More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1681 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1681  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 291 aa  566  1e-160  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0185751  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2993  ATP phosphoribosyltransferase  58.62 
 
 		 291 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0837667  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1270  ATP phosphoribosyltransferase  60 
 
 		 291 aa  351  8e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.236891  normal  0.407177 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0080  ATP phosphoribosyltransferase  51.89 
 
 		 290 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0134  ATP phosphoribosyltransferase  49.83 
 
 		 290 aa  293  3e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2370  ATP phosphoribosyltransferase  48.97 
 
 		 290 aa  287  2e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2050  ATP phosphoribosyltransferase  46.55 
 
 		 290 aa  286  4e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.267416  normal  0.100259 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2063  ATP phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 290 aa  253  3e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3596  ATP phosphoribosyltransferase  46.58 
 
 		 289 aa  246  3e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0083  ATP phosphoribosyltransferase  45.17 
 
 		 289 aa  245  6e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.156056  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1963  ATP phosphoribosyltransferase  47.08 
 
 		 293 aa  241  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1052  ATP phosphoribosyltransferase  45.39 
 
 		 310 aa  237  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1119  ATP phosphoribosyltransferase  45.02 
 
 		 291 aa  237  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000258955  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3087  ATP phosphoribosyltransferase  44.48 
 
 		 293 aa  236  3e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0727  ATP phosphoribosyltransferase  44.83 
 
 		 290 aa  236  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2849  ATP phosphoribosyltransferase  47.59 
 
 		 293 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3242  ATP phosphoribosyltransferase  43.99 
 
 		 291 aa  235  7e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.35576  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0740  ATP phosphoribosyltransferase  44.48 
 
 		 290 aa  234  9e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584705 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1530  ATP phosphoribosyltransferase  45.7 
 
 		 291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2223  ATP phosphoribosyltransferase  44.83 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1107  ATP phosphoribosyltransferase  44.64 
 
 		 291 aa  234  2.0000000000000002e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0211  ATP phosphoribosyltransferase  43.45 
 
 		 294 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1995  ATP phosphoribosyltransferase  44.14 
 
 		 294 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.670162 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2357  ATP phosphoribosyltransferase  43.79 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0371  ATP phosphoribosyltransferase  43.45 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0258558  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3566  ATP phosphoribosyltransferase  46.74 
 
 		 294 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.393161  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2169  ATP phosphoribosyltransferase  43.1 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2945  ATP phosphoribosyltransferase  43.99 
 
 		 291 aa  229  4e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0241  ATP phosphoribosyltransferase  43.79 
 
 		 294 aa  228  9e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2856  ATP phosphoribosyltransferase  44.21 
 
 		 286 aa  228  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245977  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2331  ATP phosphoribosyltransferase  43.45 
 
 		 291 aa  226  4e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.827624  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4055  ATP phosphoribosyltransferase  44.06 
 
 		 290 aa  222  4.9999999999999996e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1898  ATP phosphoribosyltransferase  42.96 
 
 		 291 aa  222  6e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.186311  hitchhiker  0.0000000000000260531 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0360  ATP phosphoribosyltransferase  46.42 
 
 		 297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.50846  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3194  ATP phosphoribosyltransferase  44.18 
 
 		 293 aa  215  8e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.381071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3682  ATP phosphoribosyltransferase  43.94 
 
 		 289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1118  ATP phosphoribosyltransferase  43.64 
 
 		 291 aa  209  4e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.914307  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2245  ATP phosphoribosyltransferase  42.61 
 
 		 293 aa  205  6e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.361464 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1559  ATP phosphoribosyltransferase  33.66 
 
 		 325 aa  175  8e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  36.95 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  36.73 
 
 		 285 aa  152  5.9999999999999996e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  33.9 
 
 		 286 aa  149  4e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  36.61 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  35.49 
 
 		 300 aa  146  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  34.35 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  35.96 
 
 		 282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  34.33 
 
 		 289 aa  140  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 282 aa  138  1e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  30.17 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  32.65 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  30.17 
 
 		 288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  33.67 
 
 		 294 aa  136  4e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  35.25 
 
 		 285 aa  136  4e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  32.65 
 
 		 282 aa  136  5e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  35.92 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  29.49 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  29.76 
 
 		 306 aa  133  3e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  34.54 
 
 		 294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  33.88 
 
 		 283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  35.37 
 
 		 284 aa  129  8.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  35.54 
 
 		 292 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  29.83 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1873  ATP phosphoribosyltransferase  35.44 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.840084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1880  ATP phosphoribosyltransferase  34.74 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0409345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  31.85 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22170  ATP phosphoribosyltransferase  34.97 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  30.24 
 
 		 283 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1863  ATP phosphoribosyltransferase  33.45 
 
 		 282 aa  115  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0883845  normal  0.37135 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16070  ATP phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 		 285 aa  112  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0777175  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2150  ATP phosphoribosyltransferase  32.04 
 
 		 281 aa  112  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5977  ATP phosphoribosyltransferase  33.22 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12153  ATP phosphoribosyltransferase  31.34 
 
 		 284 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.905981 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  27.8 
 
 		 295 aa  109  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  34.83 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0174  ATP phosphoribosyltransferase  33.92 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  32.26 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2454  ATP phosphoribosyltransferase  31.16 
 
 		 281 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2975  ATP phosphoribosyltransferase  32.63 
 
 		 285 aa  106  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.346599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2979  ATP phosphoribosyltransferase  33.92 
 
 		 281 aa  105  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000719126  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  32.89 
 
 		 296 aa  105  8e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2452  ATP phosphoribosyltransferase  31.71 
 
 		 287 aa  105  9e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0478  ATP phosphoribosyltransferase  31.36 
 
 		 283 aa  105  9e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.843231  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3470  ATP phosphoribosyltransferase  31.69 
 
 		 288 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2286  ATP phosphoribosyltransferase  32.75 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.542261  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2054  ATP phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 		 280 aa  103  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1585  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0295  ATP phosphoribosyltransferase  32.04 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.685586 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1731  ATP phosphoribosyltransferase  33.1 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0959672  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  32.63 
 
 		 284 aa  103  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4316  ATP phosphoribosyltransferase  32.87 
 
 		 283 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  32.75 
 
 		 286 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  28.01 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  29.21 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000250468 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18190  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  31.23 
 
 		 282 aa  100  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67165  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase) (ATP-PRT)  27.63 
 
 		 304 aa  99.8  5e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1963  ATP phosphoribosyltransferase  31.69 
 
 		 281 aa  99.4  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3112  ATP phosphoribosyltransferase  32.29 
 
 		 287 aa  99  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 		 286 aa  99  8e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  29.32 
 
 		 287 aa  99  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  27.4 
 
 		 285 aa  98.6  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3145  ATP phosphoribosyltransferase  29.93 
 
 		 283 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.451447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>