More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1082 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1521  heavy metal translocating P-type ATPase  70.37 
 
 
830 aa  969    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0875658  normal  0.721674 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  54.18 
 
 
765 aa  674    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1172  heavy metal translocating P-type ATPase  72.37 
 
 
817 aa  977    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1082  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
813 aa  1606    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1927  heavy metal translocating P-type ATPase  65.17 
 
 
795 aa  880    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4307  heavy metal translocating P-type ATPase  59.13 
 
 
760 aa  761    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.127036  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0998  heavy metal translocating P-type ATPase  97.63 
 
 
802 aa  1475    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3784  heavy metal translocating P-type ATPase  65.57 
 
 
775 aa  917    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0161451  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2773  heavy metal translocating P-type ATPase  69.86 
 
 
824 aa  993    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2816  heavy metal translocating P-type ATPase  61.64 
 
 
777 aa  818    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102701  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2781  heavy metal translocating P-type ATPase  50.79 
 
 
805 aa  611  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000811697 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0711  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  43.81 
 
 
812 aa  560  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.139476  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  44.23 
 
 
839 aa  527  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3783  copper-translocating P-type ATPase  40.91 
 
 
811 aa  490  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413939  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44440  putative cation-transporting P-type ATPase  40.66 
 
 
811 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.838322  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  41.11 
 
 
838 aa  482  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  41.16 
 
 
846 aa  479  1e-134  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4261  heavy metal translocating P-type ATPase  41.38 
 
 
882 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1195  heavy metal translocating P-type ATPase  42.59 
 
 
847 aa  477  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2044  heavy metal translocating P-type ATPase  41.87 
 
 
834 aa  478  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000418772  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1607  heavy metal translocating P-type ATPase  41.13 
 
 
824 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183906  normal  0.0233029 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3826  heavy metal translocating P-type ATPase  40.88 
 
 
824 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  36.05 
 
 
794 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1274  cation-transporting ATPase lipoprotein transmembrane  42.91 
 
 
851 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1102  heavy metal translocating P-type ATPase  42.32 
 
 
847 aa  469  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165186  normal  0.905045 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19950  Copper-translocating P-type ATPase  42.24 
 
 
800 aa  465  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677512  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  35.79 
 
 
807 aa  464  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  41.32 
 
 
802 aa  464  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.116821  normal  0.696286 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3579  heavy metal translocating P-type ATPase  40.89 
 
 
814 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  37.47 
 
 
815 aa  461  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0635  heavy metal translocating P-type ATPase  38.95 
 
 
806 aa  457  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1875  heavy metal translocating P-type ATPase  38.83 
 
 
826 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.796141 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1996  copper-translocating P-type ATPase  40.34 
 
 
823 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369514  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  35.74 
 
 
803 aa  450  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2206  heavy metal translocating P-type ATPase  35.42 
 
 
799 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.107808  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  35.76 
 
 
795 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2416  cation transport ATPase  37.76 
 
 
794 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4492  hypothetical protein  35.42 
 
 
799 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3421  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  40.68 
 
 
824 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0860043 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2043  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  42.34 
 
 
849 aa  446  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138758  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1816  copper-translocating P-type ATPase  41.36 
 
 
816 aa  443  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1846  heavy metal translocating P-type ATPase  35.43 
 
 
813 aa  443  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.418126  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  35.28 
 
 
799 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000412933  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  35.61 
 
 
803 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2015  heavy metal translocating P-type ATPase  35.64 
 
 
797 aa  443  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.467794  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2216  heavy metal translocating P-type ATPase  36.29 
 
 
792 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  34.97 
 
 
803 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1568  putative cation-transporting ATPase  34.66 
 
 
791 aa  437  1e-121  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.758768  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003472  copper-translocating P-type ATPase  36.07 
 
 
787 aa  437  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154282  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  34.77 
 
 
799 aa  438  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  35.19 
 
 
799 aa  434  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02298  cation transport ATPase  35.96 
 
 
787 aa  429  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2165  heavy metal translocating P-type ATPase  35.42 
 
 
799 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0742745  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1990  copper-translocating P-type ATPase  32.89 
 
