235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1093 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1093  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  471  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.317381  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0715  putative thiol-disulfide oxidoreductase protein  59.14 
 
 		 256 aa  299  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0656  DSBA oxidoreductase  64.52 
 
 		 256 aa  292  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  61.61 
 
 		 269 aa  273  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  60.62 
 
 		 217 aa  251  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  60.75 
 
 		 220 aa  246  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  60.62 
 
 		 244 aa  246  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  60.42 
 
 		 229 aa  245  4e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1603  DSBA oxidoreductase  51.12 
 
 		 229 aa  190  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.087263 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3372  DsbA oxidoreductase  45.67 
 
 		 217 aa  189  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0716  DsbA oxidoreductase  47.62 
 
 		 214 aa  189  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.47866  normal  0.709389 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3177  DsbA oxidoreductase  48.9 
 
 		 217 aa  188  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3501  DsbA oxidoreductase  48.9 
 
 		 217 aa  188  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  43.12 
 
 		 216 aa  187  9e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  47.37 
 
 		 270 aa  182  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0746  DSBA oxidoreductase  49.44 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524858  normal  0.916851 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  41.36 
 
 		 210 aa  176  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7654  DsbA oxidoreductase  46.33 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0601278  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6941  DSBA oxidoreductase  46.63 
 
 		 214 aa  172  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0159704 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  42.78 
 
 		 243 aa  166  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  40.71 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  40 
 
 		 220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  37.78 
 
 		 218 aa  155  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  37.44 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  37.61 
 
 		 223 aa  148  6e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  37.99 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1068  twin-arginine translocation pathway signal  38.39 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1197  twin-arginine translocation pathway signal  37.55 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0400  protein-disulfide isomerase-like protein  35.14 
 
 		 209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1464  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  37.43 
 
 		 228 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336066  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0115  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  37.43 
 
 		 223 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  39.08 
 
 		 217 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2095  DSBA oxidoreductase  35.38 
 
 		 223 aa  125  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4371  DSBA oxidoreductase  36.32 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2643  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  33.51 
 
 		 233 aa  122  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0062  DSBA oxidoreductase  35.67 
 
 		 223 aa  121  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.381736 
 
 
-
 
NC_002978  WD1055  hypothetical protein  35.03 
 
 		 234 aa  118  9e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0635294  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0065  DSBA oxidoreductase  34.73 
 
 		 205 aa  117  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0319526 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0776  hypothetical protein  31.53 
 
 		 239 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.739404  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4693  protein-disulfide isomerase-like protein  31.58 
 
 		 247 aa  116  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68615  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0234  hypothetical protein  31.82 
 
 		 240 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4372  DSBA oxidoreductase  36.42 
 
 		 211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2197  protein-disulfide isomerase-like protein  35.71 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.67008 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0397  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  28.19 
 
 		 227 aa  112  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  32.92 
 
 		 240 aa  99  5e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  32.58 
 
 		 265 aa  98.2  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 263 aa  97.4  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  30.28 
 
 		 269 aa  97.1  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  31.6 
 
 		 268 aa  95.1  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2198  protein-disulfide isomerase-like protein  28.72 
 
 		 252 aa  92.4  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.668771 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0900  hypothetical protein  31.64 
 
 		 230 aa  90.9  1e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000692645  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  30.56 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  28.99 
 
 		 227 aa  85.9  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  30.64 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  32.43 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0958  protein-disulfide isomerase  27.27 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0150276  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  28.35 
 
 		 251 aa  81.6  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0956  protein-disulfide isomerase  27.94 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00982251  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1857  DSBA oxidoreductase  29.65 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4692  protein-disulfide isomerase-like protein  29.1 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  27.75 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  27.98 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2269  protein-disulfide isomerase  25.58 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.669339 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  27.33 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  28.48 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  30.41 
 
 		 173 aa  71.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0467  DSBA oxidoreductase  30.34 
 
 		 217 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00160991  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  26.78 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  30.72 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  30.65 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0580  hypothetical protein  29.78 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00216301  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  28.02 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  27.78 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4758  hypothetical protein  29.78 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000311351  hitchhiker  1.34293e-20 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0953  thiol:disulfide interchange protein  25.58 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.452508  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  29.03 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1058  putative disulfide bond formation protein D  25.58 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.745592  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  28.76 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  28.33 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0459  DSBA oxidoreductase  29.21 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499597  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0598  hypothetical protein  29.21 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000289982  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2268  protein-disulfide isomerase  27.37 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.873653  normal  0.987426 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0618  hypothetical protein  29.21 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  30.77 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  29.34 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0452  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  29.21 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000602579  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0544  hypothetical protein  28.09 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000359275  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  31.82 
 
 		 335 aa  65.5  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0513  hypothetical protein  28.09 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000298764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0456  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  28.09 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000730709  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  27.23 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  32.91 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  26.74 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  29.95 
 
 		 349 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  30.48 
 
 		 348 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  29.95 
 
 		 349 aa  62  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0544  hypothetical protein  27.53 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00366e-53 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3958  DSBA oxidoreductase  27.88 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>