128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3849 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2650  alpha-1,2-mannosidase family protein  46.75 
 
 		 846 aa  747    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0929725  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3385  putative alpha-1,2-mannosidase  46.61 
 
 		 839 aa  710    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0819897 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0563  alpha-1,2-mannosidase family protein  46.86 
 
 		 849 aa  707    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.372368  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3849  alpha-1,2-mannosidase  100 
 
 		 1084 aa  2173    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3507  alpha-1,2-mannosidase  52.08 
 
 		 811 aa  745    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.333172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3322  alpha-1,2-mannosidase  34.75 
 
 		 1089 aa  525  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532336  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10595  hypothetical protein  40.38 
 
 		 877 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1873  alpha-1,2-mannosidase  36.01 
 
 		 1075 aa  517  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  41.42 
 
 		 1189 aa  516  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1991  Alpha-1,2-mannosidase, putative  38.68 
 
 		 961 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0315  putative alpha-1,2-mannosidase  39.41 
 
 		 986 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4569  alpha-1,2-mannosidase  38.24 
 
 		 1465 aa  505  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1926  alpha-1,2-mannosidase family protein  39.41 
 
 		 955 aa  502  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1678  alpha-1,2-mannosidase family protein  39.41 
 
 		 955 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0941  alpha-1,2-mannosidase family protein  39.41 
 
 		 986 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1228  alpha-1,2-mannosidase family protein  39.41 
 
 		 986 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0226  putative alpha-1,2-mannosidase  39.53 
 
 		 986 aa  503  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2204  alpha-1,2-mannosidase family protein  39.41 
 
 		 986 aa  501  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0228  alpha-1,2-mannosidase family protein  38.5 
 
 		 964 aa  490  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2596  alpha-1,2-mannosidase, putative  38.75 
 
 		 827 aa  484  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146801  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  39.12 
 
 		 890 aa  474  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  37.4 
 
 		 899 aa  458  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2907  Alpha-1,2-mannosidase, putative  36.69 
 
 		 823 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4818  alpha-1,2-mannosidase, putative  36.39 
 
 		 819 aa  399  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3349  putative alpha-1,2-mannosidase  36.39 
 
 		 819 aa  399  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4167  alpha-1,2-mannosidase  36.39 
 
 		 819 aa  399  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1774  alpha-1,2-mannosidase  35.05 
 
 		 821 aa  399  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.437788 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2651  alpha-1,2-mannosidase family protein  30.53 
 
 		 807 aa  384  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0899851  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0564  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.42 
 
 		 784 aa  355  2e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.288531  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4715  alpha-1,2-mannosidase  34.88 
 
 		 777 aa  355  2.9999999999999997e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.288424 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3384  putative alpha-1,2-mannosidase  32.33 
 
 		 785 aa  354  4e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.570522  normal  0.0294946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2353  alpha-1,2-mannosidase  30.91 
 
 		 762 aa  339  1.9999999999999998e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00545904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2182  alpha-1,2-mannosidase  31.47 
 
 		 775 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08711  putative alpha-1,2-mannosidase precursor  27.87 
 
 		 976 aa  337  1e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2358  putative alpha-1,2-mannosidase  29.29 
 
 		 778 aa  335  3e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170522  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2174  alpha-1,2-mannosidase  32.52 
 
 		 784 aa  335  4e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2041  putative alpha-1,2-mannosidase  31.05 
 
 		 749 aa  334  7.000000000000001e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0394657  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1114  alpha-1,2-mannosidase  28.99 
 
 		 745 aa  332  2e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6816  alpha-1,2-mannosidase  29.27 
 
 		 769 aa  327  6e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0255235 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3892  alpha-1,2-mannosidase  30.35 
 
 		 759 aa  326  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0288  putative alpha-1,2-mannosidase  31.59 
 
 		 740 aa  326  2e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2421  alpha-1,2-mannosidase, putative  35.03 
 
 		 769 aa  321  3.9999999999999996e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262466  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0304  putative alpha-1,2-mannosidase  30.8 
 
 		 773 aa  321  5e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0116  putative alpha-1,2-mannosidase  30.85 
 
 		 760 aa  321  6e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0692372  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2032  putative alpha-1,2-mannosidase  29.11 
 
 		 747 aa  321  6e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0902  alpha-1,2-mannosidase family protein  32.17 
 
 		 741 aa  320  7e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1932  alpha-1,2-mannosidase  32.76 
 
 		 790 aa  320  1e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4742  alpha-1,2-mannosidase  31.59 
 
 		 771 aa  319  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.155391 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2008  antigen  32.81 
 
 		 790 aa  318  3e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.154316  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0130  putative alpha-1,2-mannosidase  30.98 
 
 		 747 aa  317  7e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3976  alpha-1,2-mannosidase  29.74 
 
 		 761 aa  316  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00516105  normal  0.689396 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5524  alpha-1,2-mannosidase  30.24 
 
