More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3605 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  100 
 
 
471 aa  932    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2922  trigger factor  75.22 
 
 
460 aa  699    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.583147  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0586  trigger factor  55.6 
 
 
485 aa  520  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.960131  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4363  trigger factor  52.15 
 
 
500 aa  475  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3133  trigger factor  51.69 
 
 
479 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3171  trigger factor  50 
 
 
455 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2925  trigger factor  50 
 
 
455 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2524  trigger factor  48.41 
 
 
474 aa  433  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0066  trigger factor  44.39 
 
 
469 aa  377  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0063  trigger factor  44.02 
 
 
447 aa  374  1e-102  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.461988  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00701  trigger factor  44.85 
 
 
479 aa  360  3e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.195146 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17811  trigger factor  41.31 
 
 
471 aa  347  3e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1253  trigger factor  39.36 
 
 
472 aa  332  1e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18451  trigger factor  39.09 
 
 
473 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.344876  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1747  trigger factor  39.73 
 
 
481 aa  326  7e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21241  trigger factor  38.52 
 
 
472 aa  325  1e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18451  trigger factor  39.68 
 
 
477 aa  324  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.546976  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18641  trigger factor  39.54 
 
 
474 aa  321  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0250835  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  33.26 
 
 
429 aa  236  8e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  34.15 
 
 
428 aa  232  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  33.62 
 
 
446 aa  231  3e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  32.89 
 
 
438 aa  228  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  32.58 
 
 
433 aa  223  4e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  32.29 
 
 
428 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  33.17 
 
 
436 aa  223  8e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  33.63 
 
 
428 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  31.63 
 
 
435 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  32.36 
 
 
435 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  31.99 
 
 
433 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  31.38 
 
 
433 aa  219  1e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  32.21 
 
 
431 aa  216  5e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  33.33 
 
 
432 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  32.6 
 
 
428 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  31.43 
 
 
435 aa  212  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  33.7 
 
 
427 aa  210  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  32.05 
 
 
446 aa  209  8e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  31.08 
 
 
433 aa  209  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  31.08 
 
 
433 aa  209  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  30.75 
 
 
439 aa  208  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  31.28 
 
 
438 aa  207  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  35.27 
 
 
425 aa  207  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  30.46 
 
 
435 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  33.25 
 
 
488 aa  204  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  33.9 
 
 
425 aa  200  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  33.9 
 
 
425 aa  200  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  33.9 
 
 
425 aa  200  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  33.9 
 
 
425 aa  200  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  33.9 
 
 
425 aa  200  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  33.9 
 
 
425 aa  200  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  33.9 
 
 
425 aa  200  6e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  29.16 
 
 
426 aa  199  9e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  33.66 
 
 
425 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  33.66 
 
 
425 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  29.93 
 
 
437 aa  194  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  30.61 
 
 
428 aa  193  6e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1167  trigger factor  31.2 
 
 
449 aa  189  1e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000324107  unclonable  1.0795e-27 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  28.44 
 
 
440 aa  186  8e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1430  trigger factor  31.65 
 
 
500 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0191  trigger factor  31.32 
 
 
427 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000200487  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  31.96 
 
 
435 aa  184  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  31.21 
 
 
438 aa  182  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  30.07 
 
 
435 aa  182  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_614  trigger factor  28.22 
 
 
447 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0105  trigger factor  32.09 
 
 
427 aa  179  1e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00110725  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  33.08 
 
 
428 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  29.17 
 
 
442 aa  178  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  33.08 
 
 
428 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1730  FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (trigger factor)  30.86 
 
 
439 aa  175  1.9999999999999998e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  29.65 
 
 
448 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  29.2 
 
 
437 aa  171  2e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  29.2 
 
 
437 aa  171  3e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  29.64 
 
 
478 aa  170  5e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  28.73 
 
 
444 aa  170  6e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0709  trigger factor  27.72 
 
 
448 aa  169  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0332247  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0644  trigger factor  27.78 
 
 
447 aa  169  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0575184  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  29.88 
 
 
430 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1204  trigger factor  32.46 
 
 
483 aa  167  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00286566  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  30.86 
 
 
430 aa  167  4e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2341  trigger factor  28.41 
 
 
435 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0955017  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  30.73 
 
 
434 aa  166  9e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  31.05 
 
 
463 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1052  trigger factor  29.4 
 
 
436 aa  165  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.271943  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2037  trigger factor  32.17 
 
 
433 aa  164  3e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  31.31 
 
 
441 aa  163  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3879  trigger factor  29.17 
 
 
448 aa  163  7e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129636  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2048  trigger factor  29.63 
 
 
454 aa  163  7e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  29.47 
 
 
429 aa  163  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  29.56 
 
 
451 aa  162  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1460  trigger factor  30.64 
 
 
461 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524042  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1735  trigger factor  27.8 
 
 
433 aa  162  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  28.97 
 
 
427 aa  161  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  29.22 
 
 
429 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0198  trigger factor  27.85 
 
 
435 aa  160  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  28.89 
 
 
434 aa  160  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3500  trigger factor  28.68 
 
 
465 aa  160  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216991  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4984  trigger factor  27.58 
 
 
448 aa  159  9e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  29.52 
 
 
434 aa  159  9e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000123079  hitchhiker  0.00000434188 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  31.05 
 
 
434 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000721258  hitchhiker  0.0000390702 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0488  trigger factor  29.69 
 
 
433 aa  159  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0133776  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7292  trigger factor  31.14 
 
 
468 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46399  normal  0.713748 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>