More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0676 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0676  4-phytase  100 
 
 		 541 aa  1114    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3311  extracellular solute-binding protein family 5  50.77 
 
 		 560 aa  527  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3630  extracellular solute-binding protein family 5  49.41 
 
 		 522 aa  508  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12610  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  45.73 
 
 		 586 aa  430  1e-119  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.183632 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1079  extracellular solute-binding protein family 5  42.75 
 
 		 552 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.133059  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0952  4-phytase  39.61 
 
 		 554 aa  392  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2822  extracellular solute-binding protein  41.15 
 
 		 547 aa  385  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.630772  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4176  4-phytase  39.49 
 
 		 534 aa  372  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00061687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3150  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  38.76 
 
 		 537 aa  368  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.447408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0252  oligopeptide ABC transporter periplasmic protein  41.94 
 
 		 546 aa  365  2e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.213679  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3796  4-phytase  39.63 
 
 		 533 aa  355  8.999999999999999e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.207613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8934  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  39.73 
 
 		 543 aa  353  4e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1125  4-phytase  39.88 
 
 		 585 aa  353  5e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0565  oligopeptide ABC transporter periplasmic protein  38.1 
 
 		 546 aa  349  7e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2462  4-phytase  39.36 
 
 		 543 aa  348  1e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.36886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11050  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  41.78 
 
 		 552 aa  344  2.9999999999999997e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.273822  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3915  extracellular solute-binding protein family 5  38.59 
 
 		 543 aa  343  5e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4213  extracellular solute-binding protein  37.3 
 
 		 543 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0562482  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2461  4-phytase  38.59 
 
 		 543 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.792128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3823  4-phytase  38.06 
 
 		 541 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13696  periplasmic dipeptide-binding lipoprotein dppA  38.29 
 
 		 541 aa  333  6e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.17104 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0486  extracellular solute-binding protein  39.49 
 
 		 542 aa  332  9e-90  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.410451 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4381  extracellular solute-binding protein  36.04 
 
 		 543 aa  332  9e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000255213 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2540  4-phytase  38.87 
 
 		 561 aa  323  7e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000102543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5516  extracellular solute-binding protein family 5  34.6 
 
 		 528 aa  302  9e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4144  extracellular solute-binding protein family 5  33.68 
 
 		 527 aa  268  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.482132  hitchhiker  0.00782841 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3657  4-phytase  36.33 
 
 		 536 aa  264  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26170  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  40.41 
 
 		 537 aa  233  6e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369222  normal  0.443852 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2012  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  25.93 
 
 		 545 aa  161  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  29.9 
 
 		 544 aa  160  4e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0547  extracellular solute-binding protein  27.32 
 
 		 531 aa  159  9e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_512  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, periplasmic component  28.49 
 
 		 530 aa  159  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.135113  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  29.32 
 
 		 544 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0573  oligopeptide-binding protein, putative  28.63 
 
 		 530 aa  155  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0021  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 		 561 aa  149  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3851  extracellular solute-binding protein family 5  27.89 
 
 		 530 aa  143  9e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000180183  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  26.52 
 
 		 543 aa  139  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  26.42 
 
 		 540 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3498  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.63 
 
 		 586 aa  137  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.690705 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0418  extracellular solute-binding protein family 5  26.77 
 
 		 622 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 538 aa  136  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  26.17 
 
 		 556 aa  134  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002959  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  27.7 
 
 		 558 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0019  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 		 533 aa  134  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2285  extracellular solute-binding protein family 5  26.05 
 
 		 556 aa  133  6.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  26 
 
 		 540 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  27.61 
 
 		 558 aa  133  9e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27.41 
 
 		 558 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000900492  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  23.53 
 
 		 544 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01217  oligopeptide transporter subunit  27.41 
 
 		 543 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.584763  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1391  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  27.41 
 
 		 543 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768286  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2702  extracellular solute-binding protein  27.31 
 
 		 545 aa  131  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108728  hitchhiker  0.000845971 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2385  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 		 558 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190524  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1729  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  27.41 
 
 		 558 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.654548  normal  0.238122 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001004  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  26.97 
 
 		 541 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1352  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  27.41 
 
 		 543 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153639  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01227  hypothetical protein  27.41 
 
 		 543 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1483  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 		 542 aa  131  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  25.79 
 
 		 540 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 528 aa  130  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1946  oligopeptide transport system permease protein B  27.2 
 
 		 554 aa  130  7.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 		 501 aa  130  8.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1223  4-phytase  24.73 
 
 		 589 aa  129  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  27.04 
 
 		 520 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  26.16 
 
 		 541 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2385  extracellular solute-binding protein family 5  26.53 
 
 		 594 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_932  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  26.34 
 
 		 558 aa  127  5e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000268358  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1412  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  26.92 
 
 		 543 aa  127  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.706367  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7030  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.94 
 
 		 537 aa  126  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394274  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1798  murein tripeptide ABC transporter, periplasmic murein peptide-binding protein  26.65 
 
 		 538 aa  126  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2389  murein tripeptide ABC transporter periplasmic murein peptide-binding protein  26.65 
 
 		 538 aa  126  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.536818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1906  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 		 538 aa  126  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  25.67 
 
 		 541 aa  126  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07058  hypothetical protein  25.91 
 
 		 559 aa  125  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02949  hypothetical protein  26.06 
 
 		 555 aa  125  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1770  extracellular solute-binding protein family 5  26.5 
 
 		 560 aa  125  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  27.22 
 
 		 526 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  26.2 
 
 		 509 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0044  extracellular solute-binding protein family 5  25.05 
 
 		 538 aa  124  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0190  extracellular solute-binding protein  22.58 
 
 		 533 aa  124  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5142  4-phytase  26.45 
 
 		 531 aa  124  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.303319  normal  0.0209906 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1448  extracellular solute-binding protein family 5  24.01 
 
 		 535 aa  124  5e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  27.67 
 
 		 543 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 		 501 aa  124  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  27.98 
 
 		 526 aa  124  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2611  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 		 544 aa  123  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.502409 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2247  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 535 aa  123  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125251  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4404  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 		 536 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 532 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1926  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 		 518 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293523  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  27.15 
 
 		 519 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1658  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 516 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710594  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2497  extracellular solute-binding protein family 5  26.22 
 
 		 528 aa  121  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0778602 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  27.46 
 
 		 543 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2435  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 		 549 aa  120  4.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.882532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0960  extracellular solute-binding protein family 5  27.72 
 
 		 547 aa  120  4.9999999999999996e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  27.46 
 
 		 543 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  27.46 
 
 		 543 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  27.46 
 
 		 543 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0020  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 		 558 aa  120  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>