127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1873 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2596  alpha-1,2-mannosidase, putative  53.28 
 
 		 827 aa  809    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0146801  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3322  alpha-1,2-mannosidase  69.48 
 
 		 1089 aa  1493    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0532336  normal  0.277705 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1873  alpha-1,2-mannosidase  100 
 
 		 1075 aa  2173    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1774  alpha-1,2-mannosidase  45.58 
 
 		 821 aa  626  1e-178  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.437788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3849  alpha-1,2-mannosidase  36.01 
 
 		 1084 aa  530  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157867  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5454  alpha-1,2-mannosidase  38.1 
 
 		 1189 aa  447  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8868  normal  0.279794 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3507  alpha-1,2-mannosidase  39.75 
 
 		 811 aa  439  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.333172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  38.19 
 
 		 899 aa  433  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3384  putative alpha-1,2-mannosidase  36.81 
 
 		 785 aa  426  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.570522  normal  0.0294946 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2651  alpha-1,2-mannosidase family protein  33.82 
 
 		 807 aa  422  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0899851  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08711  putative alpha-1,2-mannosidase precursor  32.18 
 
 		 976 aa  422  1e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0564  alpha-1,2-mannosidase family protein  36.56 
 
 		 784 aa  421  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.288531  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0130  putative alpha-1,2-mannosidase  35.68 
 
 		 747 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0116  putative alpha-1,2-mannosidase  34.42 
 
 		 760 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0692372  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0117  putative alpha-1,2-mannosidase  33.46 
 
 		 742 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.973431  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2041  putative alpha-1,2-mannosidase  32.72 
 
 		 749 aa  405  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0394657  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2714  putative alpha-1,2-mannosidase  31.89 
 
 		 753 aa  401  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0280762  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10595  hypothetical protein  34.14 
 
 		 877 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0288  putative alpha-1,2-mannosidase  34.38 
 
 		 740 aa  399  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2032  putative alpha-1,2-mannosidase  32.76 
 
 		 747 aa  394  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3976  alpha-1,2-mannosidase  32.67 
 
 		 761 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00516105  normal  0.689396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4820  alpha-1,2-mannosidase  33.13 
 
 		 757 aa  396  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000525675  unclonable  0.0000000000000774884 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0846  alpha-1,2-mannosidase  34.47 
 
 		 706 aa  392  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2174  alpha-1,2-mannosidase  36.21 
 
 		 784 aa  388  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1114  alpha-1,2-mannosidase  33.8 
 
 		 745 aa  383  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2353  alpha-1,2-mannosidase  32.73 
 
 		 762 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00545904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4715  alpha-1,2-mannosidase  35.36 
 
 		 777 aa  382  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.288424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2182  alpha-1,2-mannosidase  32.73 
 
 		 775 aa  382  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3892  alpha-1,2-mannosidase  32.41 
 
 		 759 aa  379  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.645173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2358  putative alpha-1,2-mannosidase  31.19 
 
 		 778 aa  377  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.170522  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6816  alpha-1,2-mannosidase  32.67 
 
 		 769 aa  378  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0255235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4569  alpha-1,2-mannosidase  33.68 
 
 		 1465 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  33.29 
 
 		 890 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0902  alpha-1,2-mannosidase family protein  34.81 
 
 		 741 aa  375  1e-102  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3385  putative alpha-1,2-mannosidase  32.65 
 
 		 839 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0819897 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0563  alpha-1,2-mannosidase family protein  32.64 
 
 		 849 aa  374  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.372368  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0228  alpha-1,2-mannosidase family protein  33.03 
 
 		 964 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5005  alpha-1,2-mannosidase  32.63 
 
 		 797 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0514  alpha-1,2-mannosidase, putative  33.12 
 
 		 771 aa  364  4e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0135562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0217  alpha-1,2-mannosidase  32.11 
 
 		 754 aa  363  8e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0490349  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0315  putative alpha-1,2-mannosidase  33.08 
 
 		 986 aa  363  9e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1678  alpha-1,2-mannosidase family protein  33.08 
 
 		 955 aa  361  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0941  alpha-1,2-mannosidase family protein  33.08 
 
 		 986 aa  361  4e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1228  alpha-1,2-mannosidase family protein  33.08 
 
 		 986 aa  361  4e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2204  alpha-1,2-mannosidase family protein  33.08 
 
 		 986 aa  361  4e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1926  alpha-1,2-mannosidase family protein  33.08 
 
 		 955 aa  361  5e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0226  putative alpha-1,2-mannosidase  33.08 
 
 		 986 aa  361  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0289  putative alpha-1,2-mannosidase  33.51 
 
 		 751 aa  357  7.999999999999999e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1991  Alpha-1,2-mannosidase, putative  33.03 
 
 		 961 aa  356  1e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4742  alpha-1,2-mannosidase  32.76 
 
