236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6855 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6855  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  100 
 
 
137 aa  272  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000218203  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_0598  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  61.36 
 
 
147 aa  144  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104756  normal  0.0423062 
 
 
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NC_009921  Franean1_0828  class I peptide chain release factor  57.14 
 
 
143 aa  132  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.084227  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6400  Class I peptide chain release factor  57.36 
 
 
140 aa  129  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2426  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  62.69 
 
 
138 aa  127  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2471  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  62.69 
 
 
138 aa  127  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.496568  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37860  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  66.96 
 
 
141 aa  126  9.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.259651 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1139  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  64.35 
 
 
135 aa  124  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.668699  hitchhiker  0.0000255513 
 
 
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NC_008541  Arth_1977  hypothetical protein  55.47 
 
 
147 aa  125  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_1249  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  67.78 
 
 
129 aa  123  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3224  hypothetical protein  54.69 
 
 
139 aa  123  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0672  Class I peptide chain release factor  53.97 
 
 
164 aa  117  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22660  protein chain release factor B  56.88 
 
 
146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28300  protein chain release factor B  55 
 
 
146 aa  110  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2137  Class I peptide chain release factor  58.78 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157094  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3059  Class I peptide chain release factor  56.72 
 
 
146 aa  108  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0504323  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3102  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.51 
 
 
144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614248  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1190  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  52.85 
 
 
142 aa  107  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0102787  n/a   
 
 
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NC_012803  Mlut_15800  hypothetical protein  54.2 
 
 
151 aa  107  7.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.25035  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14580  protein chain release factor B  55.2 
 
 
149 aa  106  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.024949  normal  0.100234 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0357  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40 
 
 
142 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.197907  n/a   
 
 
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NC_008820  P9303_29401  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.86 
 
 
143 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02765  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.03 
 
 
143 aa  102  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.489905  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_0179  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  46.77 
 
 
143 aa  101  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013510  Tcur_0582  Class I peptide chain release factor  50 
 
 
143 aa  98.6  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03841  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.48 
 
 
142 aa  98.6  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.300299  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0960  Class I peptide chain release factor  46.83 
 
 
145 aa  97.4  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2589  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.88 
 
 
143 aa  97.1  7e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.139809 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1368  Class I peptide chain release factor  41.98 
 
 
151 aa  96.3  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.422423  n/a   
 
 
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NC_007404  Tbd_1523  hypothetical protein  45 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.331021  normal  0.193244 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2737  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.44 
 
 
169 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3695  class I peptide chain release factor  45.67 
 
 
143 aa  94  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.681232 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  34.56 
 
 
145 aa  93.6  8e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.472509  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0332  class I peptide chain release factor  42.11 
 
 
140 aa  93.6  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.451275  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0556  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.52 
 
 
140 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.908284  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1373  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.15 
 
 
140 aa  91.3  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1494  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.94 
 
 
137 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.129787  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1970  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.15 
 
 
137 aa  90.9  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0828493  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0097  class I peptide chain release factor  41.04 
 
 
140 aa  90.9  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14431  aminoacyl-tRNA hydrolase  41.73 
 
 
142 aa  90.5  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134449 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1387  class I peptide chain release factor  52.85 
 
 
150 aa  90.1  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443355  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0430  class I peptide chain release factor  42.28 
 
 
141 aa  89.4  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2228  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.98 
 
 
146 aa  89.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0979  Class I peptide chain release factor  55.47 
 
 
149 aa  89.4  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000812989 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2164  Class I peptide chain release factor  41.41 
 
 
137 aa  89.4  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4041  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.13 
 
 
137 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.733627 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03851  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  35.43 
 
 
138 aa  88.6  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.78098  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1495  class I peptide chain release factor  39.55 
 
 
137 aa  87  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000011773 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13231  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.16 
 
 
140 aa  87  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.107731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2946  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.13 
 
 
137 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.661173  normal  0.230853 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0024  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  45.97 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0149  Class I peptide chain release factor  42.75 
 
 
146 aa  85.9  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2311  class I peptide chain release factor  40.31 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53030  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.13 
 
 
137 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4649  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.13 
 
 
137 aa  84  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0636  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  42.31 
 
 
143 aa  84  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00765778  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1366  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.35 
 
 
141 aa  84  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_3229  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.32 
 
 
137 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.168853  normal  0.123551 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0034  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44.35 
 
 
141 aa  83.6  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3342  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  43.59 
 
 
140 aa  83.2  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1725  class I peptide chain release factor  39.23 
 
 
140 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208717  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3760  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.48 
 
 
137 aa  82.4  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000181211  normal  0.0838449 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3071  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.31 
 
 
140 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2666  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  44 
 
 
139 aa  81.3  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2442  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.5 
 
 
137 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0547672  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2849  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.93 
 
 
134 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.10078  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1767  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.93 
 
 
134 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1191  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.93 
 
 
134 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273593  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0678  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.93 
 
 
134 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.283064  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1388  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.93 
 
 
134 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1392  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.93 
 
 
134 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.367103  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0474  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.93 
 
 
134 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.578239  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34690  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.52 
 
 
137 aa  80.5  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.370131  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3592  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  34.35 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1147  Class I peptide chain release factor  40.16 
 
 
142 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3579  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.71 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.440076  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1522  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.17 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.876893  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0535  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.1 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000252738  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2835  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.09 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3167  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.13 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.519033  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0202  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.57 
 
 
136 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.869706  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1309  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  40.32 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.892435  normal  0.470671 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3193  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.17 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1617  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  41.09 
 
 
134 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.599417 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1818  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.9 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3428  Class I peptide chain release factor  41.18 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3557  Class I peptide chain release factor  42.19 
 
 
140 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.450326  normal  0.411853 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0012  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  39.47 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1242  class I peptide chain release factor  33.33 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00357715 
 
 
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NC_011060  Ppha_1045  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.15 
 
 
137 aa  78.2  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
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NC_011365  Gdia_2541  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.09 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2547  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.69 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.256849  normal 
 
 
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NC_013061  Phep_1191  Class I peptide chain release factor  38.17 
 
 
136 aa  77.4  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011004  Rpal_4856  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.5 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_1709  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  38.46 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.44949 
 
 
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NC_009436  Ent638_0730  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  37.5 
 
 
140 aa  77.4  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal 
 
 
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NC_010172  Mext_3233  class I peptide chain release factor  42.19 
 
 
140 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.521154 
 
 
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CP001637  EcDH1_3411  Class I peptide chain release factor  36.36 
 
 
140 aa  77.4  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_0140  Class I peptide chain release factor  40 
 
 
133 aa  77  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010468  EcolC_3468  peptidyl-tRNA hydrolase domain protein  36.36 
 
 
140 aa  76.6  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.437856 
 
 
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