57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2661 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1989  hypothetical protein  83.48 
 
 		 2004 bp  1068    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.156539  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2928    85.61 
 
 		 2346 bp  1338    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.292593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2661    100 
 
 		 1656 bp  3283    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.308299 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0691  hypothetical protein  84.63 
 
 		 1989 bp  898    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3726  hypothetical protein  85.92 
 
 		 1974 bp  1378    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0453  hypothetical protein  86.9 
 
 		 2037 bp  1489    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2716  hypothetical protein  86.52 
 
 		 2382 bp  1463    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1268  hypothetical protein  80.56 
 
 		 1974 bp  696    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31070  hypothetical protein  86.45 
 
 		 2361 bp  1455    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000153528  unclonable  1.9184199999999998e-21 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2335  hypothetical protein  84.69 
 
 		 1998 bp  1209    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2625  hypothetical protein  84.42 
 
 		 1983 bp  1146    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.324937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0320  hypothetical protein  86.98 
 
 		 1986 bp  1516    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3018  hypothetical protein  86.23 
 
 		 1977 bp  1398    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0413354 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1489  hypothetical protein  86.32 
 
 		 2103 bp  1396    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685249  normal  0.0298557 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1259  hypothetical protein  85.75 
 
 		 2106 bp  1318    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1883  hypothetical protein  85.89 
 
 		 2112 bp  1384    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239499  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1293  hypothetical protein  85.55 
 
 		 1974 bp  1316    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3520  hypothetical protein  86.48 
 
 		 1968 bp  1413    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35930  hypothetical protein  84.72 
 
 		 1986 bp  1211    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2601  hypothetical protein  84.48 
 
 		 2052 bp  1181    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2075    86.96 
 
 		 627 bp  567  1.0000000000000001e-159  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3718  VirD2 components relaxase  88.96 
 
 		 213 bp  180  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4171  hypothetical protein  85.63 
 
 		 1962 bp  141  7.000000000000001e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1997  hypothetical protein  82.22 
 
 		 252 bp  95.6  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2851  hypothetical protein  92.42 
 
 		 1965 bp  91.7  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31060  hypothetical protein  88.37 
 
 		 618 bp  91.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000454841  unclonable  1.93653e-22 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0516  hypothetical protein  82.47 
 
 		 1764 bp  91.7  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4183    84.03 
 
 		 138 bp  85.7  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.34276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0816  hypothetical protein  95.65 
 
 		 1812 bp  75.8  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1741  hypothetical protein  92.31 
 
 		 1755 bp  71.9  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.739176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3192  hypothetical protein  93.48 
 
 		 1740 bp  67.9  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.440164  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3187  hypothetical protein  95.12 
 
 		 1794 bp  65.9  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2091  hypothetical protein  79.88 
 
 		 1713 bp  63.9  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1026  hypothetical protein  89.29 
 
 		 1755 bp  63.9  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.922244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1197  hypothetical protein  91.49 
 
 		 1740 bp  61.9  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3538  hypothetical protein  91.49 
 
 		 1740 bp  61.9  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0752  hypothetical protein  90 
 
 		 1878 bp  60  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2619  hypothetical protein  86.36 
 
 		 1746 bp  60  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4008  hypothetical protein  89.8 
 
 		 1740 bp  58  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0139  hypothetical protein  92.68 
 
 		 1737 bp  58  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0702  hypothetical protein  100 
 
 		 1740 bp  58  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2252  hypothetical protein  89.8 
 
 		 1722 bp  58  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.260313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7437  hypothetical protein  88.46 
 
 		 1752 bp  56  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.879522 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0975  hypothetical protein  87.5 
 
 		 1740 bp  56  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3083  hypothetical protein  88.46 
 
 		 1740 bp  56  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3848  hypothetical protein  96.77 
 
 		 1764 bp  54  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0201094  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2017  hypothetical protein  85.71 
 
 		 1989 bp  54  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.985162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3904  hypothetical protein  96.77 
 
 		 1752 bp  54  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2806  hypothetical protein  96.67 
 
 		 1740 bp  52  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3523  hypothetical protein  86.21 
 
 		 2085 bp  52  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323115 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0359  hypothetical protein  92.11 
 
 		 1740 bp  52  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1492  hypothetical protein  92.11 
 
 		 1728 bp  52  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0742429  normal  0.420716 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2875  hypothetical protein  96.55 
 
 		 1764 bp  50.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3377  hypothetical protein  90.24 
 
 		 1740 bp  50.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115578  normal  0.258124 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3824  hypothetical protein  88.64 
 
 		 1740 bp  48.1  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3688  Type IV secretory pathway VirD2 components (relaxase)-like protein  90 
 
 		 1812 bp  48.1  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1376  hypothetical protein  100 
 
 		 1221 bp  48.1  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.379564  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>