93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2274 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2274  protein of unknown function DUF58  100 
 
 		 374 aa  686    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1150  protein of unknown function DUF58  39.49 
 
 		 395 aa  152  8e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00641052  hitchhiker  0.0000843789 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  40.32 
 
 		 387 aa  116  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  32.22 
 
 		 380 aa  115  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  38.33 
 
 		 391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8516  protein of unknown function DUF58  35.66 
 
 		 497 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.216468  normal  0.0382581 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0486  protein of unknown function DUF58  34.98 
 
 		 421 aa  89.7  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.285112  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1332  protein of unknown function DUF58  36.47 
 
 		 394 aa  85.9  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0542564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0461  protein of unknown function DUF58  32.86 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  32.51 
 
 		 463 aa  80.1  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1279  protein of unknown function DUF58  32.29 
 
 		 491 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  31.28 
 
 		 407 aa  78.2  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  33.85 
 
 		 479 aa  77  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2196  protein of unknown function DUF58  33.52 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.309415  decreased coverage  0.00320399 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  34.31 
 
 		 431 aa  76.3  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  41.25 
 
 		 422 aa  75.1  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  36.26 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25040  hypothetical protein  35.5 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  35.71 
 
 		 564 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1333  protein of unknown function DUF58  29.78 
 
 		 443 aa  73.6  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000419931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4916  hypothetical protein  38.96 
 
 		 432 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.193256  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0635  hypothetical protein  34.76 
 
 		 561 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000516706  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1289  hypothetical protein  29.21 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.713583  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  33.11 
 
 		 552 aa  71.2  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3834  protein of unknown function DUF58  38.12 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00386989  normal  0.0608669 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  32.88 
 
 		 453 aa  68.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1761  protein of unknown function DUF58  32.53 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0774161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  32.41 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  33.6 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  34.5 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  38.67 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1569  hypothetical protein  32.35 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  30.87 
 
 		 463 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3210  protein of unknown function DUF58  33.16 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126995  normal  0.0203801 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16670  hypothetical protein  33.33 
 
 		 452 aa  64.3  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.556448  normal  0.0135489 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  33.53 
 
 		 422 aa  63.2  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2130  protein of unknown function DUF58  31.16 
 
 		 384 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2086  protein of unknown function DUF58  31.16 
 
 		 384 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5533  protein of unknown function DUF58  33.73 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0610248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4248  hypothetical protein  34.44 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1273  protein of unknown function DUF58  39.76 
 
 		 432 aa  60.8  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0512421  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3417  protein of unknown function DUF58  34.16 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21590  hypothetical protein  32.06 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.312614  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0801  hypothetical protein  34.58 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  33.09 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1396  hypothetical protein  33.81 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.60461  hitchhiker  0.00977716 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  29.94 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2421  protein of unknown function DUF58  40 
 
 		 393 aa  57  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0299727 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  37.11 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  35.45 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27450  hypothetical protein  29.17 
 
 		 453 aa  56.2  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  24.55 
 
 		 384 aa  55.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05640  hypothetical protein  31.06 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5777  protein of unknown function DUF58  39.13 
 
 		 429 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  27.22 
 
 		 412 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1967  hypothetical protein  22.16 
 
 		 405 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.986855  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  31.32 
 
 		 432 aa  54.3  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  26.44 
 
 		 391 aa  53.1  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  30.41 
 
 		 385 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2204  hypothetical protein  23.24 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.313658  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3273  protein of unknown function DUF58  34.53 
 
 		 453 aa  50.8  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0765487  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1642  hypothetical protein  30.59 
 
 		 386 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0493  protein of unknown function DUF58  26.17 
 
 		 398 aa  50.1  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2536  protein of unknown function DUF58  33.03 
 
 		 333 aa  49.7  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  21.97 
 
 		 404 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  27.76 
 
 		 442 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2612  protein of unknown function DUF58  34.33 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0390859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4604  hypothetical protein  30.67 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1587  protein of unknown function DUF58  31.25 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.65866  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0238  protein of unknown function DUF58  26.97 
 
 		 448 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  22.7 
 
 		 404 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  22.7 
 
 		 404 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1118  protein of unknown function DUF58  40 
 
 		 391 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  23.7 
 
 		 405 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  31.08 
 
 		 315 aa  47.4  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  25.67 
 
 		 436 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  37.14 
 
 		 317 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  33.64 
 
 		 380 aa  47  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1973  hypothetical protein  22.16 
 
 		 404 aa  46.6  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2121  hypothetical protein  22.16 
 
 		 362 aa  46.2  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  33.65 
 
 		 349 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  25.51 
 
 		 458 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  26.6 
 
 		 444 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3578  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 		 370 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2156  hypothetical protein  21.62 
 
 		 404 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1928  hypothetical protein  22.16 
 
 		 404 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.50924  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 		 314 aa  44.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  32.67 
 
 		 426 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  34.48 
 
 		 318 aa  43.9  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0048  protein of unknown function DUF58  23.13 
 
 		 363 aa  43.5  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0614  protein of unknown function DUF58  25.89 
 
 		 436 aa  43.1  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3286  hypothetical protein  27.46 
 
 		 451 aa  43.1  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.91428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  24.73 
 
 		 444 aa  42.7  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>