More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0897 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007799  ECH_0897  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 
303 aa  622  1e-177  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0205  methionyl-tRNA formyltransferase  80.53 
 
 
303 aa  513  1e-144  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0866  methionyl-tRNA formyltransferase  54.7 
 
 
299 aa  320  1.9999999999999998e-86  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  43.85 
 
 
312 aa  240  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2577  methionyl-tRNA formyltransferase  41.64 
 
 
308 aa  238  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  hitchhiker  0.000000800769 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2894  methionyl-tRNA formyltransferase  39.34 
 
 
301 aa  233  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0192  methionyl-tRNA formyltransferase  41.48 
 
 
312 aa  232  7.000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0469  methionyl-tRNA formyltransferase  41.83 
 
 
301 aa  230  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  41.58 
 
 
315 aa  230  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0410  methionyl-tRNA formyltransferase  40.92 
 
 
301 aa  229  4e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  40.98 
 
 
314 aa  229  5e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  40.98 
 
 
314 aa  229  5e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2535  methionyl-tRNA formyltransferase  40.98 
 
 
302 aa  226  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.614949  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0875  methionyl-tRNA formyltransferase  40.33 
 
 
302 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0151  methionyl-tRNA formyltransferase  40.07 
 
 
302 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.338305  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0042  methionyl-tRNA formyltransferase  40.92 
 
 
311 aa  225  7e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1755  methionyl-tRNA formyltransferase  40.19 
 
 
310 aa  224  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0249  methionyl-tRNA formyltransferase  38.56 
 
 
306 aa  222  6e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.153512 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2844  methionyl-tRNA formyltransferase  39.3 
 
 
308 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0642  methionyl-tRNA formyltransferase  39.93 
 
 
297 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.183207  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0635  methionyl-tRNA formyltransferase  38.26 
 
 
318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157901  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  40.52 
 
 
318 aa  219  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4042  methionyl-tRNA formyltransferase  40.2 
 
 
308 aa  219  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  41.18 
 
 
320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0649  methionyl-tRNA formyltransferase  37.62 
 
 
318 aa  219  6e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95229e-24 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7336  methionyl-tRNA formyltransferase  38.96 
 
 
311 aa  218  7.999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.685492  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0347  methionyl-tRNA formyltransferase  38.74 
 
 
305 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.342124  normal  0.0280325 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1345  methionyl-tRNA formyltransferase  38.51 
 
 
306 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  40.07 
 
 
321 aa  217  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3304  methionyl-tRNA formyltransferase  38.36 
 
 
307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607232  normal  0.664052 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  39.6 
 
 
318 aa  216  5e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  41.23 
 
 
309 aa  216  5e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1034  methionyl-tRNA formyltransferase  38.19 
 
 
306 aa  215  5.9999999999999996e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.79271  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1320  methionyl-tRNA formyltransferase  39.61 
 
 
309 aa  215  7e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0975  methionyl-tRNA formyltransferase  38.19 
 
 
306 aa  215  8e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.569216  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  39.53 
 
 
318 aa  215  9e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0819  methionyl-tRNA formyltransferase  38.91 
 
 
313 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  39.67 
 
 
318 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  39.53 
 
 
318 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109779 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0497  methionyl-tRNA formyltransferase  39.03 
 
 
317 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12463  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  39.2 
 
 
318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000188499 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0028  methionyl-tRNA formyltransferase  39.87 
 
 
318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.709441  hitchhiker  0.00475764 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0262  methionyl-tRNA formyltransferase  39.48 
 
 
310 aa  212  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0026  methionyl-tRNA formyltransferase  39.53 
 
 
318 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4748  methionyl-tRNA formyltransferase  35.37 
 
 
310 aa  210  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130868  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  39.53 
 
 
318 aa  210  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000257015 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  36.98 
 
 
311 aa  209  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  38.61 
 
 
318 aa  209  5e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0959  methionyl-tRNA formyltransferase  39.94 
 
 
328 aa  208  7e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.500083  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  39.33 
 
 
315 aa  208  9e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0031  methionyl-tRNA formyltransferase  38.87 
 
 
318 aa  208  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3737  methionyl-tRNA formyltransferase  37.42 
 
 
324 aa  208  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219855 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  40.53 
 
 
329 aa  208  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0355  methionyl-tRNA formyltransferase  39.74 
 
