156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0290 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  100 
 
 
227 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0288  Excalibur  83.48 
 
 
114 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  39.32 
 
 
233 aa  143  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  43.53 
 
 
183 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  46.85 
 
 
162 aa  130  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1467  Excalibur domain-containing protein  36.82 
 
 
259 aa  119  3e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3653  nuclease (SNase domain protein)  42.14 
 
 
171 aa  118  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3707  nuclease (SNase domain protein)  42.14 
 
 
171 aa  118  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.112464  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0135  nuclease (SNase-like)  41.86 
 
 
142 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000156916  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  36.06 
 
 
196 aa  106  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  39.57 
 
 
155 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  36.42 
 
 
227 aa  103  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  37.13 
 
 
232 aa  102  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  34.59 
 
 
186 aa  99.8  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  38.31 
 
 
187 aa  99  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  33.73 
 
 
162 aa  97.4  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  34.27 
 
 
183 aa  94.4  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  35.26 
 
 
171 aa  94.4  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  38.89 
 
 
171 aa  93.2  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  32.37 
 
 
187 aa  92.4  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  32.58 
 
 
179 aa  90.1  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  30.57 
 
 
216 aa  90.1  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  36 
 
 
238 aa  89  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  33.13 
 
 
192 aa  88.6  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 
206 aa  87.8  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  35.47 
 
 
175 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  33.74 
 
 
185 aa  85.9  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  33.12 
 
 
148 aa  85.9  5e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  35.25 
 
 
169 aa  85.5  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  35.48 
 
 
158 aa  85.1  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  30.32 
 
 
244 aa  85.1  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  30.34 
 
 
180 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  39.55 
 
 
153 aa  83.6  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  29.88 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  35.04 
 
 
157 aa  82.4  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  34 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  32.3 
 
 
175 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  28.88 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  33.33 
 
 
164 aa  80.5  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  32.92 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  31.68 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  34.57 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  28.45 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  32.68 
 
 
175 aa  79  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  31.48 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  28.87 
 
 
225 aa  77.4  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  30.91 
 
 
184 aa  77.4  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  30.43 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  29.19 
 
 
169 aa  76.3  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  31.25 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  31.07 
 
 
168 aa  73.2  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  36.96 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  27.85 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  36.62 
 
 
171 aa  72.4  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  36.96 
 
 
153 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  30 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  30.63 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  34.72 
 
 
169 aa  70.1  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  29.01 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  32.73 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  33.33 
 
 
193 aa  67.8  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  35.25 
 
 
200 aa  67  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0805  nuclease (SNase-like)  25.88 
 
 
165 aa  66.6  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  33.91 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  30.57 
 
 
227 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  27.01 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  34.07 
 
 
150 aa  64.3  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06071  micrococcal nuclease  32.79 
 
 
185 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.312315  normal  0.542138 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  34.31 
 
 
182 aa  64.7  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  32.85 
 
 
214 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  28.99 
 
 
185 aa  63.9  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  32.14 
 
 
194 aa  63.9  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  32.85 
 
 
226 aa  62.8  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2235  nuclease (SNase domain protein)  29.17 
 
 
193 aa  62.8  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.197015 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  27.17 
 
 
167 aa  62.4  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  28.89 
 
 
138 aa  62.4  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2219  nuclease (SNase domain protein)  26.14 
 
 
205 aa  62.4  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02570  mitochondrion protein, putative  30.72 
 
 
282 aa  62.4  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.514055  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  31.71 
 
 
175 aa  62  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  30 
 
 
158 aa  62  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  31.29 
 
 
157 aa  62  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  31.5 
 
 
209 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  30.05 
 
 
227 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  29.03 
 
 
192 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  31.62 
 
 
166 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00761  hypothetical protein  31.11 
 
 
155 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.489486 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  34.56 
 
 
220 aa  60.1  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  30.46 
 
 
183 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  31.33 
 
 
179 aa  59.7  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  29.47 
 
 
183 aa  59.7  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  33.58 
 
 
214 aa  58.5  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  29.63 
 
 
183 aa  58.2  0.00000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  31.06 
 
 
136 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  26.83 
 
 
166 aa  56.6  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  27.82 
 
 
228 aa  56.6  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  27.82 
 
 
228 aa  56.6  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  29.56 
 
 
202 aa  55.8  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  28.57 
 
 
171 aa  55.5  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  29.19 
 
 
171 aa  55.5  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3244  nuclease (SNase domain protein)  28.57 
 
 
163 aa  55.5  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.731503 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>