More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0058 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0058  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 458 aa  914    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00215813  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2173  transcription termination factor Rho  69.2 
 
 		 492 aa  633  1e-180  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0059  transcription termination factor Rho  71.3 
 
 		 436 aa  616  1e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.121136  hitchhiker  0.0035916 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3174  transcription termination factor Rho  68.91 
 
 		 450 aa  591  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000371975  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2408  transcription termination factor Rho  64.73 
 
 		 425 aa  558  1e-157  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000414081  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2402  transcription termination factor Rho  67.51 
 
 		 429 aa  542  1e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18010  transcription termination factor Rho  61.63 
 
 		 418 aa  528  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155456  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  60.69 
 
 		 415 aa  526  1e-148  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2875  transcription termination factor Rho  60.19 
 
 		 414 aa  525  1e-148  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000596182  hitchhiker  0.0000000051711 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3439  transcription termination factor Rho  62.87 
 
 		 424 aa  522  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3329  transcription termination factor Rho  63.7 
 
 		 424 aa  520  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000488877  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1711  transcription termination factor Rho  59.53 
 
 		 437 aa  515  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000145962  normal  0.971448 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5510  transcription termination factor Rho  62.44 
 
 		 423 aa  513  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000155234  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5460  transcription termination factor Rho  62.44 
 
 		 423 aa  513  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000364812  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5130  transcription termination factor Rho  62.44 
 
 		 423 aa  513  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000119523  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5181  transcription termination factor Rho  62.21 
 
 		 423 aa  511  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5016  transcription termination factor Rho  62.44 
 
 		 423 aa  513  1e-144  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.88034e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5032  transcription termination factor Rho  62.44 
 
 		 423 aa  513  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00629962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5455  transcription termination factor Rho  62.44 
 
 		 423 aa  514  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000522794  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3853  transcription termination factor Rho  62.67 
 
 		 423 aa  513  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000371532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5575  transcription termination factor Rho  62.21 
 
 		 423 aa  511  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000155129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5497  transcription termination factor Rho  62.44 
 
 		 423 aa  514  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000613532  unclonable  1.32525e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5424  transcription termination factor Rho  62.44 
 
 		 423 aa  513  1e-144  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.80667e-59 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2782  transcription termination factor Rho  60.75 
 
 		 434 aa  512  1e-144  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000423025  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2174  transcription termination factor Rho  63.52 
 
 		 653 aa  508  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000672374  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  58.22 
 
 		 415 aa  505  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1756  transcription termination factor Rho  59.26 
 
 		 429 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.147978  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  58.14 
 
 		 415 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2309  transcription termination factor Rho  68.44 
 
 		 518 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0139277  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  58.14 
 
 		 415 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3108  transcription termination factor Rho  57.91 
 
 		 415 aa  501  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  57.91 
 
 		 415 aa  502  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4065  transcription termination factor Rho  58.37 
 
 		 415 aa  504  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000187673  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0323  transcription termination factor Rho  58.49 
 
 		 429 aa  503  1e-141  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0180092  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  58.14 
 
 		 415 aa  503  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0393  transcription termination factor Rho  58.49 
 
 		 429 aa  503  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.023811  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1260  transcription termination factor Rho  57.6 
 
 		 422 aa  500  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2064  transcription termination factor Rho  57.74 
 
 		 421 aa  499  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244754  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3627  transcription termination factor Rho  57.77 
 
 		 420 aa  499  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.2483  normal  0.795626 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0391  transcription termination factor Rho  58.33 
 
 		 429 aa  498  1e-140  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000575661  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0459  transcription termination factor Rho  58.26 
 
 		 429 aa  499  1e-140  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0376  transcription termination factor Rho  58.14 
 
 		 415 aa  501  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000395561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0843  transcription termination factor Rho  58.47 
 
 		 415 aa  498  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000858809  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0856  transcription termination factor Rho  57.74 
 
 		 421 aa  500  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.447055  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1824  transcription termination factor Rho  58.76 
 
 		 422 aa  500  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3376  transcription termination factor Rho  62.72 
 
 		 690 aa  498  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000138614  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1984  transcription termination factor Rho  57.74 
 
 		 418 aa  499  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0424  transcription termination factor Rho  57.11 
 
 		 429 aa  495  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00623615  normal  0.0254414 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1842  transcription termination factor Rho  57.41 
 
 		 447 aa  494  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205012  normal  0.660399 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0163  transcription termination factor Rho  57.99 
 
