More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4756 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4756  peptidase M23B  100 
 
 
333 aa  679    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0919319  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  57.94 
 
 
727 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  57.94 
 
 
727 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  57.98 
 
 
751 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  48.04 
 
 
195 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  54.96 
 
 
754 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  59.5 
 
 
590 aa  154  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  62.18 
 
 
198 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  62.18 
 
 
198 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1888  Peptidase M23  59.52 
 
 
511 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000847553  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  52.76 
 
 
824 aa  141  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4610  peptidase M23  53.85 
 
 
788 aa  128  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000163265  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  48.8 
 
 
333 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  50 
 
 
351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  44.27 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  41.83 
 
 
358 aa  113  6e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14641  LysM motif-containing protein  48.06 
 
 
360 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.318084 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  46.32 
 
 
376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  44.85 
 
 
446 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  48.31 
 
 
452 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  49.58 
 
 
348 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  49.21 
 
 
324 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  43.61 
 
 
527 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  47.46 
 
 
349 aa  105  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  47.86 
 
 
270 aa  104  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  50 
 
 
447 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  41.3 
 
 
491 aa  104  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  50 
 
 
447 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  41.27 
 
 
494 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  46.27 
 
 
309 aa  102  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0088  peptidase M23B  48.62 
 
 
295 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  45.9 
 
 
297 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2752  lipoprotein NlpD, putative  46.4 
 
 
295 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112943  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  45.45 
 
 
412 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  49.19 
 
 
419 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  49.5 
 
 
441 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  44.3 
 
 
252 aa  101  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  48.74 
 
 
582 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  40.98 
 
 
501 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7396  Peptidase M23  40.98 
 
 
537 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128641  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  46.34 
 
 
465 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2780  peptidase M23B  44.17 
 
 
292 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.139555  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  49.06 
 
 
695 aa  100  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1082  Peptidase M23  45.08 
 
 
303 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.103445  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  50 
 
 
431 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  42.96 
 
 
442 aa  100  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  47.24 
 
 
293 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1162  peptidase M23B  45.08 
 
 
303 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.465665  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  44.8 
 
 
296 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  44.8 
 
 
233 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  45.08 
 
 
294 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  44.8 
 
 
296 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  45.08 
 
 
300 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  50 
 
 
457 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  40.14 
 
 
414 aa  100  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  44.8 
 
 
233 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  44.8 
 
 
233 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  44.8 
 
 
233 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  44.8 
 
 
236 aa  99.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5027  peptidase M23B  45.9 
 
 
292 aa  100  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  40.54 
 
 
224 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  47.15 
 
 
284 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  50 
 
 
665 aa  99.8  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  44.26 
 
 
292 aa  99.8  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  45.08 
 
 
291 aa  99.8  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  41.83 
 
 
230 aa  99.4  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  50 
 
 
229 aa  99.4  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2231  peptidase M23B  35.87 
 
 
247 aa  99  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000597073  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  49.57 
 
 
285 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4750  Peptidase M23  45.22 
 
 
446 aa  99  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  49.57 
 
 
262 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  41.35 
 
 
427 aa  99  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  47.93 
 
 
288 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  47.93 
 
 
288 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0884  M24/M37 family peptidase  41.35 
 
 
427 aa  99  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  48.51 
 
 
648 aa  99  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  49.57 
 
 
262 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  41.98 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  46.3 
 
 
299 aa  98.6  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  44.19 
 
 
430 aa  98.6  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4231  peptidase M23B  44.35 
 
 
451 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  47.12 
 
 
456 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  49.48 
 
 
282 aa  97.8  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  44.88 
 
 
375 aa  97.8  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  53.47 
 
 
328 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  43.2 
 
 
304 aa  98.2  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  48.06 
 
 
230 aa  97.8  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4601  Peptidase M23  44.35 
 
 
455 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0813649  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  49.09 
 
 
386 aa  97.4  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  43.2 
 
 
301 aa  97.4  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  48.08 
 
 
459 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0251  M23 peptidase domain protein  47.22 
 
 
341 aa  97.4  3e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  41.26 
 
 
443 aa  97.4  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  37.93 
 
 
385 aa  97.4  3e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  44.72 
 
 
240 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  50.5 
 
 
394 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  49.57 
 
 
285 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  45.45 
 
 
360 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2472  peptidase M23B  45 
 
 
446 aa  97.1  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000997494  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  45.45 
 
 
360 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>