160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0329 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0329  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  100 
 
 		 239 aa  470  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3041  ANTAR domain protein with unknown sensor  48.07 
 
 		 253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0494925  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3654  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  44.64 
 
 		 239 aa  185  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3171  putative GAF sensor protein  43.33 
 
 		 245 aa  182  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144795  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1754  ANTAR domain protein with unknown sensor  37.56 
 
 		 279 aa  125  9e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00308691  normal  0.111394 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4477  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.73 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0401437  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1566  ANTAR domain protein with unknown sensor  38.28 
 
 		 242 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1669  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.87 
 
 		 245 aa  121  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.371485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2152  ANTAR domain protein with unknown sensor  39.59 
 
 		 244 aa  121  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000502711  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1988  ANTAR domain protein with unknown sensor  35.84 
 
 		 268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000129104  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1464  ANTAR domain protein with unknown sensor  35.43 
 
 		 268 aa  117  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.731952  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1924  ANTAR domain-containing protein  33.33 
 
 		 248 aa  106  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2431  putative GAF sensor protein  33.94 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4213  putative GAF sensor protein  33.94 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.172358  normal  0.253818 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4968  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.98 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0279  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.12 
 
 		 245 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11950  response regulator with putative antiterminator output domain  34.07 
 
 		 246 aa  99.8  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3435  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.71 
 
 		 243 aa  99  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274405  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.01 
 
 		 266 aa  99  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1570  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.76 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3170  putative GAF sensor protein  34.95 
 
 		 246 aa  95.9  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.678761  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0345  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.33 
 
 		 256 aa  95.5  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2006  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.92 
 
 		 249 aa  94.4  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2311  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.9 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0082  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.73 
 
 		 270 aa  92.8  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.265172  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2607  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.17 
 
 		 243 aa  92.4  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0831  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.67 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4298  ANTAR domain protein  31.13 
 
 		 251 aa  89.4  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105151  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3633  ANTAR domain protein with unknown sensor  36.27 
 
 		 241 aa  89.4  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2237  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.63 
 
 		 253 aa  89  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2284  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.63 
 
 		 253 aa  89  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.24255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1809  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.11 
 
 		 228 aa  88.6  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2276  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.63 
 
 		 253 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.511511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2459  response regulator receiver and ANTAR domain protein  35.71 
 
 		 302 aa  87.8  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3559  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.61 
 
 		 265 aa  87.8  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000369232  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3022  ANTAR domain protein  31.39 
 
 		 245 aa  86.7  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.1824 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0363  ANTAR domain-containing protein  30.43 
 
 		 248 aa  85.9  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0199  ANTAR domain protein  31.63 
 
 		 225 aa  85.9  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3104  hypothetical protein  32.77 
 
 		 238 aa  85.5  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4880  ANTAR domain-containing protein with unknown sensor  31 
 
 		 252 aa  83.2  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4938  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.28 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0182005 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3254  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.57 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5218  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.82 
 
 		 266 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19880  putative RNA-binding protein  31.79 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.341339  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0243  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.4 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0253  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.4 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5205  ANTAR domain protein with unknown sensor  30.97 
 
 		 253 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.536596  normal  0.563697 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3842  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.31 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0552121 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04610  ANTAR/GAF domain-containing protein  29.34 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31.55 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0512355  hitchhiker  0.00413709 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4379  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.76 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.752612  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4466  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.76 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.981866  normal  0.0335822 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1050  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.7 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4760  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.76 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.186395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3173  putative GAF sensor protein  31.72 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149823  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4299  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.78 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0653  ANTAR domain protein with unknown sensor  32.98 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3800  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.55 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2553  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.75 
 
 		 235 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.888829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0513  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.98 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3742  putative PAS/PAC sensor protein  32.56 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159414  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0293  hypothetical protein  32.62 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1310  ANTAR domain protein with unknown sensor  33.85 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.32 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9006  hypothetical protein  31.01 
 
 		 235 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.782569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2804  GAF domain protein  28.31 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.546836  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2805  ANTAR domain protein with unknown sensor  28.84 
 
 		 258 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.977167  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0416  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.79 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2793  GAF domain protein  27.48 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.118942  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3463  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.71 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04560  response regulator with putative antiterminator output domain  31.58 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5219  putative GAF sensor protein  28.04 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2707  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 		 776 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1049  putative GAF sensor protein  30 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0255  putative GAF sensor protein  27.96 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  29.46 
 
 		 1629 aa  60.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3146  ANTAR domain protein with unknown sensor  29.14 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3147  hypothetical protein  28.64 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0659267  normal  0.203339 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5240  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.06 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5328  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.06 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.882574  normal  0.306486 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0224  GAF domain protein  29.5 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0122769  hitchhiker  0.00130008 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4879  ANTAR domain-containing protein  26.8 
 
 		 230 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.450036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0865  ANTAR domain protein with unknown sensor  27.35 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0262  hypothetical protein  29.78 
 
 		 295 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3737  diguanylate cyclase  30.38 
 
 		 396 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128619  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4627  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 662 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.622134  hitchhiker  0.00510111 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4493  hypothetical protein  30 
 
 		 252 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.0584861 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3631  signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 		 666 aa  53.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0281267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  32.31 
 
 		 906 aa  53.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2806  hypothetical protein  33.66 
 
 		 239 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 		 604 aa  52.4  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4451  signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 647 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0783644  hitchhiker  0.000419686 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2145  ANTAR domain-containing protein  28.15 
 
 		 251 aa  52  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.097692  normal  0.318843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.64 
 
 		 246 aa  50.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.501788  hitchhiker  0.00570166 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0336  ANTAR domain protein with unknown sensor  26.82 
 
 		 276 aa  50.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2264  putative GAF sensor protein  23.08 
 
 		 236 aa  49.7  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 725 aa  49.7  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17130  ANTAR/GAF domain-containing protein  28.76 
 
 		 233 aa  48.9  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.430765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  31.18 
 
 		 1171 aa  49.3  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5241  ANTAR  25.13 
 
 		 207 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>