More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2419 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2419  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 124 aa  245  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.730066  hitchhiker  0.0000120546 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0239  response regulator receiver domain-containing protein  57.26 
 
 		 132 aa  150  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3504  response regulator receiver protein  55.65 
 
 		 127 aa  143  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4227  response regulator receiver protein  54.03 
 
 		 130 aa  142  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.482069  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2946  response regulator receiver protein  56.56 
 
 		 124 aa  140  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1722  response regulator receiver protein  48.36 
 
 		 123 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000956357 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3993  response regulator receiver protein  46.77 
 
 		 124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0199898 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3719  response regulator receiver protein  46.49 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.173125  normal  0.315103 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3665  response regulator receiver protein  46.49 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1627  response regulator receiver domain-containing protein  43.44 
 
 		 125 aa  113  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.113437 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0856  response regulator receiver protein  45.53 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0534273 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4550  response regulator receiver protein  45.16 
 
 		 127 aa  110  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0840  response regulator receiver protein  45.3 
 
 		 132 aa  104  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0213  response regulator receiver domain-containing protein  46.96 
 
 		 128 aa  103  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1519  response regulator receiver protein  44.26 
 
 		 125 aa  101  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.043846  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3140  response regulator receiver protein  41.94 
 
 		 128 aa  100  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4105  response regulator receiver domain-containing protein  46.55 
 
 		 229 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0374743 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0347  response regulator receiver protein  40.32 
 
 		 132 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4314  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 128 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7882  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 234 aa  94.4  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1040  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.32 
 
 		 365 aa  94  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0162  response regulator receiver domain-containing protein  37.4 
 
 		 127 aa  94  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1626  response regulator receiver domain-containing protein  41.13 
 
 		 134 aa  93.6  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5515  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 134 aa  91.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  41.8 
 
 		 241 aa  88.2  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  36.89 
 
 		 231 aa  88.2  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 1341 aa  87.4  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  36.89 
 
 		 231 aa  87.4  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.84 
 
 		 348 aa  86.3  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0653  two-component response regulator PhoB  38.71 
 
 		 230 aa  86.3  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.131558  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3942  response regulator receiver protein  43.81 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0589  response regulator receiver modulated serine phosphatase  37.4 
 
 		 371 aa  85.5  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.420228  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2185  response regulator receiver  35.59 
 
 		 356 aa  85.5  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0743  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.96 
 
 		 310 aa  85.1  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1632  response regulator receiver  41.8 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0584  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 216 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0767221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  37.29 
 
 		 170 aa  84.3  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  37.1 
 
 		 352 aa  84.7  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1271  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.19 
 
 		 350 aa  84.3  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0333  response regulator receiver protein  39.67 
 
 		 126 aa  83.6  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.139071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  36.67 
 
 		 231 aa  83.6  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.2 
 
 		 230 aa  83.6  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4150  response regulator receiver protein  43.8 
 
 		 125 aa  83.6  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.583085 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 1010 aa  83.6  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  38.18 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.17 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.25 
 
 		 687 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.2 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  32.2 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4410  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 131 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.686937 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.04 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5556  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.17 
 
 		 352 aa  82.4  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487576  normal  0.0420739 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1037  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2427  two component LuxR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.27075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0631  response regulator receiver protein  37.9 
 
 		 123 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  40.74 
 
 		 1349 aa  82  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2671  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.5 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.32 
 
 		 1002 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  34.15 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0640  response regulator receiver protein  37.1 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1263  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  37.19 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0766  two component signal transduction response regulator  35.9 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  33.61 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1748  response regulator receiver  37.5 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 230 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.96 
 
 		 354 aa  81.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2543  response regulator receiver protein  35 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2692  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.52 
 
 		 229 aa  80.9  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0845  response regulator receiver protein  38.18 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  0.167506 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.75 
 
 		 326 aa  80.9  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4530  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.84 
 
 		 386 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0606  response regulator receiver domain-containing protein  37.1 
 
 		 123 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4003  response regulator  40.34 
 
 		 357 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2649  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.857048  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1161  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  35.83 
 
 		 248 aa  80.5  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0650  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.438565  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  35.25 
 
 		 235 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  35.25 
 
 		 235 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  35.25 
 
 		 235 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1488  two component transcriptional regulator  37.29 
 
 		 228 aa  80.5  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00208742  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  35.25 
 
 		 235 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  35.25 
 
 		 235 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.13 
 
 		 226 aa  80.1  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2472  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 216 aa  80.5  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  35.25 
 
 		 235 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  34.75 
 
 		 326 aa  80.5  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  35.25 
 
 		 235 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.83 
 
 		 236 aa  80.5  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2827  two component transcriptional regulator  34.19 
 
 		 230 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0648  diguanylate phosphodiesterase  38.14 
 
 		 403 aa  80.1  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.215101 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  35.25 
 
 		 235 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  35.25 
 
 		 235 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  35.25 
 
 		 235 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  35.25 
 
 		 235 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1236  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.21 
 
 		 386 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.493129  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>