More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1687 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1687  Methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 
296 aa  567  1e-160  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2442  methionyl-tRNA formyltransferase  35.95 
 
 
316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0870633  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0236  methionyl-tRNA formyltransferase  32.3 
 
 
303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  31.76 
 
 
307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1719  methionyl-tRNA formyltransferase  36.36 
 
 
311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296625  hitchhiker  0.00236307 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0854  methionyl-tRNA formyltransferase  34.5 
 
 
311 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0108509  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3000  methionyl-tRNA formyltransferase  35.29 
 
 
308 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0437614  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2825  methionyl-tRNA formyltransferase  35.6 
 
 
309 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.612911  normal  0.129861 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1231  methionyl-tRNA formyltransferase  28.15 
 
 
314 aa  123  4e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000178496  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2984  methionyl-tRNA formyltransferase  34.81 
 
 
306 aa  122  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1665  methionyl-tRNA formyltransferase  34.77 
 
 
306 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000612853 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3190  methionyl-tRNA formyltransferase  34.25 
 
 
337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000305844  normal  0.338989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1368  methionyl-tRNA formyltransferase  36.33 
 
 
309 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0580352 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1855  methionyl-tRNA formyltransferase  36.48 
 
 
319 aa  118  9e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.411821 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0867  methionyl-tRNA formyltransferase  32.45 
 
 
306 aa  118  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.049042  normal  0.204791 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5224  methionyl-tRNA formyltransferase  34.75 
 
 
310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.373009  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09900  methionyl-tRNA formyltransferase  34.52 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154618 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  30.13 
 
 
314 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  38.12 
 
 
308 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15680  methionyl-tRNA formyltransferase  37.5 
 
 
307 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.153254  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  28.62 
 
 
311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1671  methionyl-tRNA formyltransferase  35.62 
 
 
306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.563662  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  33.77 
 
 
308 aa  116  5e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1334  methionyl-tRNA formyltransferase  27.96 
 
 
313 aa  116  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0783821  normal  0.599523 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  34.11 
 
 
308 aa  115  7.999999999999999e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  34.74 
 
 
310 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4832  methionyl-tRNA formyltransferase  33.22 
 
 
306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000322713  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  29.8 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  29.8 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  29.8 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0446  methionyl-tRNA formyltransferase  34.32 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0897  methionyl-tRNA formyltransferase  30.94 
 
 
303 aa  114  3e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3119  methionyl-tRNA formyltransferase  35.67 
 
 
309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1075  methionyl-tRNA formyltransferase  34.44 
 
 
310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0107606  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2894  methionyl-tRNA formyltransferase  35.14 
 
 
301 aa  113  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  34.2 
 
 
302 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  29.26 
 
 
313 aa  112  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.691189  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2575  methionyl-tRNA formyltransferase  33.55 
 
 
308 aa  112  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0532653 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  30.79 
 
 
315 aa  113  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0205  methionyl-tRNA formyltransferase  30.55 
 
 
303 aa  112  6e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0761  methionyl-tRNA formyltransferase  28.09 
 
 
314 aa  112  6e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000194014 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  27.18 
 
 
310 aa  112  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0040  methionyl-tRNA formyltransferase  29.87 
 
 
317 aa  112  8.000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  33.33 
 
 
310 aa  112  8.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  30.41 
 
 
320 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  29.8 
 
 
315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0597  methionyl-tRNA formyltransferase  34.08 
 
 
309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.411489  normal  0.365023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3099  methionyl-tRNA formyltransferase  33.75 
 
 
315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2048  methionyl-tRNA formyltransferase  35.6 
 
 
311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0469723 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0907  methionyl-tRNA formyltransferase  31.53 
 
 
310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000822843  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07970  methionyl-tRNA formyltransferase  32.46 
 
 
317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.844993  normal  0.152933 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1712  methionyl-tRNA formyltransferase  33.33 
 
 
318 aa  110  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  34.42 
 
 
310 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0148  methionyl-tRNA formyltransferase  34.11 
 
 
305 aa  109  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.576123 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  33.55 
 
 
297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  30.29 
 
 
315 aa  109  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  30.13 
 
 
315 aa  109  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  33.55 
 
 
302 aa  109  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1599  methionyl-tRNA formyltransferase  37.55 
 
 
309 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0493449 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0409  methionyl-tRNA formyltransferase  32.89 
 
 
313 aa  108  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3790  methionyl-tRNA formyltransferase  30.46 
 
 
315 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.243321  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1278  methionyl-tRNA formyltransferase  33.23 
 
 
324 aa  108  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0156282  normal  0.148843 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1313  methionyl-tRNA formyltransferase  34.08 
 
 
311 aa  107  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.141722 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18090  methionyl-tRNA formyltransferase  34.64 
 
 
315 aa  108  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.783991  normal  0.456867 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  33.22 
 
 
302 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  29.14 
 
 
313 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1320  methionyl-tRNA formyltransferase  30.23 
 
 
309 aa  107  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10481  putative methionyl-tRNA formyltransferase  28.21 
 
 
336 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.360492  hitchhiker  0.00290754 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1869  methionyl-tRNA formyltransferase  33.44 
 
 
308 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.573172 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6485  methionyl-tRNA formyltransferase  29.71 
 
 
315 aa  106  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.53373  normal  0.520037 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  30.56 
 
 
301 aa  106  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  29.47 
 
 
315 aa  106  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4156  methionyl-tRNA formyltransferase  32.89 
 
 
307 aa  106  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.413206  hitchhiker  0.00887894 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  29.8 
 
 
315 aa  105  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  29.8 
 
 
315 aa  105  7e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1321  methionyl-tRNA formyltransferase  32.69 
 
 
314 aa  105  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  29.8 
 
 
315 aa  105  7e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  29.8 
 
 
315 aa  105  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  29.8 
 
 
315 aa  105  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  29.8 
 
 
315 aa  105  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1862  methionyl-tRNA formyltransferase  33.22 
 
 
308 aa  105  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16130  methionyl-tRNA formyltransferase  31.41 
 
 
317 aa  105  8e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.452628  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  28.85 
 
 
326 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  29.8 
 
 
315 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0164  methionyl-tRNA formyltransferase  33.78 
 
 
313 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534579  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  30.26 
 
 
307 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3583  methionyl-tRNA formyltransferase  29.8 
 
 
315 aa  104  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal  0.0987748 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  33.55 
 
 
311 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3676  methionyl-tRNA formyltransferase  29.24 
 
 
315 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3603  methionyl-tRNA formyltransferase  29.24 
 
 
315 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109792  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3711  methionyl-tRNA formyltransferase  29.24 
 
 
315 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.734888  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1412  methionyl-tRNA formyltransferase  26.58 
 
 
302 aa  103  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3604  methionyl-tRNA formyltransferase  29.24 
 
 
315 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  31.67 
 
 
318 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0541  methionyl-tRNA formyltransferase  31.19 
 
 
320 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.743734  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3774  methionyl-tRNA formyltransferase  29.47 
 
 
315 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  30.82 
 
 
314 aa  102  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0055  methionyl-tRNA formyltransferase  31.37 
 
 
311 aa  102  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000555853 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2424  methionyl-tRNA formyltransferase  34.85 
 
 
308 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0902213  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2430  methionyl-tRNA formyltransferase  34.85 
 
 
308 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal  0.290903 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>