 		 771 aa  354  4e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.155391 
 
 
-
 
NC_002950  PG0973  alpha-1,2-mannosidase family protein  32.31 
 
 		 771 aa  353  8e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.303191 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0304  putative alpha-1,2-mannosidase  32.51 
 
 		 773 aa  353  8e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2650  alpha-1,2-mannosidase family protein  31.24 
 
 		 846 aa  353  1e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0929725  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000706  alpha-1,2-mannosidase  31.62 
 
 		 943 aa  351  5e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1932  alpha-1,2-mannosidase  33.63 
 
 		 790 aa  349  2e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4808  alpha-1,2-mannosidase  31.45 
 
 		 758 aa  346  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1457  alpha-1,2-mannosidase  30.58 
 
 		 780 aa  343  7e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2008  antigen  33.5 
 
 		 790 aa  343  1e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.154316  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2891  alpha-1,2-mannosidase  30.41 
 
 		 795 aa  339  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2907  Alpha-1,2-mannosidase, putative  33.75 
 
 		 823 aa  334  5e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0293  putative alpha-1,2-mannosidase  31.11 
 
 		 782 aa  333  9e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.262519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4818  alpha-1,2-mannosidase, putative  32.96 
 
 		 819 aa  332  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3349  putative alpha-1,2-mannosidase  32.96 
 
 		 819 aa  332  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4167  alpha-1,2-mannosidase  32.96 
 
 		 819 aa  332  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5524  alpha-1,2-mannosidase  30.81 
 
 		 774 aa  325  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0588819  normal  0.180784 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0120  putative alpha-1,2-mannosidase  30.83 
 
 		 772 aa  325  3e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.147573  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2421  alpha-1,2-mannosidase, putative  33.86 
 
 		 769 aa  322  3e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.262466  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7335  putative alpha-1,2-mannosidase  34.84 
 
 		 754 aa  320  7.999999999999999e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0298  alpha-1,2-mannosidase  30.03 
 
 		 760 aa  318  4e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000977732  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2906  Alpha-1,2-mannosidase, putative  30.22 
 
 		 888 aa  312  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.51268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2715  putative alpha-1,2-mannosidase  29.04 
 
 		 759 aa  311  2.9999999999999997e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0373622  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4817  alpha-1,2-mannosidase, putative  30.75 
 
 		 886 aa  311  5e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.967462  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3350  putative alpha-1,2-mannosidase  30.75 
 
 		 886 aa  311  5e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4166  alpha-1,2-mannosidase  30.75 
 
 		 886 aa  311  5e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0800126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3124  putative alpha-1,2-mannosidase  27.69 
 
 		 757 aa  308  5.0000000000000004e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06601  alpha-1,2-mannosidase  29.52 
 
 		 818 aa  307  7e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000709  alpha-1,2-mannosidase  29.29 
 
 		 818 aa  301  4e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4827  alpha-1,2-mannosidase  30.96 
 
 		 755 aa  301  5e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000010701 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5632  alpha-1,2-mannosidase  30.75 
 
 		 716 aa  300  8e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427335  normal  0.872558 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06602  alpha-1,2-mannosidase  29.75 
 
 		 826 aa  299  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3125  putative alpha-1,2-mannosidase  29.5 
 
 		 768 aa  297  8e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0733524  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000710  alpha-1,2-mannosidase  29.63 
 
 		 826 aa  296  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878479  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2956  alpha-1,2-mannosidase  29.84 
 
 		 764 aa  294  7e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.756886  hitchhiker  0.00000545459 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06598  alpha-1,2-mannosidase  30.73 
 
 		 808 aa  293  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000707  putative alpha-1,2-mannosidase  30.51 
 
 		 806 aa  290  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340375  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5720  alpha-1,2-mannosidase, putative  28.75 
 
 		 900 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0689456  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6084  putative alpha-1,2-mannosidase  28.75 
 
 		 900 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3359  alpha-1,2-mannosidase  28.51 
 
 		 728 aa  274  5.000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.822505  normal  0.0441552 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1744  alpha-1,2-mannosidase  29.73 
 
 		 751 aa  274  8.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0722738  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1712  alpha-1,2-mannosidase family protein  29.95 
 
 		 781 aa  271  5.9999999999999995e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0761  alpha-1,2-mannosidase  29.44 
 
 		 901 aa  270  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  30.67 
 
 		 1426 aa  270  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7541  Alpha-1,2-mannosidase, putative  28.57 
 
 		 900 aa  259  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.439325 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  28.94 
 
 		 1427 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  30.1 
 
 		 1322 aa  255  3e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  28.89 
 
 		 1422 aa  246  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2076  alpha-1,2-mannosidase  27.91 
 
 		 1124 aa  246  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01197  alpha-1,2-mannosidase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10790)  26.96 
 
 		 802 aa  245  3e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3350  alpha-1,2-mannosidase  29.02 
 
 		 1114 aa  241  4e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.357812  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10672  alpha-1,2-mannosidase, putative subfamily (AFU_orthologue; AFUA_6G13760)  26.9 
 
 		 798 aa  238  6e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>