More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_4294 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_4294  outer membrane efflux protein  100 
 
 
448 aa  853    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0190007  normal  0.396606 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4284  outer membrane efflux protein  64.25 
 
 
447 aa  477  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4306  outer membrane efflux protein  64.02 
 
 
447 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4153  outer membrane efflux protein  64.25 
 
 
447 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3124  outer membrane efflux protein  44.72 
 
 
448 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  25.65 
 
 
427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  26.45 
 
 
470 aa  102  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0903  outer membrane efflux protein  27.58 
 
 
436 aa  97.1  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.331424  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  28.05 
 
 
1470 aa  93.6  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  25.57 
 
 
467 aa  92.8  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 
463 aa  90.5  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  25 
 
 
471 aa  89.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  27.97 
 
 
419 aa  88.2  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  27.51 
 
 
455 aa  86.7  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  25.51 
 
 
460 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  28.57 
 
 
1496 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  25.38 
 
 
496 aa  85.5  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  25.4 
 
 
433 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  24.89 
 
 
483 aa  84.7  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  27 
 
 
491 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  28.01 
 
 
426 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  27.25 
 
 
419 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  26.15 
 
 
439 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2899  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.41 
 
 
504 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  22.57 
 
 
471 aa  78.2  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5938  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.35 
 
 
507 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0183223  normal  0.547092 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1638  30S ribosomal protein S12  25.34 
 
 
460 aa  77.8  0.0000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.240044  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1634  outer membrane efflux protein  24.55 
 
 
431 aa  76.6  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.194063  normal  0.997182 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0706  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.84 
 
 
636 aa  75.9  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0676668 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2527  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.47 
 
 
507 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  26.14 
 
 
436 aa  75.1  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  25.76 
 
 
445 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  24.83 
 
 
435 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2654  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.47 
 
 
507 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0354944  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0567  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.61 
 
 
483 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6609  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.62 
 
 
510 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64888  normal  0.8754 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0652  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.72 
 
 
428 aa  73.6  0.000000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000458305  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0690  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.92 
 
 
507 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  25.57 
 
 
444 aa  73.2  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2201  outer membrane efflux protein  26.77 
 
 
587 aa  72.8  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.854853  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1462  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.32 
 
 
452 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0433  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  25 
 
 
469 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462048  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  24.78 
 
 
441 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0360  RND family outer membrane efflux protein  24.68 
 
 
574 aa  72  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  24.38 
 
 
461 aa  72.4  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.38 
 
 
452 aa  71.2  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.81 
 
 
501 aa  71.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  24.08 
 
 
453 aa  71.2  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  29.14 
 
 
449 aa  70.9  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  25.05 
 
 
535 aa  70.5  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  23.7 
 
 
435 aa  70.5  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0685  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.4 
 
 
405 aa  70.5  0.00000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000118649  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1307  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.05 
 
 
484 aa  69.7  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2659  outer membrane efflux protein  22.39 
 
 
436 aa  69.7  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4358  RND efflux system outer membrane lipoprotein  27.71 
 
 
482 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4142  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.04 
 
 
472 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00647616  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02621  outer membrane protein required for AvrXa21 activity C (raxC)  24.28 
 
 
443 aa  69.3  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  24.67 
 
 
469 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1703  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  29.2 
 
 
486 aa  69.3  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416377  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0506  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.73 
 
 
492 aa  68.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01590  putative outer membrane protein TolC  21.72 
 
 
451 aa  68.6  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29548  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  28 
 
 
446 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.17 
 
 
500 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3841  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.91 
 
 
490 aa  68.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626052  normal  0.467321 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.94 
 
 
470 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0480  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.6 
 
 
505 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0104002 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1845  TolC family type I secretion outer membrane protein  24 
 
 
471 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000390204  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0117  RND efflux system, outer membrane lipoprotein CmeC  22.65 
 
 
482 aa  67.4  0.0000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  24.15 
 
 
462 aa  67.4  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0784  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.9 
 
 
491 aa  67.4  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.649029  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  24.67 
 
 
445 aa  67  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1494  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.52 
 
 
450 aa  66.6  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0009  drug efflux lipoprotein  24.54 
 
 
514 aa  66.6  0.0000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347699  normal  0.0645676 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0366  outer membrane efflux protein  22.32 
 
 
437 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  22.42 
 
 
442 aa  66.2  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4007  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.29 
 
 
472 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2636  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.69 
 
 
507 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2941  outer membrane efflux protein  20.59 
 
 
436 aa  65.5  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0140963  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4027  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.42 
 
 
467 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.296212  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2330  RND family outer membrane efflux protein  23.31 
 
 
594 aa  65.9  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3256  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  22.82 
 
 
525 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.865648 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1220  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.06 
 
 
467 aa  65.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.373524  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.39 
 
 
609 aa  65.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.11 
 
 
471 aa  65.9  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  23.4 
 
 
443 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4320  agglutination protein  25.79 
 
 
471 aa  65.1  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6206  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.93 
 
 
508 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00238233 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2367  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.68 
 
 
474 aa  64.7  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.97 
 
 
497 aa  64.7  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4101  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.29 
 
 
472 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0583  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.71 
 
 
477 aa  64.7  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.196176  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0811  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.68 
 
 
517 aa  64.7  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173561 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2544  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  28.69 
 
 
467 aa  65.1  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.109213  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1880  outer membrane protein  28.47 
 
 
492 aa  65.1  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0375089 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5839  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.93 
 
 
508 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0530876  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2885  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.93 
 
 
495 aa  64.3  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183945  normal  0.24109 
 
 
-
 
NC_003296  RS03144  putative outer membrane CHANEL lipoprotein transmembrane  27.42 
 
 
508 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.330645 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6682  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.05 
 
 
508 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0229467  normal  0.0582449 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  27.25 
 
 
500 aa  64.3  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1435  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.74 
 
 
469 aa  64.3  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>