aa  289  3e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2678  transglutaminase-like  49.26 
 
 		 273 aa  273  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2116  transglutaminase-like  48.11 
 
 		 265 aa  261  8e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.239433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2773  transglutaminase-like  47.17 
 
 		 270 aa  252  5.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0008  transglutaminase domain-containing protein  47.37 
 
 		 266 aa  246  3e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.528784 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1813  transglutaminase-like protein  46.72 
 
 		 267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.104959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0825  transglutaminase domain-containing protein  47.76 
 
 		 268 aa  217  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0677  hypothetical protein  35.99 
 
 		 318 aa  198  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2054  transglutaminase-like superfamily protein  35.99 
 
 		 318 aa  198  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0768  hypothetical protein  35.99 
 
 		 318 aa  198  7e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2490  transglutaminase domain protein  39.55 
 
 		 296 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0150331  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1779  hypothetical protein  35.99 
 
 		 318 aa  198  9e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.605837  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2039  hypothetical protein  35.99 
 
 		 318 aa  198  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.254849  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1064  hypothetical protein  35.99 
 
 		 318 aa  198  9e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0771  hypothetical protein  35.99 
 
 		 318 aa  198  9e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.807842  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2214  transglutaminase domain-containing protein  39.18 
 
 		 286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.032796  normal  0.659525 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2171  transglutaminase domain protein  37.92 
 
 		 287 aa  193  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1920  transglutaminase-like domain-containing protein  35.37 
 
 		 318 aa  192  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1565  transglutaminase domain-containing protein  43.43 
 
 		 268 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0772792  normal  0.176972 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2417  hypothetical protein  42.06 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3159  transglutaminase-like  37.91 
 
 		 279 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.403186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2469  transglutaminase domain protein  38.27 
 
 		 275 aa  188  9e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340077  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1080  transglutaminase domain-containing protein  42.06 
 
 		 269 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5275  hypothetical protein  39.18 
 
 		 282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.224693 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1942  transglutaminase domain-containing protein  39.19 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3218  transglutaminase-like  38.63 
 
 		 274 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2238  transglutaminase-like  37.32 
 
 		 274 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.912675  normal  0.353146 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0521  transglutaminase domain-containing protein  36.82 
 
 		 275 aa  176  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.273885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0393  transglutaminase-like protein  38.85 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6765  transglutaminase domain-containing protein  38.85 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.935495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7512  transglutaminase domain protein  37.69 
 
 		 282 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0488418  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0582  transglutaminase domain-containing protein  38.13 
 
 		 275 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.116257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4513  transglutaminase domain-containing protein  36.43 
 
 		 268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.863686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1934  transglutaminase-like enzyme putative cysteine protease-like  32.61 
 
 		 329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156381  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3521  transglutaminase domain-containing protein  40.59 
 
 		 338 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4004  transglutaminase domain-containing protein  40.1 
 
 		 334 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.218888  normal  0.154625 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3574  hypothetical protein  37.88 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0538  transglutaminase domain-containing protein  35.74 
 
 		 264 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1429  transglutaminase domain-containing protein  35.21 
 
 		 265 aa  156  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2061  transglutaminase-like domain protein  36.74 
 
 		 276 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0989032  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42140  transglutaminase-like domain-containing protein  37.12 
 
 		 266 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1737  transglutaminase-like  36.84 
 
 		 269 aa  155  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2595  transglutaminase domain-containing protein  36.59 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0734804  normal  0.508251 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1871  transglutaminase-like  36.74 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4109  transglutaminase domain-containing protein  43.07 
 
 		 331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3413  transglutaminase domain-containing protein  39.9 
 
 		 335 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.452972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4256  transglutaminase-like  39.9 
 
 		 335 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0500098  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4110  transglutaminase domain-containing protein  39.9 
 
 		 335 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0765  transglutaminase family protein  35.98 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4445  transglutaminase domain protein  36.4 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3576  transglutaminase domain protein  34.75 
 
 		 273 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.837737  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0362  transglutaminase domain protein  34.36 
 
 		 273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1085  transglutaminase-like  34.41 
 
 		 291 aa  145  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3318  transglutaminase-like  31.8 
 
 		 323 aa  142  8e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.695082 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0966  transglutaminase domain protein  36.69 
 
 		 281 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0488801 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1123  hypothetical protein  35.71 
 
 		 292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.484773  normal  0.370646 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3538  transglutaminase domain-containing protein  33.22 
 
 		 289 aa  138  7.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.802983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1208  transglutaminase domain-containing protein  35.14 
 
 		 272 aa  137  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.667068  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3108  transglutaminase domain-containing protein  34.6 
 
 		 259 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3155  transglutaminase-like  35.51 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0530774  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3067  transglutaminase domain-containing protein  33.84 
 
 		 259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256607  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2686  transglutaminase-like domain-containing protein  33.84 
 
 		 259 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1062  transglutaminase domain protein  35.14 
 
 		 281 aa  135  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2196  transglutaminase domain-containing protein  30.74 
 
 		 326 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327421  normal  0.29997 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3273  transglutaminase domain-containing protein  30.82 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0832457  normal  0.311431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3759  transglutaminase domain-containing protein  30 
 
 		 311 aa  133  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal  0.0225337 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1016  transglutaminase domain protein  31.76 
 
 		 293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3013  transglutaminase domain-containing protein  34.07 
 
 		 259 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1049  transglutaminase-like protein  35.09 
 
 		 293 aa  132  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.085714  normal  0.734102 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1744  transglutaminase domain-containing protein  32.25 
 
 		 272 aa  132  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.178169  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5583  transglutaminase domain protein  29.64 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.700656 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1185  transglutaminase-like  31.25 
 
 		 272 aa  129  7.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0731  transglutaminase domain protein  30.8 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3161  transglutaminase-like  31.08 
 
 		 316 aa  125  9e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162529  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1751  transglutaminase domain protein  30.15 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118558  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1403  transglutaminase-like  31.88 
 
 		 272 aa  122  6e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4273  transglutaminase domain protein  31.96 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.854777  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1065  transglutaminase domain protein  29.89 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.681603  normal  0.333108 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4253  transglutaminase-like  30.59 
 
 		 366 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0321822  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3412  transglutaminase domain-containing protein  29.08 
 
 		 318 aa  119  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4113  transglutaminase domain-containing protein  30.59 
 
 		 367 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2249  transglutaminase domain protein  29.14 
 
 		 300 aa  119  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3031  transglutaminase domain-containing protein  29.25 
 
 		 317 aa  119  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0986  transglutaminase domain-containing protein  28.23 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3410  transglutaminase domain-containing protein  30.26 
 
 		 361 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.753732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2254  transglutaminase domain protein  27.78 
 
 		 308 aa  116  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580193 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5077  transglutaminase domain-containing protein  30.87 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.343486 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1931  transglutaminase-like  31.25 
 
 		 344 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0645  transglutaminase domain protein  31.86 
 
 		 288 aa  115  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3585  transglutaminase-like  30.07 
 
 		 1128 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.222679  normal  0.726735 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2949  putative transaminase-like enzyme  29.55 
 
 		 292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.172083 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1714  transglutaminase-like  29.55 
 
 		 292 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.242614  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0395  transglutaminase domain-containing protein  28.62 
 
 		 295 aa  112  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1215  transglutaminase domain protein  32.18 
 
 		 280 aa  112  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1706  transglutaminase-like  29.21 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.163811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>