More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1735 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1735  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 452 aa  894    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.51734  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2649  amino acid permease-associated region  67.59 
 
 		 450 aa  522  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2694  amino acid permease-associated region  67.59 
 
 		 450 aa  522  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0425419 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2678  amino acid permease-associated region  67.33 
 
 		 420 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0723531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00403  Amino acid permease-associated region  47.02 
 
 		 441 aa  400  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.613152  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3604  amino acid permease-associated region  50.23 
 
 		 445 aa  379  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.466276 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3942  amino acid permease-associated region  50.23 
 
 		 445 aa  379  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1908  amino acid permease-associated region  46.26 
 
 		 440 aa  376  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00117224  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1932  amino acid transporter  45.91 
 
 		 437 aa  373  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.392371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2108  amino acid permease-associated region  43.41 
 
 		 445 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0129  amino acid permease-associated region  42.57 
 
 		 451 aa  335  9e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0181  amino acid permease-associated region  44.72 
 
 		 443 aa  332  6e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0717  amino acid permease-associated region  29.75 
 
 		 434 aa  152  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00000167398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0278  amino acid permease-associated region  31.61 
 
 		 434 aa  143  8e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1136  amino acid permease-associated region  30.4 
 
 		 447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.304278 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00437  predicted transporter  30.1 
 
 		 430 aa  133  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.936072  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00442  hypothetical protein  30.1 
 
 		 430 aa  133  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0579  amino acid permease family protein  30.1 
 
 		 430 aa  133  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3124  amino acid permease-associated region  30.1 
 
 		 430 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.554048  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0565  amino acid permease family protein  30.1 
 
 		 430 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0525  amino acid permease family protein  30.1 
 
 		 430 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3130  amino acid permease-associated region  30.1 
 
 		 430 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  hitchhiker  0.000108674 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0529  amino acid permease family protein  30.1 
 
 		 430 aa  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0421  amino acid permease family protein  29.85 
 
 		 430 aa  132  9e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0069  amino acid transporter  27.84 
 
 		 433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.266806  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1272  amino acid permease-associated region  28.24 
 
 		 431 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0803  amino acid transporter  30.31 
 
 		 429 aa  117  6e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1315  amino acid permease-associated region  27.6 
 
 		 441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.172576  normal  0.0920117 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1066  amino acid permease-associated region  28.13 
 
 		 425 aa  99.4  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0070  amino acid transporter  28.74 
 
 		 279 aa  95.9  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.462473  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  24.41 
 
 		 453 aa  90.5  5e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  27.27 
 
 		 770 aa  88.2  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  23.67 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1779  hypothetical protein  24.44 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3650  putative amino acid permease  24.68 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.171718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0624  hypothetical protein  27.66 
 
 		 411 aa  82.8  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2530  amino acid permease-associated region  24.51 
 
 		 449 aa  79.7  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.480015  normal  0.105308 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1266  amino acid permease-associated region  27.19 
 
 		 474 aa  77.8  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3419  putative amino acid permease  26.26 
 
 		 425 aa  78.2  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0356803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3674  amino acid permease-associated region  24.92 
 
 		 549 aa  77.4  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0328426  normal  0.284517 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0357  hypothetical protein  24.37 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  25.77 
 
 		 786 aa  77.4  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0522  amino acid permease-associated region  27.83 
 
 		 472 aa  77.4  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  30.23 
 
 		 745 aa  77  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0683  amino acid permease-associated region  27.11 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  24.31 
 
 		 486 aa  76.6  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  24.31 
 
 		 486 aa  76.6  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  23.56 
 
 		 764 aa  76.3  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  27.59 
 
 		 716 aa  76.3  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2434  amino acid transporter  26.11 
 
 		 446 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12010  permease  26.83 
 
 		 481 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  22.39 
 
 		 490 aa  75.1  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  23.15 
 
 		 439 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  25.3 
 
 		 486 aa  75.9  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1318  amino acid transporter  23.39 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00693769  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0900  amino acid permease-associated region  23.4 
 
 		 500 aa  74.3  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0333  hypothetical protein  23.97 
 
 		 394 aa  74.3  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  26.36 
 
 		 436 aa  73.9  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  23.87 
 
 		 489 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  24.27 
 
 		 496 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  24.27 
 
 		 496 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  21.03 
 
 		 438 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  21.03 
 
 		 438 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1150  amino acid permease-associated region  25 
 
 		 476 aa  70.5  0.00000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287534  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  21.08 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  21.12 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7626  amino acid permease-associated region  26.04 
 
 		 455 aa  70.1  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452611  normal  0.196485 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1526  amino acid permease-associated region  25.17 
 
 		 440 aa  69.7  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0740999  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1497  amino acid permease-associated region  25.17 
 
 		 440 aa  69.7  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.649602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  20.81 
 
 		 438 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  20.81 
 
 		 438 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  20.58 
 
 		 438 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6311  putative transporter  26.75 
 
 		 449 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72710  putative transporter  27 
 
 		 449 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1710  amino acid permease-associated region  24.09 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000301061  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  23.54 
 
 		 483 aa  68.2  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2679  amino acid permease-associated region  23.62 
 
 		 482 aa  67.8  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2625  amino acid permease-associated region  23.62 
 
 		 482 aa  67.8  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0475967  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4115  amino acid permease-associated region  25.34 
 
 		 516 aa  67.4  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  20.58 
 
 		 438 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 		 452 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  20.45 
 
 		 437 aa  67  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  24.5 
 
 		 429 aa  67  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  26.43 
 
 		 485 aa  67  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  23.91 
 
 		 496 aa  66.2  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  20.77 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  24.25 
 
 		 820 aa  65.1  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3301  amino acid permease-associated region  26.77 
 
 		 483 aa  65.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  hitchhiker  0.00374937 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  22.19 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2069  amino acid permease-associated region  25.49 
 
 		 456 aa  64.7  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1683  amino acid permease-associated region  26.43 
 
 		 431 aa  65.1  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0647256  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2158  amino acid permease family protein  23.06 
 
 		 483 aa  64.3  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1589  amino acid permease, putative  24.84 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000140221  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  25.93 
 
 		 486 aa  64.3  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  21.88 
 
 		 471 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  24.56 
 
 		 443 aa  64.3  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3228  amino acid permease-associated region  25.12 
 
 		 473 aa  64.3  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15980  amino acid transporter  25.43 
 
 		 461 aa  63.9  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133211  normal  0.0674026 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  28.16 
 
 		 454 aa  63.9  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1730  amino acid permease-associated region  26.25 
 
 		 481 aa  63.9  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>