 		 421 aa  496  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.386148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4288  transcription termination factor Rho  56.71 
 
 		 428 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0673197 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0427  transcription termination factor Rho  57.8 
 
 		 429 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000196448  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1083  transcription termination factor Rho  57.11 
 
 		 474 aa  491  9.999999999999999e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000288858  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1563  transcription termination factor Rho  57.41 
 
 		 506 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0100  transcription termination factor Rho  57.53 
 
 		 421 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.581004  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0393  transcription termination factor Rho  57.18 
 
 		 421 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3710  transcription termination factor Rho  57.94 
 
 		 445 aa  494  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238599  hitchhiker  0.000000242256 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0428  transcription termination factor Rho  57.31 
 
 		 421 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0108  transcription termination factor Rho  57.87 
 
 		 421 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.411018  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0264  transcription termination factor Rho  67.22 
 
 		 512 aa  493  9.999999999999999e-139  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3474  transcription termination factor Rho  57.14 
 
 		 429 aa  494  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3932  transcription termination factor Rho  56.94 
 
 		 421 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.713144  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0298  transcription termination factor Rho  58.1 
 
 		 421 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4258  transcription termination factor Rho  56.49 
 
 		 421 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.884099 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3206  transcription termination factor Rho  57.18 
 
 		 421 aa  493  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1377  transcription termination factor Rho  57.51 
 
 		 436 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0362049  normal  0.0185592 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1503  transcription termination factor Rho  64.38 
 
 		 548 aa  491  1e-137  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000037905  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4391  transcription termination factor Rho  55.58 
 
 		 421 aa  490  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1339  transcription termination factor Rho  65 
 
 		 642 aa  490  1e-137  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1001  transcription termination factor Rho  57.51 
 
 		 436 aa  491  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0292  transcription termination factor Rho  57.64 
 
 		 421 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0089  transcription termination factor Rho  67.49 
 
 		 508 aa  489  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000346786  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1678  transcription termination factor Rho  56.71 
 
 		 447 aa  489  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0702428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0734  transcription termination factor Rho  56.65 
 
 		 437 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3222  transcription termination factor Rho  57.48 
 
 		 444 aa  487  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.584785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3619  transcription termination factor Rho  57.41 
 
 		 418 aa  487  1e-136  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0009  transcription termination factor Rho  57.41 
 
 		 421 aa  486  1e-136  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000017892  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0137  transcription termination factor Rho  55.96 
 
 		 421 aa  485  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246562  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1728  transcription termination factor Rho  58.33 
 
 		 438 aa  481  1e-135  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00025665  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1226  transcription termination factor Rho  56.04 
 
 		 424 aa  484  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3567  transcription termination factor Rho  57.61 
 
 		 422 aa  482  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235782  normal  0.891828 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2130  transcription termination factor Rho  56.02 
 
 		 503 aa  482  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00148034  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3377  transcription termination factor Rho  55.37 
 
 		 416 aa  482  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000542218  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2157  transcription termination factor Rho  58.28 
 
 		 438 aa  483  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.894966  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2195  transcription termination factor Rho  58.28 
 
 		 438 aa  483  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00569958  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0491  transcription termination factor Rho  57.18 
 
 		 416 aa  484  1e-135  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212536 
 
 
-
 
NC_002620  TC0778  transcription termination factor Rho  56.04 
 
 		 419 aa  478  1e-134  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1968  transcription termination factor Rho  53.67 
 
 		 435 aa  480  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.6615 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0658  transcription termination factor Rho  56.58 
 
 		 418 aa  480  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2668  transcription termination factor Rho  57.27 
 
 		 422 aa  480  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.169241  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0677  transcription termination factor Rho  55.45 
 
 		 415 aa  478  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000284119  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2592  transcription termination factor Rho  55.61 
 
 		 418 aa  480  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00987626  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1231  transcription termination factor Rho  56.81 
 
 		 422 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287939  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5202  transcription termination factor Rho  66.02 
 
 		 602 aa  480  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0690  transcription termination factor Rho  56.45 
 
 		 437 aa  480  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0807  transcription termination factor Rho  56.58 
 
 		 418 aa  480  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3603  transcription termination factor Rho  63.69 
 
 		 573 aa  481  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2835  transcription termination factor Rho  55.1 
 
 		 418 aa  481  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.182498 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1005  transcription termination factor Rho  61.6 
 
 		 576 aa  479  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2892  transcription termination factor Rho  56.81 
 
 		 422 aa  478  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>