67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1283 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1283  outer membrane autotransporter barrel domain protein  100 
 
 
3015 aa  5865    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1722  outer membrane autotransporter barrel domain protein  57.7 
 
 
1842 aa  960    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0890877 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1039  outer membrane autotransporter barrel domain protein  57.7 
 
 
1865 aa  965    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.429609  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0584  outer membrane autotransporter barrel domain protein  41.18 
 
 
2302 aa  911    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.212067  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1723  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.79 
 
 
1953 aa  913    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0576481  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1721  hypothetical protein  96.47 
 
 
86 aa  165  1e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.508273  hitchhiker  0.00134351 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0264  beta strand repeat-containing protein  39.63 
 
 
860 aa  74.3  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5845  esterase EstA  33.5 
 
 
646 aa  68.6  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67510  esterase EstA  33.5 
 
 
646 aa  68.6  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00791226  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0620  Outer membrane autotransporter barrel  26.52 
 
 
759 aa  67.4  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.553237 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  36.98 
 
 
1971 aa  67  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0428  hypothetical protein  34.78 
 
 
275 aa  67  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  32.08 
 
 
2396 aa  65.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  25.96 
 
 
763 aa  63.2  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  36.21 
 
 
994 aa  60.5  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2208  beta strand repeat-containing protein  46.48 
 
 
1869 aa  60.1  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.848116  normal  0.0253068 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.6 
 
 
1227 aa  59.7  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.17 
 
 
3629 aa  59.7  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1981  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.41 
 
 
1242 aa  58.9  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  48.19 
 
 
3506 aa  58.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0452  outer membrane autotransporter  32.73 
 
 
629 aa  58.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  30.3 
 
 
1672 aa  57.8  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0418  GDSL family lipase  32.12 
 
 
629 aa  57.4  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0624363  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  32.45 
 
 
3322 aa  57  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4784  outer membrane autotransporter  29.9 
 
 
629 aa  56.6  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.336852 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  25.32 
 
 
1056 aa  56.2  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  44.32 
 
 
2346 aa  55.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  43.59 
 
 
1882 aa  55.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  44.32 
 
 
2365 aa  56.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  45.45 
 
 
2366 aa  55.5  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0449  outer membrane autotransporter  32.12 
 
 
626 aa  55.1  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.616315  normal  0.432339 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  28.03 
 
 
2578 aa  55.5  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5117  Outer membrane autotransporter barrel  28.86 
 
 
636 aa  54.3  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  47.3 
 
 
2371 aa  54.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  29.02 
 
 
1530 aa  53.9  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  28.71 
 
 
1115 aa  53.9  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  38.99 
 
 
2407 aa  54.3  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.26 
 
 
1489 aa  53.9  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  52.38 
 
 
2906 aa  53.5  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.33 
 
 
1055 aa  53.5  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  41.94 
 
 
1508 aa  53.1  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  22.61 
 
 
1769 aa  52.8  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  29.49 
 
 
2642 aa  52.8  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  44.29 
 
 
3391 aa  52.4  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  21.72 
 
 
1001 aa  52  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  23.21 
 
 
1001 aa  51.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.51 
 
 
1357 aa  50.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  24.7 
 
 
1179 aa  51.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  37.58 
 
 
1741 aa  50.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  26.61 
 
 
2057 aa  50.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  42.03 
 
 
2711 aa  50.4  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  50 
 
 
950 aa  49.7  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  28.96 
 
 
2926 aa  49.7  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4997  Outer membrane autotransporter barrel  25 
 
 
998 aa  49.7  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1258  beta strand repeat-containing protein  34.29 
 
 
550 aa  49.3  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.305666  normal  0.49742 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  37.8 
 
 
1782 aa  49.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  22.77 
 
 
983 aa  49.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  69.23 
 
 
1113 aa  48.9  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.86 
 
 
1673 aa  48.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  25.37 
 
 
1154 aa  48.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.75 
 
 
1029 aa  48.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  42.55 
 
 
861 aa  48.1  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  32.88 
 
 
816 aa  48.1  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1114  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.61 
 
 
1358 aa  47.4  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  25.93 
 
 
1156 aa  46.6  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6344  beta strand repeat-containing protein  43.21 
 
 
652 aa  46.2  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169872  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  60 
 
 
1806 aa  46.2  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>