 		 774 aa  315  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0588819  normal  0.180784 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0217  alpha-1,2-mannosidase  28.73 
 
 		 754 aa  314  4.999999999999999e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0490349  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0117  putative alpha-1,2-mannosidase  30.44 
 
 		 742 aa  312  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.973431  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4820  alpha-1,2-mannosidase  29.16 
 
 		 757 aa  309  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000525675  unclonable  0.0000000000000774884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4827  alpha-1,2-mannosidase  29.58 
 
 		 755 aa  308  4.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000010701 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1457  alpha-1,2-mannosidase  28.85 
 
 		 780 aa  308  5.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0846  alpha-1,2-mannosidase  29.53 
 
 		 706 aa  303  9e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2714  putative alpha-1,2-mannosidase  27.02 
 
 		 753 aa  303  1e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0120  putative alpha-1,2-mannosidase  29.01 
 
 		 772 aa  300  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147573  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0514  alpha-1,2-mannosidase, putative  29.81 
 
 		 771 aa  299  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0135562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0293  putative alpha-1,2-mannosidase  28.95 
 
 		 782 aa  296  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.262519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7335  putative alpha-1,2-mannosidase  33.29 
 
 		 754 aa  293  8e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_002950  PG0973  alpha-1,2-mannosidase family protein  30.37 
 
 		 771 aa  293  9e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.303191 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5720  alpha-1,2-mannosidase, putative  29.69 
 
 		 900 aa  292  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0689456  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6084  putative alpha-1,2-mannosidase  29.69 
 
 		 900 aa  292  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4808  alpha-1,2-mannosidase  28.33 
 
 		 758 aa  290  9e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0289  putative alpha-1,2-mannosidase  30.28 
 
 		 751 aa  289  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0298  alpha-1,2-mannosidase  27.53 
 
 		 760 aa  287  8e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000977732  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000706  alpha-1,2-mannosidase  29.05 
 
 		 943 aa  285  4.0000000000000003e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2715  putative alpha-1,2-mannosidase  27.49 
 
 		 759 aa  284  5.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0373622  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000710  alpha-1,2-mannosidase  27.9 
 
 		 826 aa  278  5e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878479  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2906  Alpha-1,2-mannosidase, putative  29.41 
 
 		 888 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.51268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4817  alpha-1,2-mannosidase, putative  29.09 
 
 		 886 aa  275  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.967462  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3350  putative alpha-1,2-mannosidase  29.09 
 
 		 886 aa  275  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4166  alpha-1,2-mannosidase  29.09 
 
 		 886 aa  275  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0800126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06602  alpha-1,2-mannosidase  27.54 
 
 		 826 aa  273  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06598  alpha-1,2-mannosidase  28.69 
 
 		 808 aa  271  5e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7541  Alpha-1,2-mannosidase, putative  29.38 
 
 		 900 aa  271  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.439325 
 
 
-
 
NC_002950  PG1712  alpha-1,2-mannosidase family protein  28.21 
 
 		 781 aa  270  1e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000707  putative alpha-1,2-mannosidase  28.45 
 
 		 806 aa  266  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340375  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5005  alpha-1,2-mannosidase  27.96 
 
 		 797 aa  256  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06599  hypothetical protein  27.33 
 
 		 917 aa  256  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0134  alpha-1,2-mannosidase  31.17 
 
 		 771 aa  254  7e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2891  alpha-1,2-mannosidase  28.48 
 
 		 795 aa  253  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06601  alpha-1,2-mannosidase  26.43 
 
 		 818 aa  253  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3124  putative alpha-1,2-mannosidase  25.73 
 
 		 757 aa  251  4e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000709  alpha-1,2-mannosidase  26.13 
 
 		 818 aa  249  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5632  alpha-1,2-mannosidase  26.26 
 
 		 716 aa  246  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427335  normal  0.872558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2956  alpha-1,2-mannosidase  28.59 
 
 		 764 aa  242  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.756886  hitchhiker  0.00000545459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  29.38 
 
 		 1426 aa  238  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  28.5 
 
 		 1322 aa  238  6e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  27.51 
 
 		 1427 aa  238  6e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.454408 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01197  alpha-1,2-mannosidase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10790)  26.7 
 
 		 802 aa  237  1.0000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2076  alpha-1,2-mannosidase  27.83 
 
 		 1124 aa  235  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10672  alpha-1,2-mannosidase, putative subfamily (AFU_orthologue; AFUA_6G13760)  26.66 
 
 		 798 aa  234  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3350  alpha-1,2-mannosidase  27.19 
 
 		 1114 aa  229  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.357812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1744  alpha-1,2-mannosidase  30.18 
 
 		 751 aa  225  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0722738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  27.53 
 
 		 1422 aa  223  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0761  alpha-1,2-mannosidase  25.32 
 
 		 901 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>