 
820 aa  429  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2215  heavy metal translocating P-type ATPase  35.14 
 
 
799 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.948139  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2046  heavy metal translocating P-type ATPase  40.85 
 
 
861 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504527  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2420  heavy metal translocating P-type ATPase  35.6 
 
 
792 aa  427  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000019165  hitchhiker  0.00000435833 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1048  cation transporter E1-E2 family ATPase  35.52 
 
 
790 aa  424  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.582758  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2068  heavy metal translocating P-type ATPase  35.68 
 
 
791 aa  424  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  36.93 
 
 
819 aa  422  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.439106  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  33.61 
 
 
802 aa  419  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701132  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0451  heavy metal translocating P-type ATPase  36.82 
 
 
811 aa  409  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0831309  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02060  copper-translocating P-type ATPase  33.11 
 
 
796 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.600497  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1526  heavy metal translocating P-type ATPase  38.19 
 
 
738 aa  404  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1365  heavy metal translocating P-type ATPase  35.72 
 
 
810 aa  402  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.576345 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  36.44 
 
 
818 aa  391  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  32.51 
 
 
828 aa  382  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0011  heavy metal translocating P-type ATPase  36.84 
 
 
731 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.399414  normal  0.898775 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0014  copper-translocating P-type ATPase  36.5 
 
 
732 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.190643  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0465  heavy metal translocating P-type ATPase  37.7 
 
 
743 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0752433  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0736  copper-translocating P-type ATPase  36.07 
 
 
731 aa  372  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3046  heavy metal translocating P-type ATPase  35.66 
 
 
806 aa  372  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  35.16 
 
 
806 aa  369  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0009  copper-translocating P-type ATPase  34.2 
 
 
735 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3324  copper-translocating P-type ATPase  38.83 
 
 
809 aa  364  3e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1116  copper-translocating P-type ATPase  28.42 
 
 
793 aa  363  7.0000000000000005e-99  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0576  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  30.63 
 
 
817 aa  360  5e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.176053  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4956  heavy metal translocating P-type ATPase  35 
 
 
761 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00130227  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1155  heavy metal translocating P-type ATPase  34.9 
 
 
728 aa  358  1.9999999999999998e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.302273  normal  0.0837932 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1842  heavy metal translocating P-type ATPase  37.73 
 
 
732 aa  357  3.9999999999999996e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21425  normal  0.57874 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1420  copper-translocating P-type ATPase  30.94 
 
 
789 aa  357  5.999999999999999e-97  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  29.87 
 
 
805 aa  355  1e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2538  heavy metal translocating P-type ATPase  37.33 
 
 
727 aa  355  2e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5929  copper-translocating P-type ATPase  34.19 
 
 
757 aa  352  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.711138 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0540  heavy metal translocating P-type ATPase  36.83 
 
 
737 aa  352  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2797  nitrogen fixation protein fixI  34.83 
 
 
733 aa  353  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350165  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1819  heavy metal translocating P-type ATPase  29.48 
 
 
806 aa  352  2e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543484  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0690  copper-translocating P-type ATPase, RdxI  38.33 
 
 
737 aa  352  2e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247145  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  30.2 
 
 
797 aa  352  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1177  copper-translocating P-type ATPase  34.77 
 
 
807 aa  352  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0267  copper-translocating P-type ATPase  31.1 
 
 
797 aa  350  6e-95  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.594062  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2345  heavy metal translocating P-type ATPase  37.15 
 
 
737 aa  350  6e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289685  normal  0.231434 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5022  heavy metal translocating P-type ATPase  34.82 
 
 
762 aa  348  3e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29502  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2393  nitrogen fixation protein FixI  33.87 
 
 
787 aa  348  3e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  30.31 
 
 
806 aa  348  3e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1796  heavy metal translocating P-type ATPase  35.27 
 
 
724 aa  347  6e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  29.62 
 
 
805 aa  347  7e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  29.62 
 
 
805 aa  347  7e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  29.62 
 
 
805 aa  345  1e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1576  heavy metal translocating P-type ATPase  31.66 
 
 
807 aa  345  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>