 
313 aa  208  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.36252  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1129  methionyl-tRNA formyltransferase  37.13 
 
 
312 aa  207  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158103 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3351  methionyl-tRNA formyltransferase  38.94 
 
 
309 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  36.67 
 
 
348 aa  206  3e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.596014  normal  0.0248257 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2474  methionyl-tRNA formyltransferase  38.03 
 
 
315 aa  206  3e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0626  methionyl-tRNA formyltransferase  37.34 
 
 
310 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.274146  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0023  methionyl-tRNA formyltransferase  38.41 
 
 
319 aa  206  4e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0541  methionyl-tRNA formyltransferase  36.86 
 
 
320 aa  206  6e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.743734  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0080  methionyl-tRNA formyltransferase  36.13 
 
 
310 aa  205  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.450016  normal  0.0632026 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002056  methionyl-tRNA formyltransferase  38.41 
 
 
315 aa  205  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0438  methionyl-tRNA formyltransferase  39.93 
 
 
313 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3969  methionyl-tRNA formyltransferase  39.4 
 
 
315 aa  203  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.483115  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10271  putative methionyl-tRNA formyltransferase  39.12 
 
 
346 aa  203  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.360927  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1642  methionyl-tRNA formyltransferase  39.07 
 
 
312 aa  202  5e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1386  methionyl-tRNA formyltransferase  40.4 
 
 
315 aa  202  5e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.442669  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0181  methionyl-tRNA formyltransferase  38.87 
 
 
299 aa  202  7e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142178  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1524  methionyl-tRNA formyltransferase  38.74 
 
 
320 aa  201  9e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3883  methionyl-tRNA formyltransferase  38.08 
 
 
315 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00162165  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0315  methionyl-tRNA formyltransferase  38.08 
 
 
315 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0943  methionyl-tRNA formyltransferase  38.49 
 
 
326 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0614  methionyl-tRNA formyltransferase  38.08 
 
 
315 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00549944  normal  0.0281332 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3584  methionyl-tRNA formyltransferase  39.27 
 
 
307 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4239  methionyl-tRNA formyltransferase  34.73 
 
 
310 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  decreased coverage  0.00163892 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0831  methionyl-tRNA formyltransferase  36.99 
 
 
327 aa  199  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0674  methionyl-tRNA formyltransferase  35.71 
 
 
312 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3147  methionyl-tRNA formyltransferase  33.97 
 
 
313 aa  199  7e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  0.377579 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10281  putative methionyl-tRNA formyltransferase  36.79 
 
 
328 aa  198  7.999999999999999e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.477504  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03138  methionyl-tRNA formyltransferase  38.41 
 
 
315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.511897  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  38.41 
 
 
315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03089  hypothetical protein  38.41 
 
 
315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4512  methionyl-tRNA formyltransferase  37.09 
 
 
314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.017466  hitchhiker  0.000185831 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0426  methionyl-tRNA formyltransferase  38.41 
 
 
315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3481  methionyl-tRNA formyltransferase  38.41 
 
 
315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000745387  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3770  methionyl-tRNA formyltransferase  38.74 
 
 
315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0147386  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3852  methionyl-tRNA formyltransferase  35.26 
 
 
320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0055  methionyl-tRNA formyltransferase  36.01 
 
 
311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000555853 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0864  methionyl-tRNA formyltransferase  39.81 
 
 
311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000069502  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3177  methionyl-tRNA formyltransferase  39.3 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000345004  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3672  methionyl-tRNA formyltransferase  38.41 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2868  methionyl-tRNA formyltransferase  37.38 
 
 
325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2322  methionyl-tRNA formyltransferase  37.05 
 
 
310 aa  196  3e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103056  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2084  methionyl-tRNA formyltransferase  38.24 
 
 
311 aa  197  3e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.198796  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3719  methionyl-tRNA formyltransferase  38.08 
 
 
315 aa  197  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.236435  hitchhiker  0.00730816 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1063  methionyl-tRNA formyltransferase  38.82 
 
 
318 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4610  methionyl-tRNA formyltransferase  38.08 
 
 
315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267184  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1592  methionyl-tRNA formyltransferase  36.13 
 
 
359 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2139  methionyl-tRNA formyltransferase  34.85 
 
 
361 aa  195  6e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00931795 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>